67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0991 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0991  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  328  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3375  DoxX  75.68 
 
 		 171 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.239229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1303  DoxX family protein  64.19 
 
 		 173 aa  186  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.279966 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3295  DoxX family protein  74.83 
 
 		 162 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1906  DoxX family protein  75.33 
 
 		 162 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.646959  normal  0.313164 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2400  DoxX family protein  73.51 
 
 		 162 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2006  DoxX family protein  72.37 
 
 		 160 aa  167  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  52.52 
 
 		 152 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2637  DoxX family protein  40.79 
 
 		 153 aa  107  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.920826  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  35.92 
 
 		 144 aa  67.4  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  34.22 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  35.36 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  33.56 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  33.71 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1556  DoxX family protein  35.95 
 
 		 199 aa  62  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  31.35 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  30.77 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  27.98 
 
 		 197 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  34.62 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  27.98 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  37.62 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  34.15 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  31.43 
 
 		 137 aa  53.9  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  35.64 
 
 		 198 aa  51.2  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0320  DoxX family protein  32.12 
 
 		 144 aa  51.2  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  31.82 
 
 		 148 aa  50.8  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1739  DoxX family protein  31.76 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  31.68 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  28.65 
 
 		 204 aa  48.9  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1846  DoxX family protein  31.32 
 
 		 197 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4649  DoxX  32.48 
 
 		 174 aa  48.5  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1807  DoxX family protein  31.32 
 
 		 197 aa  48.5  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2479  DoxX family protein  31.49 
 
 		 197 aa  48.5  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  32.37 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4101  DoxX family protein  35.71 
 
 		 143 aa  47.4  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1832  DoxX family protein  28.96 
 
 		 197 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174691  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  30.15 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  27.03 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  33.79 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  30.5 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1605  DoxX  36.63 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  32.03 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  36.84 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  38.89 
 
 		 148 aa  45.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2679  DoxX  30.95 
 
 		 156 aa  45.1  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2032  hypothetical protein  39.64 
 
 		 167 aa  44.3  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0301  DoxX family protein  29.34 
 
 		 157 aa  44.3  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00355  NADH dehydrogenase  29.59 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  31.72 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2710  hypothetical protein  37 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  29.37 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0755  DoxX family protein  35.48 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  32 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  29.29 
 
 		 136 aa  42.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  31.51 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  33.78 
 
 		 198 aa  42  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  32.89 
 
 		 154 aa  42  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0098  DoxD family protein/pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.57 
 
 		 752 aa  41.6  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0100  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.57 
 
 		 730 aa  41.6  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0529  DoxX  27.86 
 
 		 164 aa  41.6  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002082  membrane protein  28.47 
 
 		 151 aa  41.6  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  29.66 
 
 		 185 aa  41.2  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1432  DoxX family protein  29.44 
 
 		 175 aa  41.2  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  36.36 
 
 		 144 aa  41.2  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  30.69 
 
 		 149 aa  40.8  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2316  DoxX  39 
 
 		 196 aa  40.8  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  29.37 
 
 		 185 aa  40.8  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0159355 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>