154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1416 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1416  LmbE family protein  100 
 
 		 276 aa  563  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  28.57 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  35.51 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10328  hypothetical protein  38.1 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  34.78 
 
 		 231 aa  72  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4036  hypothetical protein  30.6 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  28.02 
 
 		 276 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  31.69 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  27.34 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  34.09 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  25.74 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0630  LmbE family protein  28.21 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  29.63 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2672  LmbE family protein  30.72 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  29.68 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  31.41 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  28.57 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2405  LmbE family protein  31.78 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  32.84 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  29.14 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  28.29 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  26.09 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  29.38 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  31.52 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  28.68 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  31.85 
 
 		 274 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  34.56 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  32.03 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  29.37 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  29.68 
 
 		 295 aa  53.9  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  30 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  30.38 
 
 		 323 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  33.09 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  27.75 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0941  mycothiol conjugate amidase Mca  26.53 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  30.13 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  29.76 
 
 		 306 aa  53.1  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2880  LmbE-like protein  31.15 
 
 		 245 aa  53.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  30.88 
 
 		 193 aa  52.4  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2878  LmbE family protein  28.57 
 
 		 246 aa  52  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  29.49 
 
 		 302 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  28.68 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1904  LmbE family protein  26.67 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  28.39 
 
 		 286 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  31.34 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  31.08 
 
 		 272 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  29.03 
 
 		 282 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11830  uncharacterized LmbE-like protein  32.95 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  28.39 
 
 		 237 aa  50.8  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  28.39 
 
 		 237 aa  50.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3334  hypothetical protein  26.67 
 
 		 930 aa  50.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  27.15 
 
 		 226 aa  50.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  29.19 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  26.32 
 
 		 299 aa  49.7  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2633  mycothiol conjugate amidase Mca  30.06 
 
 		 293 aa  49.7  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342297  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  24.06 
 
 		 294 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  28.48 
 
 		 227 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  28.48 
 
 		 226 aa  49.3  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  28.48 
 
 		 226 aa  49.3  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  30.08 
 
 		 237 aa  49.3  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  27.63 
 
 		 220 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  29.61 
 
 		 227 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  26.8 
 
 		 220 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3241  hypothetical protein  26.8 
 
 		 220 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000243018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3524  hypothetical protein  26.8 
 
 		 220 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123177  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2865  hypothetical protein  32.48 
 
 		 833 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349259 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0942  mycothiol conjugate amidase Mca  27.81 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  25.5 
 
 		 220 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  30.34 
 
 		 359 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  26.85 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1423  LmbE family protein  26.83 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  28.48 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  27.45 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3484  hypothetical protein  26.8 
 
 		 220 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  30.56 
 
 		 463 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1432  LmbE family protein  38.82 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.886775 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  31.39 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  24.5 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  26.97 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  29.08 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  28.77 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  25.83 
 
 		 221 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  25.83 
 
 		 221 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  26.97 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  26.97 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  27.45 
 
 		 220 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  35.34 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2761  LmbE family protein  31.3 
 
 		 228 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.772282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  31.65 
 
 		 245 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  30.37 
 
 		 308 aa  47  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  29.29 
 
 		 244 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1378  LmbE family protein  27.15 
 
 		 811 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.455016 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  30.71 
 
 		 244 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  26.92 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  28.68 
 
 		 264 aa  46.2  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  27.94 
 
 		 254 aa  46.2  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4797  LmbE family protein  32.35 
 
 		 239 aa  45.8  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.861098 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  26.81 
 
 		 259 aa  46.2  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  27.42 
 
 		 287 aa  45.8  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  28.57 
 
 		 284 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.083902 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>