More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0777 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 406 aa  846    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  68.87 
 
 		 403 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  28.94 
 
 		 462 aa  146  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  24.22 
 
 		 452 aa  139  7.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  29.2 
 
 		 462 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  28.65 
 
 		 463 aa  132  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3765  oxidoreductase domain protein  27.18 
 
 		 518 aa  130  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36959  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  29.64 
 
 		 478 aa  125  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  29.33 
 
 		 460 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  28.01 
 
 		 459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  27.43 
 
 		 485 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  25.68 
 
 		 458 aa  117  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  27.1 
 
 		 427 aa  116  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  25.23 
 
 		 441 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  25.52 
 
 		 421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  25.28 
 
 		 440 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  24.78 
 
 		 455 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  26.57 
 
 		 451 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  23.99 
 
 		 458 aa  106  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  24.39 
 
 		 439 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  26.63 
 
 		 359 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  24.77 
 
 		 450 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  25.52 
 
 		 434 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  31.5 
 
 		 385 aa  103  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 		 448 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  33.5 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  28.49 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.25 
 
 		 329 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.25 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  26.97 
 
 		 469 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  22.56 
 
 		 436 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  25.3 
 
 		 448 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  30.52 
 
 		 352 aa  99.8  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  26.93 
 
 		 452 aa  99.8  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  25.38 
 
 		 446 aa  99.8  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  29.88 
 
 		 368 aa  99.4  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  23.54 
 
 		 464 aa  99.4  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  23.2 
 
 		 449 aa  98.2  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  28.24 
 
 		 377 aa  97.8  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  30.91 
 
 		 339 aa  97.8  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  31.98 
 
 		 373 aa  97.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  24.65 
 
 		 451 aa  96.7  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  25.86 
 
 		 435 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0812  oxidoreductase domain protein  25.79 
 
 		 445 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000177397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  25.4 
 
 		 462 aa  94  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  28.24 
 
 		 437 aa  93.6  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  29.24 
 
 		 346 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  26.57 
 
 		 484 aa  93.6  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  26.55 
 
 		 362 aa  93.2  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  26.86 
 
 		 423 aa  93.2  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  30.62 
 
 		 381 aa  93.2  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  22.6 
 
 		 428 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  24.75 
 
 		 501 aa  92.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  31.79 
 
 		 345 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  26.05 
 
 		 403 aa  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4425  oxidoreductase domain protein  28.77 
 
 		 355 aa  91.3  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00532668  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  27.31 
 
 		 383 aa  91.3  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  28.81 
 
 		 346 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  28.81 
 
 		 346 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  28.81 
 
 		 346 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  25.37 
 
 		 435 aa  90.9  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  28.81 
 
 		 346 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  29.79 
 
 		 359 aa  90.5  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 		 421 aa  90.5  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  27.31 
 
 		 384 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  26.83 
 
 		 349 aa  90.5  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  26.83 
 
 		 349 aa  90.5  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  26.83 
 
 		 349 aa  90.5  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  26.43 
 
 		 424 aa  89.7  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1575  putative oxidoreductase  29.79 
 
 		 346 aa  89.7  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.544728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  23.51 
 
 		 451 aa  89.4  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3234  oxidoreductase domain protein  25.54 
 
 		 367 aa  89.7  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00108627  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2449  oxidoreductase domain-containing protein  26.55 
 
 		 377 aa  89.7  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  24.57 
 
 		 435 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  23.46 
 
 		 428 aa  89.4  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  32.52 
 
 		 337 aa  89  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1824  putative oxidoreductase  27.99 
 
 		 346 aa  89.4  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0203744 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  29.36 
 
 		 346 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2018  oxidoreductase domain protein  29.36 
 
 		 346 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210175  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2006  putative oxidoreductase  29.36 
 
 		 346 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00151609  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  24.57 
 
 		 347 aa  88.6  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 341 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  30.92 
 
 		 377 aa  88.2  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  22.39 
 
 		 471 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  29.44 
 
 		 369 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 341 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2336  putative oxidoreductase  29.36 
 
 		 346 aa  89  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  24.55 
 
 		 394 aa  88.6  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1207  oxidoreductase domain protein  25.17 
 
 		 435 aa  88.6  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.274803  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  29.36 
 
 		 359 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  29.36 
 
 		 359 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  29.33 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  27.56 
 
 		 476 aa  86.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0541  oxidoreductase domain protein  25.7 
 
 		 354 aa  86.7  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6559  oxidoreductase domain protein  31.9 
 
 		 464 aa  86.7  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00136961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  29.46 
 
 		 384 aa  86.7  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  29.27 
 
 		 376 aa  86.7  8e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 		 394 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  25.96 
 
 		 481 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  23.73 
 
 		 338 aa  85.9  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>