More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03843 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03843  hydrolase  100 
 
 		 244 aa  482  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3992  alpha/beta hydrolase fold  58.09 
 
 		 284 aa  285  5e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  40.59 
 
 		 284 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  38.82 
 
 		 284 aa  144  9e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  30.3 
 
 		 282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 315 aa  135  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  38.14 
 
 		 300 aa  135  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  29.87 
 
 		 282 aa  135  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  36.02 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  36.44 
 
 		 284 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  32.63 
 
 		 279 aa  132  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  35.56 
 
 		 284 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  35.98 
 
 		 284 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  35.02 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  35.15 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  39.56 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  39.01 
 
 		 286 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  33.2 
 
 		 288 aa  122  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  29.26 
 
 		 283 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1592  hypothetical protein  28.82 
 
 		 255 aa  119  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 		 288 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 		 288 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0907  putative hydrolase  30.22 
 
 		 289 aa  119  6e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 		 294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45778  predicted protein  31.73 
 
 		 359 aa  114  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  32.4 
 
 		 288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  32.51 
 
 		 288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1571  hypothetical protein  34.62 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0811227  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  30.17 
 
 		 299 aa  113  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  32.05 
 
 		 284 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  31.69 
 
 		 288 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  35.1 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  32.66 
 
 		 298 aa  109  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  31.82 
 
 		 284 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1187  putative lipase  29.92 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  32.55 
 
 		 311 aa  105  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1732  alpha/beta hydrolase fold  31.12 
 
 		 297 aa  102  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259687  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 		 291 aa  102  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 		 294 aa  97.1  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  31.66 
 
 		 311 aa  95.5  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2967  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 308 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  30.9 
 
 		 289 aa  85.5  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 		 327 aa  85.5  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  33.48 
 
 		 289 aa  85.1  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 		 300 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3301  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2567  alpha/beta fold family hydrolase  30.36 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3148  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 308 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  27.35 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  30.85 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  28.72 
 
 		 285 aa  65.5  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2305  alpha/beta hydrolase fold  25.4 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  26.09 
 
 		 2762 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3841  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3768  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 571 aa  60.8  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1201  hypothetical protein  27.47 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000612925  hitchhiker  0.000217368 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  29.08 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4574  alpha/beta fold family hydrolase  26.69 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  29.46 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  27.13 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13227  lipase lipV  27.53 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 		 295 aa  57  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  27.08 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2529  putative hydrolase  32.99 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0887671 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  42.11 
 
 		 282 aa  57  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3966  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2685  Alpha/beta hydrolase fold  23.93 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.117694  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1064  alpha/beta fold family hydrolase  30.19 
 
 		 378 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01088  hypothetical esterase/lipase ybfF  25.75 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000642463  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  44 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 346 aa  55.8  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 311 aa  55.5  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1153  alpha/beta hydrolase fold  28.64 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  26.78 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  24.27 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  33.67 
 
 		 300 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  26.51 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 316 aa  55.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  36.47 
 
 		 397 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 		 296 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2364  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 		 352 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 		 296 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1451  Alpha/beta hydrolase  36.73 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1960  alpha/beta hydrolase fold  37.84 
 
 		 278 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.877716  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 		 296 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 		 292 aa  53.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4348  alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 		 331 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  45.71 
 
 		 309 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29 
 
 		 367 aa  52.8  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  38.67 
 
 		 323 aa  52.8  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>