254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0414 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0414  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 330 aa  684    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.910572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1685  hypothetical protein  62.3 
 
 		 314 aa  402  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0732068  normal  0.0666172 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3378  hypothetical protein  57.33 
 
 		 595 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2548  radical SAM domain-containing protein  53.14 
 
 		 328 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0194  radical SAM domain-containing protein  48.12 
 
 		 579 aa  248  9e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.369341  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0146  radical SAM domain-containing protein  35.2 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0792983  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11698  molybdopterin biosynthesis protein moeX  34.38 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.509473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5883  radical SAM domain-containing protein  37.18 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  30.38 
 
 		 1000 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  29.24 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  33.53 
 
 		 375 aa  67  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  33.8 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  30.19 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0941  radical SAM domain-containing protein  28.65 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  26.92 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2457  radical SAM family protein  30.82 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00277932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  30.87 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1566  radical SAM domain-containing protein  32.05 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 1005 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  29.94 
 
 		 390 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  31.54 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  32.61 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  33.8 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  30.87 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  30.32 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  33.33 
 
 		 422 aa  59.7  0.00000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  32.03 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  30.56 
 
 		 800 aa  59.3  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  30.6 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  28.66 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  30.67 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  27.5 
 
 		 501 aa  58.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  28.85 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  29.61 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  28.29 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  26.63 
 
 		 496 aa  57.8  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3799  radical SAM family protein  21.62 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2221  hypothetical protein  27.74 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3861  Radical SAM domain protein  28.02 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  30.94 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  34.25 
 
 		 409 aa  57  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1148  Radical SAM domain protein  33.55 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  23.79 
 
 		 491 aa  57.4  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  32.37 
 
 		 401 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  32.37 
 
 		 401 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  32.37 
 
 		 401 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  29.87 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0073  Radical SAM domain protein  27.71 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  33.09 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  32.88 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  29.59 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1914  Radical SAM domain protein  30.2 
 
 		 376 aa  55.8  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  28.67 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  25.52 
 
 		 368 aa  55.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3047  radical SAM family protein  35.63 
 
 		 153 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  29.76 
 
 		 429 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  28.93 
 
 		 347 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3125  Radical SAM domain protein  33.11 
 
 		 376 aa  54.7  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  28.1 
 
 		 394 aa  54.7  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1160  hypothetical protein  27.54 
 
 		 322 aa  54.3  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13125  predicted protein  27.27 
 
 		 308 aa  54.3  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.005765  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3751  radical SAM domain-containing protein  28.74 
 
 		 337 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  27.74 
 
 		 395 aa  53.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  22.76 
 
 		 427 aa  53.5  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  27.27 
 
 		 479 aa  53.5  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0915  Radical SAM domain protein  28.03 
 
 		 351 aa  53.5  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1779  L-asparaginase II  26.15 
 
 		 317 aa  53.5  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.251936  normal  0.0342174 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  31.43 
 
 		 391 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3569  radical SAM domain-containing protein  28.93 
 
 		 365 aa  53.5  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  28.57 
 
 		 346 aa  53.5  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0956  Radical SAM domain protein  28.74 
 
 		 532 aa  53.5  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000891035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  29.66 
 
 		 317 aa  53.1  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0900  Radical SAM domain protein  26.88 
 
 		 292 aa  53.1  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  26.34 
 
 		 394 aa  53.1  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17970  predicted Fe-S oxidoreductase  30.92 
 
 		 356 aa  53.1  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  28.28 
 
 		 468 aa  53.1  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  29.41 
 
 		 399 aa  52.8  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  26.37 
 
 		 1002 aa  52.8  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  31.61 
 
 		 335 aa  52.8  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  28.39 
 
 		 399 aa  52.8  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1560  radical SAM domain-containing protein  30.32 
 
 		 412 aa  52.8  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0307632  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  31.94 
 
 		 394 aa  52.8  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1925  Radical SAM domain protein  26.97 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1591  hypothetical protein  28.41 
 
 		 344 aa  52  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  26.14 
 
 		 393 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0750  radical SAM domain-containing protein  24.53 
 
 		 319 aa  52.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0829  radical SAM domain-containing protein  26.38 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30480  predicted protein  29.49 
 
 		 358 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2228  Radical SAM domain protein  24.68 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1335  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2560  radical SAM family protein  28.93 
 
 		 369 aa  51.2  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0538253  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  30.37 
 
 		 355 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  29.8 
 
 		 413 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  26.14 
 
 		 393 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  30.14 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5373  Radical SAM domain protein  29.83 
 
 		 327 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  27.08 
 
 		 474 aa  50.8  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1988  radical SAM family protein  25.81 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0266  radical SAM domain-containing protein  26.9 
 
 		 357 aa  51.2  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  32.19 
 
 		 405 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>