More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3275 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3275  NLP/P60 protein  100 
 
 		 181 aa  369  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4966  NLP/P60 protein  43.09 
 
 		 169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2523  NLP/P60 protein  50 
 
 		 189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000113171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1158  NLP/P60 protein  34.46 
 
 		 181 aa  101  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4179  NLP/P60 protein  35.43 
 
 		 168 aa  99.8  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0481386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1426  NLP/P60 protein  35.43 
 
 		 165 aa  98.6  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0751  NLP/P60 protein  38.27 
 
 		 173 aa  95.9  3e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2100  NLP/P60 protein  47.06 
 
 		 302 aa  92.8  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  44.63 
 
 		 424 aa  91.7  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  40.62 
 
 		 370 aa  87.8  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  39.66 
 
 		 223 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  39.66 
 
 		 221 aa  87  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  39.66 
 
 		 221 aa  86.3  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  39.66 
 
 		 234 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  39.66 
 
 		 234 aa  85.9  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  39.66 
 
 		 234 aa  85.9  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  39.66 
 
 		 218 aa  85.5  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  39.66 
 
 		 218 aa  85.5  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  39.66 
 
 		 218 aa  85.5  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  39.66 
 
 		 218 aa  85.5  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  35.62 
 
 		 223 aa  85.1  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  33.99 
 
 		 224 aa  84.7  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  40.52 
 
 		 223 aa  84.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  35.62 
 
 		 223 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  34.93 
 
 		 223 aa  84.7  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  34.93 
 
 		 223 aa  84.7  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 210 aa  84.3  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0021  NLP/P60 protein  35.46 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  34.93 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  38.79 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1746  NLP/P60 protein  33.85 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  35 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2446  NLP/P60 protein  37.67 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  39.55 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0721  NLP/P60 family protein  30.17 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.638789 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  31.82 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  40.32 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  38.35 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  33.75 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  33.11 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  38.28 
 
 		 384 aa  79  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2028  NLP/P60 protein  30.34 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  35.48 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2700  NLP/P60 protein  43.31 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000637216  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  40.32 
 
 		 234 aa  77.4  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  32.65 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  30 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  38.89 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  37.4 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  33.12 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0199  NLP/P60 protein  30.99 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 450 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  38.4 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  32.73 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0781  NLP/P60 protein  42.74 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  37.86 
 
 		 319 aa  75.1  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3653  NLP/P60 protein  34.96 
 
 		 232 aa  74.3  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013969  normal  0.207873 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  36.67 
 
 		 226 aa  74.3  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  33.33 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  37.8 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  36.21 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  36.67 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  37.8 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  31.58 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  37.3 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  32.19 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  32.19 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  35.51 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  36.57 
 
 		 191 aa  72  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  37.21 
 
 		 242 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  36.07 
 
 		 181 aa  72  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04820  hypothetical protein  25.53 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  32.17 
 
 		 327 aa  71.6  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  36.67 
 
 		 285 aa  71.6  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  33.33 
 
 		 365 aa  71.6  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 365 aa  71.6  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  35.88 
 
 		 454 aa  71.6  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2819  NLP/P60 protein  36.09 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1605  NLP/P60 protein  37.69 
 
 		 279 aa  71.2  0.000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1658  hypothetical protein  37.69 
 
 		 287 aa  71.2  0.000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110646  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  35.77 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  31.97 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  31.97 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  31.97 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  31.97 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  31.97 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  31.97 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  32.06 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  31.97 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  36.73 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  30.41 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0670  NLP/P60 protein  32.26 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.160252 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  31.97 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  34.35 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  31.97 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  30.95 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>