More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_52110 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_52110  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  884    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  49.88 
 
 		 978 aa  361  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  45.43 
 
 		 1023 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  44.93 
 
 		 1018 aa  339  4e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  44.55 
 
 		 1049 aa  338  7e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  45.43 
 
 		 1016 aa  338  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  44.31 
 
 		 1015 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  44.94 
 
 		 1015 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  44.2 
 
 		 1015 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5225  aminotransferase class-III  46.19 
 
 		 427 aa  319  5e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0414  aminotransferase  44.94 
 
 		 416 aa  309  6.999999999999999e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  45.7 
 
 		 994 aa  306  6e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5426  aminotransferase class-III  43.8 
 
 		 442 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341099  normal  0.107268 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  39.75 
 
 		 1003 aa  293  4e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4610  hypothetical protein  40.34 
 
 		 977 aa  292  7e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.102283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4354  aminotransferase  40.63 
 
 		 427 aa  291  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  41.03 
 
 		 981 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  41.03 
 
 		 981 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  40.79 
 
 		 981 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  41.63 
 
 		 973 aa  289  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4205  hypothetical protein  40.64 
 
 		 973 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2224  aminotransferase class-III  42.68 
 
 		 434 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  41.22 
 
 		 970 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2538  aminotransferase class-III  42.93 
 
 		 434 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043195  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5395  aminotransferase, class III  40.29 
 
 		 970 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2095  hypothetical protein  39.85 
 
 		 967 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.174405 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1165  aminotransferase, class III  40.25 
 
 		 427 aa  281  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  41.38 
 
 		 975 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0048  aminotransferase class-III  40.33 
 
 		 458 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4934  hypothetical protein  40.05 
 
 		 970 aa  279  7e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2916  aminotransferase class-III  40.54 
 
 		 448 aa  279  8e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6010  hypothetical protein  42.05 
 
 		 974 aa  277  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4154  hypothetical protein  40.74 
 
 		 910 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1713  hypothetical protein  40.54 
 
 		 976 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3009  aminotransferase  43.63 
 
 		 443 aa  276  6e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2403  aminotransferase class-III  41.4 
 
 		 447 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.634591  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3725  hypothetical protein  40.49 
 
 		 976 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1546  aminotransferase class-III  40 
 
 		 448 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.634671  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3214  aminotransferase class-III  41.52 
 
 		 433 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4438  aminotransferase class-III  39.3 
 
 		 427 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0985724  normal  0.717239 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1796  aminotransferase class-III  41.03 
 
 		 436 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.904494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4943  hypothetical protein  40.25 
 
 		 966 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.870078  hitchhiker  0.0000072077 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2498  aminotransferase class-III  40.29 
 
 		 446 aa  271  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0067  aminotransferase class-III  40.1 
 
 		 447 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1957  aminotransferase class-III  43.07 
 
 		 436 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.796788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0312  aminotransferase  43.56 
 
 		 436 aa  259  7e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  40.58 
 
 		 448 aa  254  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5905  aminotransferase class-III  39.31 
 
 		 465 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1272  aminotransferase class-III  38.61 
 
 		 424 aa  248  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1377  aminotransferase  38.82 
 
 		 429 aa  246  6.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427783  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0982  aminotransferase class-III  42.33 
 
 		 436 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  36.39 
 
 		 437 aa  207  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3343  aminotransferase class-III  36.03 
 
 		 413 aa  203  5e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.65062 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07656  conserved hypothetical protein  31.55 
 
 		 452 aa  192  8e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.346872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5409  aminotransferase class-III  34.14 
 
 		 452 aa  190  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  32.29 
 
 		 461 aa  189  9e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0941  aminotransferase class-III  33.97 
 
 		 431 aa  187  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.224071  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4970  aminotransferase class-III  33.25 
 
 		 431 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.260445  normal  0.117498 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2675  aminotransferase  34.7 
 
 		 433 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  32.62 
 
 		 436 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0665  aminotransferase  35.1 
 
 		 433 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.459907 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  34.08 
 
 		 446 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4825  aminotransferase class-III  33.65 
 
 		 446 aa  184  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00475157  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  32.45 
 
 		 441 aa  184  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3362  aminotransferase class-III  35.1 
 
 		 433 aa  183  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5005  aminotransferase class-III  35.1 
 
 		 433 aa  183  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1896  aminotransferase class-III  31.81 
 
 		 432 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311328 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  31.41 
 
 		 444 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3669  aminotransferase class-III  33.33 
 
 		 443 aa  179  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.445293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4936  aminotransferase class-III  33.49 
 
 		 433 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5089  aminotransferase class-III  31.97 
 
 		 451 aa  178  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.447769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4418  aminotransferase class-III  33.49 
 
 		 433 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0107565 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5282  aminotransferase class-III  34.22 
 
 		 433 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5114  aminotransferase class-III  31 
 
 		 436 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2046  aminotransferase class-III  33.49 
 
 		 433 aa  177  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000254153 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  32.73 
 
 		 450 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3251  aminotransferase class-III  32.99 
 
 		 428 aa  175  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  33.33 
 
 		 457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  31.86 
 
 		 465 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5339  aminotransferase class-III  31.85 
 
 		 437 aa  173  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  33.09 
 
 		 436 aa  172  6.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02942  putrescine:2-oxoglutaric acid aminotransferase, PLP-dependent  31.86 
 
 		 468 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02892  hypothetical protein  31.86 
 
 		 459 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3255  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  31.86 
 
 		 429 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3540  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  31.86 
 
 		 429 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0627  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  31.86 
 
 		 429 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0628  putrescine aminotransferase  31.86 
 
 		 429 aa  172  9e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  29.47 
 
 		 454 aa  172  9e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4387  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  31.86 
 
 		 459 aa  172  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  29.47 
 
 		 479 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2613  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.36 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  32.6 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3367  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  31.86 
 
 		 429 aa  171  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  31.29 
 
 		 465 aa  170  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1947  aminotransferase  32.43 
 
 		 433 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  29.47 
 
 		 454 aa  170  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3575  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  32.6 
 
 		 459 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.328531 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1030  aminotransferase class-III  33.01 
 
 		 431 aa  169  8e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3405  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  32.35 
 
 		 459 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3479  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  32.35 
 
 		 459 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>