287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1185 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1185  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 		 316 aa  626  1e-178  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3121  ornithine cyclodeaminase  51.18 
 
 		 303 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135549 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0854  ornithine cyclodeaminase  50.84 
 
 		 303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2513  ornithine cyclodeaminase  50.51 
 
 		 303 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2670  ornithine cyclodeaminase  46.33 
 
 		 305 aa  259  6e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0054  ornithine cyclodeaminase  45.61 
 
 		 301 aa  246  4.9999999999999997e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  40.07 
 
 		 312 aa  193  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798228  normal  0.736679 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  42.26 
 
 		 320 aa  187  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  39.76 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  39.93 
 
 		 297 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  41.01 
 
 		 323 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  40 
 
 		 348 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  40.77 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  39.58 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0204  ornithine cyclodeaminase  36.84 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.358948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2024  ornithine cyclodeaminase  41.92 
 
 		 332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  36.76 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  37.21 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  37.5 
 
 		 314 aa  166  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  42.64 
 
 		 315 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  40.89 
 
 		 315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  33.44 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2747  ornithine cyclodeaminase  35.42 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908103  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  43.46 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0068  ornithine cyclodeaminase  38.19 
 
 		 318 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5760  ornithine cyclodeaminase  41.34 
 
 		 314 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342244  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  34.57 
 
 		 318 aa  152  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4320  ornithine cyclodeaminase  35.86 
 
 		 315 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003670  ornithine cyclodeaminase  32.78 
 
 		 324 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6879  ornithine cyclodeaminase  37.6 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0318034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  36.29 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2610  ornithine cyclodeaminase  32.57 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.329826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1715  ornithine cyclodeaminase  40.34 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3226  ornithine cyclodeaminase  34.14 
 
 		 341 aa  133  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  29.96 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  31.75 
 
 		 340 aa  129  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  29.6 
 
 		 316 aa  122  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  34.77 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  35.59 
 
 		 328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  32.4 
 
 		 333 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  29.22 
 
 		 319 aa  116  6e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  35.86 
 
 		 321 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  32.08 
 
 		 333 aa  112  9e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  28.85 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  30.91 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  36.94 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  32.75 
 
 		 323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  28.46 
 
 		 341 aa  109  6e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  33.07 
 
 		 329 aa  108  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  24.27 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  29.5 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  27.18 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  24.27 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  29.03 
 
 		 325 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  33.98 
 
 		 326 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  29.92 
 
 		 325 aa  106  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  29.92 
 
 		 325 aa  106  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  31.85 
 
 		 313 aa  106  6e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  30.42 
 
 		 332 aa  106  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  34.24 
 
 		 316 aa  105  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  29.13 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  34.25 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  29.13 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  29.13 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  28.74 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1566  ornithine cyclodeaminase  30.25 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  29.53 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  34.5 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  28.8 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  28.74 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  37.34 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1539  ornithine cyclodeaminase  37.9 
 
 		 312 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00484883  normal  0.0982373 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  28.74 
 
 		 325 aa  102  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  32.45 
 
 		 342 aa  102  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  31.72 
 
 		 308 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  30.65 
 
 		 328 aa  102  9e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2415  ornithine cyclodeaminase  31.75 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.151404  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03150  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  33.59 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 321 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.23 
 
 		 323 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  28.9 
 
 		 324 aa  98.2  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  30.58 
 
 		 329 aa  97.1  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  31.46 
 
 		 336 aa  97.1  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  29.27 
 
 		 327 aa  96.3  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  28.52 
 
 		 345 aa  95.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  31.4 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  33.33 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  28.51 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  27.02 
 
 		 329 aa  94  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34775  predicted protein  28.79 
 
 		 346 aa  93.2  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  27.97 
 
 		 318 aa  93.2  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  35.68 
 
 		 328 aa  92.8  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  30.48 
 
 		 317 aa  93.2  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3761  ornithine cyclodeaminase  32.02 
 
 		 310 aa  92.8  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  30.42 
 
 		 314 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.18 
 
 		 332 aa  92  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  25.1 
 
 		 324 aa  91.3  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  30.95 
 
 		 321 aa  90.9  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  31.54 
 
 		 329 aa  90.9  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  29.64 
 
 		 313 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>