More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2231 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1828  acriflavin resistance protein  51.59 
 
 		 1025 aa  1048    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0227595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2822  acriflavin resistance protein  51.77 
 
 		 1027 aa  1045    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000227615  normal  0.366957 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1923  AcrB/AcrD/AcrF family protein  50.59 
 
 		 1020 aa  1038    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1779  acriflavin resistance protein  51.85 
 
 		 1025 aa  1054    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2516  acriflavin resistance protein  50.44 
 
 		 1015 aa  1000    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.560727  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1638  acriflavin resistance protein  39.14 
 
 		 1026 aa  728    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.643434 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1828  acriflavin resistance protein  50.44 
 
 		 1015 aa  1000    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.575203 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1647  acriflavin resistance protein  51.67 
 
 		 1015 aa  1049    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01075  AcrB/AcrD/AcrF family protein  64.38 
 
 		 1026 aa  1332    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2194  acriflavin resistance protein  52.04 
 
 		 1030 aa  1058    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2277  acriflavin resistance protein  51.08 
 
 		 1015 aa  1044    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2231  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1040 aa  2116    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1627  acriflavin resistance protein  51.52 
 
 		 1018 aa  1030    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1702  acriflavin resistance protein  51.82 
 
 		 1018 aa  1031    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2383  acriflavin resistance protein  51.17 
 
 		 1021 aa  1051    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2523  acriflavin resistance protein  50.44 
 
 		 1015 aa  1000    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1702  acriflavin resistance protein  51.12 
 
 		 1018 aa  1006    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1419  AcrB/AcrD/AcrF family protein  50.59 
 
 		 1019 aa  1029    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.446935 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2636  acriflavin resistance protein  50.44 
 
 		 1015 aa  999    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00322  RND superfamily protein  37.21 
 
 		 823 aa  561  1e-158  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  30.21 
 
 		 1044 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  31.4 
 
 		 1044 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2528  acriflavin resistance protein  29.94 
 
 		 1053 aa  423  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.263443  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  29.64 
 
 		 1046 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  29.63 
 
 		 1011 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  28.92 
 
 		 1050 aa  415  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  29.41 
 
 		 1034 aa  410  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  28.23 
 
 		 1040 aa  405  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  28.47 
 
 		 1043 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  27.83 
 
 		 1470 aa  399  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  28.09 
 
 		 1038 aa  392  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  29.1 
 
 		 1017 aa  387  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  26.92 
 
 		 1496 aa  385  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  26.63 
 
 		 1032 aa  385  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  29.1 
 
 		 1024 aa  385  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  27.3 
 
 		 1034 aa  383  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  28.16 
 
 		 1039 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  26.99 
 
 		 1023 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  26.78 
 
 		 1041 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  28.38 
 
 		 1043 aa  371  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.99 
 
 		 1024 aa  368  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  25.67 
 
 		 1036 aa  370  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  26.37 
 
 		 1014 aa  363  1e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  26.57 
 
 		 1034 aa  360  7e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  29.33 
 
 		 1027 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  27.79 
 
 		 1083 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  26.49 
 
 		 1058 aa  358  2.9999999999999997e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  28.15 
 
 		 1050 aa  358  2.9999999999999997e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  26.1 
 
 		 1173 aa  357  7.999999999999999e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  28.31 
 
 		 1047 aa  356  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.36 
 
 		 1049 aa  354  4e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  27.94 
 
 		 1027 aa  352  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  27.48 
 
 		 1028 aa  350  9e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  26.66 
 
 		 1006 aa  349  1e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  26.08 
 
 		 1009 aa  348  2e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  28.31 
 
 		 1033 aa  346  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  27.35 
 
 		 1058 aa  346  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  28.07 
 
 		 1055 aa  343  7e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  28.56 
 
 		 1028 aa  342  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  26.05 
 
 		 1036 aa  339  1.9999999999999998e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  26.8 
 
 		 1034 aa  337  5e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  27.33 
 
 		 1041 aa  337  9e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  25.62 
 
 		 1041 aa  337  9e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  26.71 
 
 		 1028 aa  335  2e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  25.89 
 
 		 1027 aa  335  2e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  26.83 
 
 		 1022 aa  335  3e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  25.58 
 
 		 1039 aa  334  5e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  26.04 
 
 		 1058 aa  333  8e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  27.01 
 
 		 1071 aa  332  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  26.68 
 
 		 1042 aa  332  2e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  26.19 
 
 		 1030 aa  332  3e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  28.16 
 
 		 1026 aa  330  6e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  27.09 
 
 		 1031 aa  330  7e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  26.45 
 
 		 1062 aa  330  1.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2378  acriflavin resistance protein  26.97 
 
 		 1044 aa  327  6e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.856569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  26.49 
 
 		 1065 aa  327  7e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0806  acriflavin resistance protein  25.9 
 
 		 1042 aa  327  9e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  25.17 
 
 		 1053 aa  324  5e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  26.29 
 
 		 1055 aa  324  6e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1784  acriflavin resistance protein  28.28 
 
 		 1065 aa  324  7e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0514999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3889  acriflavin resistance protein  26.82 
 
 		 1018 aa  323  9.000000000000001e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0552128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  26.65 
 
 		 1048 aa  323  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  24.78 
 
 		 1059 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  25.76 
 
 		 1031 aa  322  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01699  RND family efflux transporter  25.73 
 
 		 1038 aa  320  7e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2296  putative integral membrane efflux protein  28.05 
 
 		 1064 aa  319  1e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  25.93 
 
 		 1043 aa  319  1e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  27.62 
 
 		 1054 aa  318  3e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.95 
 
 		 1031 aa  318  4e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  26.39 
 
 		 1031 aa  317  6e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  27.34 
 
 		 1054 aa  317  8e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  26.99 
 
 		 1095 aa  317  8e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  26.39 
 
 		 1031 aa  317  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  26.29 
 
 		 1045 aa  316  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  26.39 
 
 		 1031 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  26 
 
 		 1092 aa  316  1.9999999999999998e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  24.59 
 
 		 1063 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  25.75 
 
 		 1031 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  26.29 
 
 		 1031 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2815  acriflavin resistance protein  25.48 
 
 		 1051 aa  315  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874616  normal  0.995091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>