64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5847 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0350  hypothetical protein  62.81 
 
 		 1198 aa  1165    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5847  hypothetical protein  100 
 
 		 1200 aa  2278    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227793  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0505  membrane protein-like protein  63.41 
 
 		 1207 aa  1068    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67530  hypothetical protein  94.67 
 
 		 1201 aa  1868    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4945  hypothetical protein  38.85 
 
 		 1128 aa  552  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1537  hypothetical protein  40.08 
 
 		 1242 aa  501  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.896798  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5166  hypothetical protein  51.89 
 
 		 939 aa  458  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.095267  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  50.96 
 
 		 957 aa  392  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  45.5 
 
 		 938 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4568  membrane protein-like protein  53.05 
 
 		 1139 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95183 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0732  hypothetical protein  49.47 
 
 		 953 aa  373  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5106  membrane protein-like protein  44.5 
 
 		 1130 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0951295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3194  membrane protein-like  44.5 
 
 		 1155 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5093  membrane protein-like protein  53.05 
 
 		 1133 aa  369  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.161035 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5173  membrane protein-like protein  44.66 
 
 		 1124 aa  370  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747728  normal  0.0847519 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1674  membrane protein-like protein  47.1 
 
 		 1093 aa  351  4e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.956677 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  40.77 
 
 		 949 aa  346  2e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1901  membrane protein-like protein  50.35 
 
 		 1146 aa  336  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95592  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3483  membrane protein-like protein  40.85 
 
 		 989 aa  311  4e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.736371  normal  0.107925 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1987  Protein of unknown function DUF2339, transmembrane  38 
 
 		 973 aa  306  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0361094  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1102  hypothetical protein  48.71 
 
 		 903 aa  302  3e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1094  hypothetical protein  36.29 
 
 		 902 aa  296  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0433151  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3218  hypothetical protein  45.58 
 
 		 891 aa  279  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.311466  normal  0.319436 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2460  hypothetical protein  39.6 
 
 		 946 aa  276  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02114  hypothetical protein  41.95 
 
 		 774 aa  248  4e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283131  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2804  membrane-like protein  43.01 
 
 		 941 aa  245  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.195505 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2282  membrane protein-like  30.49 
 
 		 1045 aa  156  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.650605  normal  0.0137094 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  24.54 
 
 		 778 aa  140  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0453  membrane protein-like  43.59 
 
 		 1133 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201937  normal  0.0526268 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1764  membrane protein  30.65 
 
 		 587 aa  130  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.923243 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  24.95 
 
 		 833 aa  125  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  25.87 
 
 		 824 aa  124  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2493  membrane protein-like protein  24.64 
 
 		 921 aa  109  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0413775  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  25.74 
 
 		 600 aa  106  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  29.59 
 
 		 1312 aa  90.1  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  24.34 
 
 		 823 aa  80.1  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0104  membrane protein-like  28.48 
 
 		 934 aa  69.7  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2369  hypothetical protein  32.74 
 
 		 894 aa  61.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518364  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0678  hypothetical protein  30.1 
 
 		 915 aa  59.3  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0917  hypothetical protein  23.27 
 
 		 1070 aa  57  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2332  hypothetical protein  29.96 
 
 		 915 aa  57.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.741682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1232  hypothetical protein  29.25 
 
 		 899 aa  56.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3570  hypothetical protein  23.65 
 
 		 1070 aa  55.8  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2614  membrane protein-like  26.89 
 
 		 939 aa  53.1  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.284738  normal  0.14506 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2913  membrane protein-like  25.38 
 
 		 847 aa  53.1  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.992887  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0606  hypothetical protein  23.18 
 
 		 573 aa  52.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000211502  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1250  hypothetical protein  32.04 
 
 		 893 aa  52  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373819  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1640  putative integral membrane protein  26.99 
 
 		 954 aa  50.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04921  hypothetical protein  23.26 
 
 		 906 aa  50.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4612  hypothetical protein  24.13 
 
 		 573 aa  50.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000184306  normal  0.241609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1751  putative integral membrane protein  26.99 
 
 		 954 aa  49.3  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3445  hypothetical protein  22.61 
 
 		 616 aa  49.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4305  membrane protein-like protein  34.42 
 
 		 679 aa  49.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.345935  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0933  hypothetical protein  21.54 
 
 		 1063 aa  48.9  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3373  hypothetical protein  23.32 
 
 		 1065 aa  48.5  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  28.43 
 
 		 268 aa  48.5  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1111  hypothetical protein  30.21 
 
 		 901 aa  48.5  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.661792  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0914  hypothetical protein  20.94 
 
 		 850 aa  48.5  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0670  hypothetical protein  31.3 
 
 		 257 aa  48.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564115  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0565  hypothetical protein  31.45 
 
 		 569 aa  48.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000285006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0723  hypothetical protein  23.1 
 
 		 573 aa  45.8  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00206833  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3080  Extensin family protein  32.98 
 
 		 316 aa  45.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2397  extensin family protein  31.09 
 
 		 362 aa  45.4  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0931  hypothetical protein  20.67 
 
 		 1048 aa  45.1  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>