More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0907 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0907  ATP-dependent transcription regulator LuxR  100 
 
 		 850 aa  1695    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19850  putative transcriptional regulator  43.43 
 
 		 827 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.326832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1706  transcriptional regulator  43.46 
 
 		 827 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1136  regulatory protein, LuxR  38.16 
 
 		 868 aa  415  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.87643 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.44 
 
 		 911 aa  332  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  33.67 
 
 		 906 aa  331  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  33.93 
 
 		 906 aa  327  5e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  33.26 
 
 		 914 aa  320  7.999999999999999e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.96 
 
 		 905 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.22 
 
 		 905 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 905 aa  308  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  32.66 
 
 		 905 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  33.15 
 
 		 910 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  32.7 
 
 		 920 aa  290  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.25 
 
 		 913 aa  124  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2693  regulatory protein, LuxR  26 
 
 		 891 aa  121  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.602772  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  20.83 
 
 		 887 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  21.04 
 
 		 902 aa  96.3  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.08 
 
 		 1019 aa  91.3  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.68 
 
 		 880 aa  90.9  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  20.77 
 
 		 902 aa  87.4  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  24 
 
 		 896 aa  80.9  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  25.9 
 
 		 897 aa  78.2  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44 
 
 		 870 aa  77.4  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4222  ATP-dependent transcription regulator LuxR  53.62 
 
 		 309 aa  77.4  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5099  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  26.24 
 
 		 900 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  41.73 
 
 		 867 aa  74.7  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  25.6 
 
 		 904 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1053  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.92 
 
 		 236 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.295708  normal  0.0294181 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  22.41 
 
 		 921 aa  72.4  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  24.17 
 
 		 933 aa  72.4  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.36 
 
 		 1021 aa  71.6  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2524  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.76 
 
 		 914 aa  71.6  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.9975  normal  0.793034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1558  two component LuxR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 240 aa  69.7  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1911  transcriptional regulator domain protein  32.83 
 
 		 990 aa  69.7  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.345318  decreased coverage  0.000588756 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  22.77 
 
 		 905 aa  70.1  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0930  LuxR family two component transcriptional regulator  49.37 
 
 		 240 aa  70.1  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.545376  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5475  regulatory protein, LuxR  26.03 
 
 		 911 aa  69.3  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450601  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 904 aa  68.9  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  23.44 
 
 		 1003 aa  68.6  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1418  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.68 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3393  regulatory protein, LuxR  26.89 
 
 		 900 aa  68.6  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  50.77 
 
 		 930 aa  67.8  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  24.87 
 
 		 900 aa  67.8  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  54.84 
 
 		 924 aa  67.8  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  38.89 
 
 		 932 aa  67  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.4 
 
 		 876 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  31.58 
 
 		 947 aa  66.6  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.11 
 
 		 215 aa  66.6  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2367  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.93 
 
 		 226 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0925  response regulator receiver protein  37.86 
 
 		 119 aa  66.6  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.592282  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2417  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.93 
 
 		 226 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4554  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.97 
 
 		 245 aa  65.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376132  normal  0.833141 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0029  two component LuxR family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 220 aa  66.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.268532  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  22.86 
 
 		 889 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 914 aa  65.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  27.5 
 
 		 916 aa  65.9  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2840  LuxR family two component transcriptional regulator  52.86 
 
 		 238 aa  65.5  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  27.32 
 
 		 910 aa  65.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  49.21 
 
 		 896 aa  65.5  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  49.3 
 
 		 209 aa  65.1  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0530  transcriptional regulator, LuxR family  42.67 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5070  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.77 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.744929 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0882  LuxR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0164  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.72 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0441129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  25.21 
 
 		 766 aa  63.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1148  regulatory protein LuxR  23.44 
 
 		 921 aa  63.9  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38740  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  57.14 
 
 		 250 aa  63.9  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.74 
 
 		 901 aa  63.9  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0661  two component LuxR family transcriptional regulator  58.18 
 
 		 239 aa  63.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000223942  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4096  two component LuxR family transcriptional regulator  58.93 
 
 		 237 aa  63.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.811447  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1633  tetratricopeptide TPR_4  25.94 
 
 		 1031 aa  63.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.720693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 508 aa  63.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.11 
 
 		 877 aa  63.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0910  transcriptional activator domain-containing protein  24.04 
 
 		 1064 aa  63.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13097  serine/threonine-protein kinase transcriptional regulatory protein pknK  25.58 
 
 		 1110 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4133  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  24.31 
 
 		 749 aa  62.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.22 
 
 		 894 aa  62.8  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0921  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  28.14 
 
 		 881 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54574  normal  0.164383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1549  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.14 
 
 		 238 aa  62.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196807  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 550 aa  62  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2681  LuxR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 74 aa  62.4  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  32.89 
 
 		 895 aa  61.6  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  51.72 
 
 		 913 aa  61.6  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1248  transcriptional regulator, LuxR family  44.78 
 
 		 232 aa  62  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.79 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3277  transcriptional regulator, LuxR family  55.56 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.56 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.57 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0211915  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  58.18 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2289  regulatory protein LuxR  41.67 
 
 		 151 aa  61.2  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301716 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2623  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.74 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0162  ATP-dependent transcriptional regulator-like  25.43 
 
 		 756 aa  61.2  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3480  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.74 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147525 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  37.89 
 
 		 556 aa  61.2  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  58.18 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4561  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.36 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05153  hypothetical protein  50 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0097  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.49 
 
 		 209 aa  60.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142871  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2902  LuxR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 153 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>