More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1890 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1890  pili assembly chaperone  100 
 
 		 259 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2229  chaperone protein PapD  50.62 
 
 		 251 aa  248  6e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2038  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  52.4 
 
 		 248 aa  244  8e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361686  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3825  pili assembly chaperone  49.79 
 
 		 245 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1465  pili assembly chaperone  51.33 
 
 		 244 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1500  pili assembly chaperone  49.3 
 
 		 245 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  35.4 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  37.39 
 
 		 232 aa  148  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  34.65 
 
 		 245 aa  148  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  37.39 
 
 		 232 aa  148  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  37.39 
 
 		 232 aa  148  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  33.89 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  36.96 
 
 		 232 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  38.01 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  34.47 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  34.47 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  34.47 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  34.47 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  34.38 
 
 		 237 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  34.31 
 
 		 241 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  35.21 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  33.05 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  34.87 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3923  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.68 
 
 		 247 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.358656  normal  0.566628 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3810  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.68 
 
 		 247 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.124157 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  35.02 
 
 		 256 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  35.02 
 
 		 256 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  35.02 
 
 		 256 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.19 
 
 		 246 aa  138  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.08 
 
 		 248 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.5 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  32.89 
 
 		 241 aa  135  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  35.56 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  34.23 
 
 		 247 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  34.2 
 
 		 247 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.47 
 
 		 243 aa  132  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2716  fimbrial chaperone protein  37.3 
 
 		 250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.435606  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  36.64 
 
 		 229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1316  pili assembly chaperone  38.1 
 
 		 250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.1 
 
 		 238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2488  periplasmic pilus chaperone family protein  38.1 
 
 		 250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1535  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.87 
 
 		 266 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0256445  normal  0.556062 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  32.88 
 
 		 226 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.76 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0762  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.14 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0172596 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  32.74 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  31.58 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  32.74 
 
 		 245 aa  126  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.47 
 
 		 243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.18 
 
 		 244 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  32.74 
 
 		 259 aa  125  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  31.95 
 
 		 264 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0989  pili assembly chaperone  36.75 
 
 		 230 aa  125  8.000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2495  fimbrial chaperone protein  32.77 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0727302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0085  pili assembly chaperone  32.86 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  33.19 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  33.19 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  34.12 
 
 		 227 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  33.19 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  32.71 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  33.65 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  30.34 
 
 		 251 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  33.65 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  33.18 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3925  putative fimbrial assembly chaperone FanE  36.44 
 
 		 226 aa  122  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1666  pili assembly chaperone  29.17 
 
 		 252 aa  122  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.212595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.93 
 
 		 266 aa  122  7e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1317  fimbral chaperone protein  34.72 
 
 		 260 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.367695  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  29.71 
 
 		 248 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  33.49 
 
 		 227 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4242  pili assembly chaperone protein  30.93 
 
 		 243 aa  121  9e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  35.78 
 
 		 241 aa  121  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4145  pili assembly chaperone  35.06 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1134  pili assembly chaperone  32.9 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  0.162532 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  32.93 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4095  long polar fimbrial operon protein LpfB  30.25 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  32.19 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1548  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.05 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264488  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  29.36 
 
 		 234 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  31.9 
 
 		 256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  33.65 
 
 		 233 aa  118  7e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0372  fimbrial chaperone protein  33.33 
 
 		 267 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.577806  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  32.24 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0370  fimbrial chaperone protein  33.33 
 
 		 253 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0432  fimbrial chaperone protein  33.33 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  hitchhiker  0.0000544991 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1313  pili assembly chaperone  29.78 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654177  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  29 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37040  chaperone CupA2  32.43 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0392  fimbrial chaperone protein  33.48 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533887  normal  0.0135729 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4194  long polar fimbrial operon protein LpfB  30.51 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0380  fimbrial chaperone protein  33.76 
 
 		 309 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0692869 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3090  chaperone protein PapD  34.7 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3173  chaperone protein PapD  34.7 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.315924 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3154  chaperone protein PapD  34.7 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.190535 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3271  chaperone protein PapD  34.7 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.685151  normal  0.0204539 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  34.4 
 
 		 236 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1054  periplasmic pilus chaperone family protein  33.9 
 
 		 233 aa  115  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259205  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3747  pili assembly chaperone  31.67 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.81685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  34.4 
 
 		 245 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1525  pili assembly chaperone  32.75 
 
 		 248 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>