More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_88824 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  47.15 
 
 		 1904 aa  1722    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  41.51 
 
 		 1769 aa  710    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  100 
 
 		 1901 aa  3908    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  39.73 
 
 		 1848 aa  1166    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11009  predicted protein  42.05 
 
 		 535 aa  404  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  37.5 
 
 		 1181 aa  356  2e-96  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  36.25 
 
 		 1087 aa  346  2e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  36.07 
 
 		 1077 aa  343  2e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.73 
 
 		 1139 aa  335  4e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.33 
 
 		 1082 aa  332  5.0000000000000004e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  35.58 
 
 		 1125 aa  332  6e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.52 
 
 		 1069 aa  330  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.59 
 
 		 1112 aa  329  4.0000000000000003e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 982 aa  328  8.000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  36.41 
 
 		 1071 aa  324  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  32.68 
 
 		 1003 aa  322  3e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  36.07 
 
 		 1068 aa  322  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  35.76 
 
 		 1068 aa  321  9e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.11 
 
 		 1261 aa  317  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  35 
 
 		 1068 aa  315  5.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  36.72 
 
 		 1090 aa  315  5.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.49 
 
 		 1091 aa  313  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  35.87 
 
 		 1031 aa  314  1e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  32.55 
 
 		 977 aa  313  2.9999999999999997e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  35.61 
 
 		 1091 aa  311  5e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  34.79 
 
 		 1178 aa  310  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  35.08 
 
 		 1067 aa  310  2.0000000000000002e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0205871 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  31.46 
 
 		 1021 aa  308  6e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  34.65 
 
 		 985 aa  308  9.000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  33.09 
 
 		 1055 aa  307  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  34 
 
 		 1161 aa  307  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  34.81 
 
 		 1070 aa  304  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  33.16 
 
 		 964 aa  304  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  34.92 
 
 		 1080 aa  303  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  34.1 
 
 		 1073 aa  302  4e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  35.42 
 
 		 1112 aa  302  4e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.16 
 
 		 1073 aa  302  5e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  34.45 
 
 		 1082 aa  302  5e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  34.07 
 
 		 1086 aa  301  6e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  34.3 
 
 		 1110 aa  301  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  34.45 
 
 		 1082 aa  301  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  34.1 
 
 		 1082 aa  301  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  34.81 
 
 		 1073 aa  300  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  31.68 
 
 		 959 aa  300  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  31.57 
 
 		 1193 aa  299  4e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  33.91 
 
 		 1259 aa  299  4e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  34.81 
 
 		 1073 aa  299  4e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  33.45 
 
 		 1150 aa  298  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  32.65 
 
 		 1078 aa  298  7e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  34.85 
 
 		 777 aa  298  9e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  33.69 
 
 		 1084 aa  297  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.22 
 
 		 1155 aa  297  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  31.28 
 
 		 991 aa  296  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  35.5 
 
 		 1082 aa  296  3e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  34.63 
 
 		 1073 aa  295  6e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  34.21 
 
 		 1222 aa  295  7e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.986183 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  33.46 
 
 		 1407 aa  295  8e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  33.92 
 
 		 1070 aa  294  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24775  predicted protein  36.09 
 
 		 711 aa  294  1e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  33.98 
 
 		 1069 aa  294  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  32.67 
 
 		 1250 aa  293  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  32 
 
 		 1084 aa  292  3e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.41 
 
 		 1129 aa  292  4e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  35.32 
 
 		 1558 aa  292  5.0000000000000004e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  32.19 
 
 		 1062 aa  291  7e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  34.2 
 
 		 1108 aa  291  7e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  34.49 
 
 		 621 aa  291  9e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  31.82 
 
 		 1084 aa  291  9e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  33.57 
 
 		 1064 aa  290  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  33.77 
 
 		 1566 aa  290  2e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  32.91 
 
 		 1113 aa  289  4e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  32.62 
 
 		 1064 aa  289  4e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  32.62 
 
 		 1064 aa  289  4e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  32.62 
 
 		 1064 aa  289  4e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  32.78 
 
 		 589 aa  289  4e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.91 
 
 		 1113 aa  289  4e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  32.62 
 
 		 1064 aa  289  4e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  32.62 
 
 		 1064 aa  289  4e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  33.92 
 
 		 872 aa  288  7e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  33.62 
 
 		 914 aa  288  8e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  32.62 
 
 		 1064 aa  288  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  31.56 
 
 		 1013 aa  287  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  33.39 
 
 		 1227 aa  286  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  33.39 
 
 		 1064 aa  286  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  32.69 
 
 		 1072 aa  286  2.0000000000000002e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  34.05 
 
 		 1066 aa  287  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.93 
 
 		 1048 aa  286  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  32.46 
 
 		 995 aa  286  2.0000000000000002e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  34.57 
 
 		 1031 aa  287  2.0000000000000002e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  33.04 
 
 		 1064 aa  286  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  32.53 
 
 		 918 aa  286  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1618  Snf2 family protein  33.63 
 
 		 1032 aa  285  7.000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  33.57 
 
 		 1068 aa  284  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  32.11 
 
 		 1134 aa  284  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  33.58 
 
 		 1431 aa  284  1e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  35.04 
 
 		 1088 aa  284  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  32.15 
 
 		 1069 aa  284  1e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  31.63 
 
 		 1068 aa  283  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  33.83 
 
 		 1111 aa  283  3e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  32.51 
 
 		 896 aa  283  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>