More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2250 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2250  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 123 aa  246  7e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5523  response regulator receiver protein  70.43 
 
 		 122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6855  response regulator receiver protein  58.97 
 
 		 124 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.508442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5521  response regulator receiver protein  55.36 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0747322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0844  response regulator receiver protein  55.14 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5240  response regulator  49.12 
 
 		 122 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3714  response regulator receiver protein  50 
 
 		 256 aa  114  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5150  response regulator receiver protein  49.12 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.56838 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3511  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.9 
 
 		 209 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5502  two component response regulator  44.92 
 
 		 212 aa  107  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  49.15 
 
 		 204 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2139  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 213 aa  105  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  46.61 
 
 		 209 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  45.76 
 
 		 212 aa  104  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5742  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 131 aa  103  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5548  DNA-binding response regulator, LuxR family  44.92 
 
 		 212 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 206 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0212  response regulator receiver domain-containing protein  47.37 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3728  response regulator receiver protein  47.86 
 
 		 117 aa  100  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5743  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.17 
 
 		 212 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 208 aa  100  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0232  response regulator receiver protein  44.74 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.156918  normal  0.401209 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5187  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 230 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209149 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1832  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 208 aa  100  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  44.34 
 
 		 210 aa  100  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0181  two component LuxR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 210 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1685  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 215 aa  98.6  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.907447 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.22 
 
 		 212 aa  99  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 224 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2358  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 233 aa  98.2  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.119902  normal  0.5156 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 210 aa  98.6  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 209 aa  98.6  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1268  two component LuxR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 220 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2400  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.63 
 
 		 210 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1545  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.8 
 
 		 218 aa  97.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0982964  normal  0.0521608 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1553  two component LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 212 aa  97.4  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5456  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.92 
 
 		 230 aa  97.1  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154935  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0845  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 183 aa  97.1  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4618  two component LuxR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 224 aa  96.7  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6901  response regulator receiver protein  49.14 
 
 		 123 aa  96.7  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.279255  normal  0.546779 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5090  two component LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 214 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 206 aa  95.9  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5186  two component LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 214 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2249  two component LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 204 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2459  two component LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 215 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00709  nodulation protein  39.83 
 
 		 200 aa  95.5  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00695869  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3181  two component LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 214 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.246114  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.5 
 
 		 201 aa  95.5  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1551  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 277 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26584  hitchhiker  0.0028864 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5189  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 213 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.814448  normal  0.223105 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 210 aa  95.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3713  two component LuxR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 208 aa  94.7  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 210 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 209 aa  94.4  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7459  nodulation protein W, two-component transcriptional regulator  41.23 
 
 		 219 aa  94.4  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 210 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 210 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3866  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 224 aa  94  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 210 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  43.48 
 
 		 202 aa  94  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2381  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 124 aa  93.6  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  43.93 
 
 		 210 aa  93.2  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7251  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 133 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1546  response regulator receiver protein  46.09 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0280611  normal  0.028816 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2356  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 215 aa  92.8  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.93 
 
 		 211 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 214 aa  93.2  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.93 
 
 		 211 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.16 
 
 		 220 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 241 aa  92  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6169  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 221 aa  91.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  44.35 
 
 		 204 aa  91.3  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 214 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  41.46 
 
 		 212 aa  90.9  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1135  two component LuxR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 201 aa  90.9  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2407  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 220 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.958584 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.74 
 
 		 228 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  41.46 
 
 		 212 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  41.46 
 
 		 212 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  41.46 
 
 		 212 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  41.46 
 
 		 212 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  41.46 
 
 		 212 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 203 aa  90.5  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  41.46 
 
 		 212 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  41.46 
 
 		 212 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0645  two component LuxR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 240 aa  89.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2380  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 208 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 215 aa  89.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 214 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3082  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 201 aa  89.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0470395  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5691  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.263538 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3389  response regulator receiver protein  43.09 
 
 		 211 aa  90.1  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3049  response regulator receiver  44.92 
 
 		 228 aa  89.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.651154  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4620  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 212 aa  88.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 212 aa  88.6  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 212 aa  88.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0038  LuxR family DNA-binding response regulator  41.53 
 
 		 212 aa  89  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 212 aa  89  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 212 aa  88.6  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>