91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_70134 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_70134  predicted protein  100 
 
 		 526 aa  1090    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.927836  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06265  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12890)  49.52 
 
 		 535 aa  524  1e-147  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0715428  normal  0.295547 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40396  predicted protein  43.98 
 
 		 543 aa  412  1e-114  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00540  conserved hypothetical protein  39.78 
 
 		 624 aa  380  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15481  predicted protein  39.79 
 
 		 482 aa  362  1e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  27.74 
 
 		 1208 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.64 
 
 		 1652 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  25.24 
 
 		 782 aa  57.4  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.45 
 
 		 642 aa  57  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  24.05 
 
 		 1399 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  23.03 
 
 		 1477 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  22.22 
 
 		 1474 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01430  conserved hypothetical protein  22.28 
 
 		 712 aa  54.7  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  28.46 
 
 		 1363 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  22.71 
 
 		 1163 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  22.78 
 
 		 443 aa  53.5  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.35 
 
 		 792 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  23.82 
 
 		 1209 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  25.81 
 
 		 1831 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  23.29 
 
 		 1242 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  25.4 
 
 		 565 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  27.34 
 
 		 1901 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2599  WD-40 repeat protein  27.62 
 
 		 511 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.77 
 
 		 664 aa  51.2  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  25.33 
 
 		 1217 aa  50.8  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  27.6 
 
 		 1190 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  29.13 
 
 		 1304 aa  50.8  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.42 
 
 		 596 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29608  PolyAdenylation factor subunit 1  25.73 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275441  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1038  WD-40 repeat-containing protein  24.32 
 
 		 357 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.23 
 
 		 1481 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19081  WD-40 repeat-containing G-protein  24.32 
 
 		 358 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.352529  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  26.8 
 
 		 1364 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.23 
 
 		 1760 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  26.56 
 
 		 778 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.31 
 
 		 636 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  24.1 
 
 		 1229 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  23.75 
 
 		 1193 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  25.9 
 
 		 1348 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  26.51 
 
 		 1236 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  21.54 
 
 		 316 aa  48.1  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.46 
 
 		 692 aa  48.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  24.14 
 
 		 1553 aa  48.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  22.41 
 
 		 608 aa  47.8  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  21.76 
 
 		 316 aa  47.4  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11171  WD-40 repeat-containing G-protein  25.17 
 
 		 357 aa  47.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.194374 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  22.22 
 
 		 316 aa  47.4  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  30.83 
 
 		 1357 aa  47  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  22.64 
 
 		 342 aa  47  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  23.51 
 
 		 947 aa  47  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_2326  predicted protein  19.31 
 
 		 363 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.02 
 
 		 919 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  24.82 
 
 		 1188 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  21.66 
 
 		 1262 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  28.3 
 
 		 344 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  25.98 
 
 		 954 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  24.22 
 
 		 505 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  24.03 
 
 		 1552 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  24.87 
 
 		 1789 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  22.34 
 
 		 1161 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03960  WD-repeat protein, putative  27 
 
 		 622 aa  45.8  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  22.61 
 
 		 696 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  18.81 
 
 		 1196 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  25.66 
 
 		 891 aa  45.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.81 
 
 		 1868 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  24.48 
 
 		 335 aa  45.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  21.76 
 
 		 335 aa  45.1  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00940  transcription initiation factor tfiid 90 kda subunit (tafii-90), putative  23.12 
 
 		 813 aa  45.4  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.152566  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  20.78 
 
 		 1188 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3437  WD-40 repeat protein  22.57 
 
 		 1160 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.67443  normal  0.247289 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  21.13 
 
 		 1213 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  24.53 
 
 		 1176 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  20.57 
 
 		 756 aa  44.3  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  28.83 
 
 		 1484 aa  44.3  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  24.03 
 
 		 1523 aa  44.3  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.05 
 
 		 1711 aa  44.3  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  24.22 
 
 		 1161 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  29.13 
 
 		 1656 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0693  WD-40 repeat protein  22.32 
 
 		 363 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00188435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5293  cytochrome c class I  29.67 
 
 		 426 aa  43.9  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325519  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6487  WD-40 repeat-containing protein  24.18 
 
 		 780 aa  43.9  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  22.95 
 
 		 943 aa  43.9  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.59 
 
 		 608 aa  43.9  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  23.98 
 
 		 344 aa  43.9  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05530  RNA processing-related protein, putative  26.77 
 
 		 511 aa  43.9  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104569  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  22.68 
 
 		 577 aa  43.5  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0674  WD-40 repeat protein  22.32 
 
 		 363 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  33.85 
 
 		 774 aa  43.9  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.5 
 
 		 622 aa  43.5  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.2 
 
 		 576 aa  43.5  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  29.17 
 
 		 1427 aa  43.5  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>