279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1192 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  100 
 
 		 519 aa  1058    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  42.83 
 
 		 504 aa  423  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  42.66 
 
 		 522 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  46.2 
 
 		 525 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  45.32 
 
 		 523 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  40.73 
 
 		 527 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  41.31 
 
 		 528 aa  383  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  43.07 
 
 		 530 aa  376  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  40.5 
 
 		 527 aa  373  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  40 
 
 		 551 aa  303  5.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  36.58 
 
 		 587 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  35.86 
 
 		 539 aa  281  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  36.49 
 
 		 533 aa  276  7e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  37.16 
 
 		 593 aa  276  7e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  37.22 
 
 		 587 aa  276  9e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  37.22 
 
 		 587 aa  276  9e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  37.22 
 
 		 587 aa  276  9e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  39.75 
 
 		 538 aa  274  3e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  36.78 
 
 		 603 aa  273  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  37.16 
 
 		 598 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  36.53 
 
 		 600 aa  272  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  37.16 
 
 		 598 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  36.55 
 
 		 587 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  37.16 
 
 		 598 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  36.32 
 
 		 587 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  32.91 
 
 		 548 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  38.42 
 
 		 537 aa  270  4e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  36.47 
 
 		 677 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  38.21 
 
 		 569 aa  270  5.9999999999999995e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24230  flagellar M-ring protein  36.44 
 
 		 576 aa  269  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  36.93 
 
 		 598 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  36.93 
 
 		 598 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  36.93 
 
 		 598 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  36.93 
 
 		 598 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  37.18 
 
 		 552 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  36.64 
 
 		 587 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  36.88 
 
 		 552 aa  266  7e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  33.64 
 
 		 567 aa  266  8.999999999999999e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  37.18 
 
 		 552 aa  266  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  37.18 
 
 		 552 aa  266  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  37.18 
 
 		 552 aa  266  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  41.05 
 
 		 539 aa  265  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  37.03 
 
 		 552 aa  265  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  32.59 
 
 		 568 aa  263  4e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  37.5 
 
 		 563 aa  263  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  36.06 
 
 		 579 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  36.06 
 
 		 579 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  36.06 
 
 		 579 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  35.62 
 
 		 579 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  35.35 
 
 		 576 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  35.43 
 
 		 565 aa  261  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  36.08 
 
 		 576 aa  260  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0424  flagellar M-ring protein FliF  37.29 
 
 		 530 aa  258  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  34.19 
 
 		 551 aa  256  5e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  35.68 
 
 		 560 aa  256  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1891  flagellar MS-ring protein  36.05 
 
 		 569 aa  256  6e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  34.41 
 
 		 552 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  34.85 
 
 		 570 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  33.54 
 
 		 561 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  34.85 
 
 		 570 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  34.85 
 
 		 570 aa  253  6e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  34.49 
 
 		 584 aa  252  9.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  33.96 
 
 		 588 aa  252  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  36.83 
 
 		 562 aa  251  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  33.87 
 
 		 594 aa  250  4e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  37.05 
 
 		 571 aa  250  5e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  36.86 
 
 		 519 aa  249  8e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  33.94 
 
 		 566 aa  249  9e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  34.49 
 
 		 568 aa  249  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  34.32 
 
 		 567 aa  249  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1573  flagellar M-ring protein FliF  40.16 
 
 		 547 aa  248  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  33.92 
 
 		 541 aa  248  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  35.2 
 
 		 567 aa  248  3e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0472  flagellar MS-ring protein  35.23 
 
 		 566 aa  245  9.999999999999999e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  33.62 
 
 		 540 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3081  flagellar M-ring protein FliF  36.93 
 
 		 564 aa  244  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3807  flagellar M-ring protein FliF  36.93 
 
 		 564 aa  244  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.612856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  33.67 
 
 		 611 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  33.67 
 
 		 611 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2184  flagellar M-ring protein FliF  33.62 
 
 		 552 aa  243  5e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4573  flagellar MS-ring protein  35.29 
 
 		 538 aa  243  6e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.628076  normal  0.449535 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  35.9 
 
 		 580 aa  243  7e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0218  flagellar M-ring protein FliF  32.84 
 
 		 574 aa  240  5e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  32.14 
 
 		 552 aa  239  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  33.13 
 
 		 590 aa  237  3e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  32.53 
 
 		 566 aa  237  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  32.27 
 
 		 611 aa  236  6e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5059  flagellar MS-ring protein  36.04 
 
 		 525 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48638  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4460  flagellar MS-ring protein  35.08 
 
 		 540 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.2943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4092  flagellar MS-ring protein  35.08 
 
 		 540 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.365562 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1642  flagellar M-ring protein FliF  35.32 
 
 		 536 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0112721  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1394  flagellar M-ring protein FliF  39.57 
 
 		 533 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0124624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  32.28 
 
 		 598 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  32.08 
 
 		 597 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5126  flagellar MS-ring protein  35.61 
 
 		 539 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0640822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6057  flagellar MS-ring protein  34.45 
 
 		 541 aa  230  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0632593  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  30.87 
 
 		 592 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  30.81 
 
 		 592 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1457  flagellar MS-ring protein  33.83 
 
 		 538 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2559  flagellar M-ring protein FliF  38.85 
 
 		 533 aa  227  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00858256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>