296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0809 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  100 
 
 
219 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  92.69 
 
 
219 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  89.95 
 
 
219 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07801  putative NADH-flavin reductase  78.54 
 
 
219 aa  355  3.9999999999999996e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.368016  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  59.17 
 
 
222 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  55.45 
 
 
227 aa  262  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  58.26 
 
 
222 aa  260  8.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  57.34 
 
 
221 aa  260  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  48.23 
 
 
228 aa  225  4e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0956  hypothetical protein  49.3 
 
 
224 aa  222  4e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.652455  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  42.4 
 
 
209 aa  168  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.4 
 
 
209 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.9 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.82 
 
 
227 aa  163  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  39.73 
 
 
218 aa  158  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  37.56 
 
 
216 aa  154  9e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
219 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  36.92 
 
 
221 aa  141  9e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.8 
 
 
232 aa  104  8e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  31.78 
 
 
232 aa  102  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 
232 aa  99.8  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  33.05 
 
 
246 aa  99  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  30.56 
 
 
231 aa  98.6  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  31.86 
 
 
231 aa  97.4  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.72 
 
 
233 aa  97.1  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  30.41 
 
 
232 aa  96.3  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1016  hypothetical protein  30.45 
 
 
231 aa  91.3  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.861732  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.36 
 
 
231 aa  89.4  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.89 
 
 
235 aa  88.6  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0745309  normal  0.267287 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 
236 aa  88.2  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 
234 aa  87.8  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.166157  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  27.8 
 
 
233 aa  86.7  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7116  predicted protein  31.22 
 
 
218 aa  86.7  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150512  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1916  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  31.09 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1942  binding/catalytic/coenzyme-binding protein  31.09 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.05 
 
 
238 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0108279  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3617  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  28.02 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.753976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  27.19 
 
 
231 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.97 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.78 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.58 
 
 
231 aa  72  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  27.05 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  28 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3236  NmrA family protein  24.3 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.89 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  27.49 
 
 
223 aa  68.2  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  23.08 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47367  predicted protein  29.06 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389479  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  30.67 
 
 
282 aa  67.4  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7335  predicted protein  34.65 
 
 
126 aa  67.8  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.772508  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  28.04 
 
 
282 aa  65.1  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.53 
 
 
213 aa  65.1  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.88 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.96 
 
 
211 aa  63.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.5 
 
 
225 aa  62.8  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.11 
 
 
270 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  24.19 
 
 
211 aa  62  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  25.12 
 
 
219 aa  62  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 
218 aa  61.6  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.95 
 
 
320 aa  61.6  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  26.57 
 
 
224 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49437  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases-like protein  27.2 
 
 
308 aa  61.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.97 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  23.68 
 
 
231 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.94 
 
 
211 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.12 
 
 
213 aa  58.9  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  24.55 
 
 
257 aa  59.3  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.29 
 
 
212 aa  58.5  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.58 
 
 
205 aa  58.2  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.14 
 
 
320 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  26.88 
 
 
223 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  26.25 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1211  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.01 
 
 
211 aa  56.6  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.858868  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  23.58 
 
 
205 aa  57.4  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42835  predicted protein  26.64 
 
 
372 aa  56.6  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  30.19 
 
 
332 aa  56.2  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.3 
 
 
218 aa  56.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3327  hypothetical protein  25.11 
 
 
211 aa  56.2  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  26.83 
 
 
212 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.48 
 
 
320 aa  55.8  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  24.49 
 
 
210 aa  55.5  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  24.65 
 
 
212 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13181  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.75 
 
 
320 aa  55.5  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.974044  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  24.24 
 
 
279 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1955  hypothetical protein  26.98 
 
 
276 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.862729  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  29.14 
 
 
214 aa  55.1  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.94 
 
 
211 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.3 
 
 
328 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  27.84 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.76 
 
 
350 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  28.75 
 
 
339 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.19 
 
 
218 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4454  hypothetical protein  24.88 
 
 
211 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16011  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.61 
 
 
324 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.975575  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.22 
 
 
320 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.39 
 
 
320 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>