71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0232 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  100 
 
 		 247 aa  506  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09288  putative transmembrane protein  33.06 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.875246  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2233  RDD domain-containing protein  35.08 
 
 		 247 aa  136  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00562558  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4958  RDD domain containing protein  31.97 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000303152 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1682  RDD domain containing protein  33.47 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2132  hypothetical protein  30.33 
 
 		 238 aa  118  7.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  26.95 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  28.16 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  32.03 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  25.68 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  28.98 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  30.41 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3993  RDD domain containing protein  32.59 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3744  RDD domain containing protein  26.38 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20730  predicted membrane protein/domain  27.89 
 
 		 286 aa  65.5  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00769566  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  28.49 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  31.82 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5849  RDD domain-containing protein  31.71 
 
 		 316 aa  62  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0755  RDD  27.98 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.581888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1745  RDD domain containing protein  29.93 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3753  RDD domain containing protein  31.58 
 
 		 285 aa  58.5  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4317  hypothetical protein  30.49 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4863  RDD domain-containing protein  25.11 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.964955  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5231  RDD domain-containing protein  25.11 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435963  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4952  RDD domain-containing protein  25.11 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2503  hypothetical protein  27.43 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  31.61 
 
 		 241 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13726  hypothetical protein  31.13 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0402342  normal  0.595615 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1333  RDD domain-containing protein  30.26 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  27.43 
 
 		 590 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38330  hypothetical protein  27.27 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1397  membrane protein/domain-like protein  32.14 
 
 		 343 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.309206 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3129  RDD domain containing protein  28.57 
 
 		 304 aa  52.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3316  RDD domain-containing protein  26.59 
 
 		 241 aa  52  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56100  hypothetical protein  25.88 
 
 		 265 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1722  RDD domain-containing protein  28.07 
 
 		 403 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0371  RDD domain containing protein  28.17 
 
 		 135 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2369  RDD domain-containing protein  28.81 
 
 		 398 aa  50.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1509  hypothetical protein  32.95 
 
 		 375 aa  50.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5459  RDD domain-containing protein  29.8 
 
 		 293 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4051  RDD domain containing protein  25.68 
 
 		 288 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  30.14 
 
 		 257 aa  48.9  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4887  hypothetical protein  26.16 
 
 		 223 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437888  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2856  RDD domain-containing protein  31.82 
 
 		 375 aa  48.5  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762039 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2684  RDD domain-containing protein  29.17 
 
 		 415 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0059123  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1700  RDD domain containing protein  29.17 
 
 		 415 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6304  hitchhiker  0.00000345448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1562  RDD domain-containing protein  33.7 
 
 		 449 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0211691 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1568  RDD domain-containing protein  33.7 
 
 		 448 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.957894  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1501  RDD domain-containing protein  33.7 
 
 		 444 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.561992  hitchhiker  0.000145013 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2522  RDD domain containing protein  22.56 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11329  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2662  RDD domain-containing protein  32.61 
 
 		 412 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2763  RDD domain-containing protein  32.61 
 
 		 412 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.136751  hitchhiker  0.000413792 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3834  RDD domain containing protein  22.94 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2902  hypothetical protein  34.09 
 
 		 376 aa  46.2  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2514  RDD domain-containing protein  34.09 
 
 		 453 aa  46.2  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4439  RDD  31.65 
 
 		 241 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  29.08 
 
 		 150 aa  45.8  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 175 aa  45.8  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2381  RDD domain-containing protein  28.57 
 
 		 414 aa  45.8  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7601  RDD domain containing protein  22.97 
 
 		 327 aa  45.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1836  RDD domain containing protein  29.27 
 
 		 268 aa  45.4  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1683  RDD domain-containing protein  28.83 
 
 		 424 aa  45.4  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3913  RDD domain-containing protein  25.15 
 
 		 269 aa  45.4  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0538103  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2240  RDD domain containing protein  35 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2339  RDD domain containing protein  20 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0325969  hitchhiker  0.0000235215 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0015  RDD domain-containing protein  37.14 
 
 		 80 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0461  RDD  25.76 
 
 		 323 aa  43.5  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.253425  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3457  RDD domain containing protein  26.06 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.052067 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1247  RDD domain containing protein  28.09 
 
 		 137 aa  42.7  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0288  RDD domain-containing protein  29.63 
 
 		 276 aa  42  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  38.89 
 
 		 166 aa  42  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>