133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1376 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  100 
 
 		 143 aa  285  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  49.26 
 
 		 136 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  48.7 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  44.19 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  36.76 
 
 		 137 aa  100  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  41.67 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5722  DoxX family protein  38.58 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.486124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5453  DoxX family protein  40.17 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.403659  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  40.62 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  38.19 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  40 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  38.51 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4101  DoxX family protein  45.13 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2637  DoxX family protein  43.75 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.920826  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1461  DoxX  32.26 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6367  DoxX family protein  32.26 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0824  DoxX family protein  45.97 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0639123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7034  DoxX family protein  32.26 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182123  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1964  DoxX  34.96 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  36.91 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  39.53 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  37.5 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  36.55 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  36.92 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  35.37 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  34.81 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  37.84 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  34.33 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  36.69 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  35.25 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  38.28 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  38.1 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  39.84 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  36.09 
 
 		 146 aa  57  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  34.07 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  31.51 
 
 		 183 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  39.53 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  37.41 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  37.41 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  31.65 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  35.66 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0240  hypothetical protein  31.2 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  31.51 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  35.14 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  38.14 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  36.72 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  36.22 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  31.47 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  32.39 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0957  membrane protein  40.16 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  44.44 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  43.33 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  33.58 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  35.16 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  39.23 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0320  DoxX family protein  29.13 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  35.2 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  35.94 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  35.94 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0347  DoxX  31.54 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000430544  normal  0.0908673 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  34.25 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  33.33 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  37.69 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  34.13 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  39.78 
 
 		 197 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1240  DoxX  33.33 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  37.21 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  36.92 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  37.63 
 
 		 197 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0883  DoxX family protein  32.09 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  37.21 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2995  DoxX family protein  31.82 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00203576  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  37.21 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  37.63 
 
 		 202 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  37.63 
 
 		 197 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  29.87 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  35.57 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  31.88 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  32.58 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  36.64 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  34.68 
 
 		 185 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  32.58 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0301  DoxX family protein  27.59 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  34.68 
 
 		 185 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  34.9 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1832  DoxX family protein  38.89 
 
 		 197 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174691  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  37.63 
 
 		 216 aa  47.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  38.46 
 
 		 196 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  38.46 
 
 		 196 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  33.09 
 
 		 153 aa  47  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  37.78 
 
 		 197 aa  46.2  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  34.4 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  33.78 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3702  DoxX family protein  30.83 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.955639 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1775  DoxX family protein  30.26 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.019545 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  30.53 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  29.58 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3679  DoxX  33.61 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  34.53 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>