More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2655 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2655  regulatory protein LuxR  100 
 
 		 251 aa  513  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.083757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4137  regulatory protein LuxR  56.18 
 
 		 252 aa  294  8e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.272227 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5158  transcriptional regulator, LuxR family  25.33 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00149525  decreased coverage  0.000111139 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2735  response regulator receiver  40.3 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0572845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3040  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0154763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6489  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0173  response regulator receiver protein  45.9 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4502  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.24 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0637  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2103  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2962  response regulator receiver  32.52 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.117851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1440  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1045  regulatory protein LuxR  26.32 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0303042  normal  0.309888 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  32.26 
 
 		 213 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4449  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.26 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3672  transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 90 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.62 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 213 aa  53.1  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.429674  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.03 
 
 		 244 aa  53.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 218 aa  53.1  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4577  response regulator receiver protein  39.62 
 
 		 223 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172592 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1815  two component LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 213 aa  52.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922696  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1772  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 		 262 aa  52.8  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  37.18 
 
 		 213 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1319  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0542522  decreased coverage  0.000972679 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.07 
 
 		 224 aa  52.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1241  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000399601  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3070  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000689776  unclonable  0.00000000000283062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 223 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1285  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000337392  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3241  regulatory protein LuxR  45 
 
 		 263 aa  52.4  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal  0.0480343 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0559  two component LuxR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 211 aa  52.4  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0841173  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6441  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 213 aa  52  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  37.18 
 
 		 213 aa  52  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0080  two component LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 212 aa  52  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2494  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.71 
 
 		 208 aa  52  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.890127  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3175  response regulator receiver protein  49.06 
 
 		 250 aa  52  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000721008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4304  response regulator receiver  32 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.894661  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0287  LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 92 aa  51.6  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_934  DNA-binding response regulator, LuxR family  31.19 
 
 		 232 aa  52  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.717523  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  31.87 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.657091 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1210  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.49 
 
 		 198 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292938  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1989  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 229 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1402  two component LuxR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2941  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0659  fimbrial Z protein; signal transducer  42.31 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.379451 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4528  response regulator receiver  37.7 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4823  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.97 
 
 		 214 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103693  normal  0.11387 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0647  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 		 212 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.518884  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2370  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  43.75 
 
 		 203 aa  51.2  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3239  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 274 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1846  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.18 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.349565  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 221 aa  51.2  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1350  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.31 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2281  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2406  LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 92 aa  50.4  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.31 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3357  two component LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.26 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.31 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4220  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 218 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 227 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2031  LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 91 aa  50.1  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.263481  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5499  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 213 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00659712  normal  0.108677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4115  response regulator receiver protein  35.94 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.071707  normal  0.0608108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  36.54 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1222  two component LuxR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.32 
 
 		 867 aa  50.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.07 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00120804  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2415  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  39.13 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4334  transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 160 aa  50.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1873  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 233 aa  49.7  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.145213  normal  0.385799 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 252 aa  49.3  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3028  two component transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  decreased coverage  0.0000266978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4395  transcriptional regulator, LuxR family  34.92 
 
 		 208 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1936  response regulator receiver protein  40.32 
 
 		 205 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04500  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  38.18 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 303 aa  49.7  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.91 
 
 		 226 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4995  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 250 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2635  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 217 aa  49.3  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000528497  hitchhiker  0.00476816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 238 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3104  LuxR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 163 aa  49.3  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001275  transcriptional regulator VpsT  45.61 
 
 		 222 aa  49.3  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 209 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 216 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4139  transcriptional regulator, LuxR family  42.19 
 
 		 96 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.25 
 
 		 213 aa  49.3  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>