More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_36981 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011679  PHATR_36981  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
181 aa  374  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46448  predicted protein  34.92 
 
 
281 aa  83.6  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  36.73 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  29.55 
 
 
167 aa  67.4  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  32.71 
 
 
169 aa  63.2  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  30.84 
 
 
167 aa  63.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  30.84 
 
 
169 aa  62  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  31.19 
 
 
164 aa  62  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1110  heat shock protein Hsp20  30.95 
 
 
145 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.339847  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  29.25 
 
 
166 aa  60.8  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  33.02 
 
 
158 aa  59.7  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  32.67 
 
 
153 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  27.59 
 
 
185 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_54656  HSP20  32.31 
 
 
216 aa  59.7  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.222487  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  28.97 
 
 
168 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  29.41 
 
 
150 aa  59.7  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  27.59 
 
 
185 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  29.03 
 
 
168 aa  59.3  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  29.63 
 
 
173 aa  59.3  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  27.37 
 
 
145 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  27.59 
 
 
177 aa  58.9  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0593  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
191 aa  58.9  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.95349  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 
162 aa  58.2  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  28.47 
 
 
151 aa  57.8  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  28.47 
 
 
151 aa  57.8  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  27.37 
 
 
145 aa  57.8  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  26.32 
 
 
145 aa  57.8  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2063  heat shock protein Hsp20  36.27 
 
 
155 aa  57.4  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.21571  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  28.46 
 
 
147 aa  57  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  28.83 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  26.32 
 
 
145 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43797  predicted protein  28.8 
 
 
225 aa  57.4  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  30.21 
 
 
147 aa  57  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  26.62 
 
 
146 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  34.65 
 
 
162 aa  57  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10507  heat shock protein Hsp20/Hsp26, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10270)  33 
 
 
181 aa  57  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0988742 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  34.65 
 
 
162 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46447  predicted protein  30.21 
 
 
275 aa  56.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2401  heat shock protein Hsp20  30.51 
 
 
163 aa  56.6  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000662378  hitchhiker  0.00157329 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  26.67 
 
 
173 aa  57  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  27.93 
 
 
171 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  31.73 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  29.25 
 
 
172 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  30.21 
 
 
147 aa  55.8  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  30.19 
 
 
166 aa  56.2  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  30.3 
 
 
145 aa  55.5  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  28.95 
 
 
177 aa  55.5  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  28.44 
 
 
147 aa  55.5  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  30.61 
 
 
163 aa  55.5  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  27.43 
 
 
147 aa  55.1  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  30 
 
 
173 aa  55.5  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3917  heat shock protein Hsp20  29.91 
 
 
142 aa  55.1  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  26.09 
 
 
148 aa  55.1  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  28.45 
 
 
163 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4230  heat shock protein Hsp20  32.58 
 
 
105 aa  55.1  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2958  heat shock protein Hsp20  27.47 
 
 
142 aa  54.7  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  28.3 
 
 
165 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  26.42 
 
 
189 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  30.53 
 
 
149 aa  53.9  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
194 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0720  heat shock protein Hsp20  28.16 
 
 
120 aa  54.3  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00436062  normal  0.512737 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  26.47 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  25.47 
 
 
189 aa  53.9  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  29.51 
 
 
158 aa  53.9  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  30.43 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  25.58 
 
 
142 aa  53.9  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  28.85 
 
 
147 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3084  heat shock protein Hsp20  29.91 
 
 
147 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1343  HSP20 family protein  32.14 
 
 
135 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  29.77 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  27.52 
 
 
147 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3430  heat shock protein Hsp20  29.91 
 
 
147 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1631  heat shock protein Hsp20  24.47 
 
 
145 aa  53.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  24.53 
 
 
189 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  26.42 
 
 
166 aa  52.4  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  26.42 
 
 
166 aa  52.4  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  26.47 
 
 
156 aa  52.8  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  28.07 
 
 
149 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1806  heat shock protein Hsp20  27.36 
 
 
139 aa  52.8  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.332989  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
139 aa  52.4  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  30.39 
 
 
160 aa  52.4  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2008  HSP20 family protein  29.03 
 
 
122 aa  52  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.291255  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6091  heat shock protein Hsp20  28.16 
 
 
146 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  24.79 
 
 
142 aa  52.4  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  28.85 
 
 
185 aa  52  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  30.39 
 
 
160 aa  52.4  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6388  heat shock protein Hsp20  28.16 
 
 
146 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0687951 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  30.1 
 
 
151 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  31.37 
 
 
180 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  29.79 
 
 
166 aa  52  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3125  heat shock protein Hsp20  32.67 
 
 
149 aa  52  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1697  hypothetical protein  26.79 
 
 
145 aa  51.6  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  29.35 
 
 
162 aa  51.6  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1921  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
167 aa  51.6  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  28.09 
 
 
151 aa  51.2  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1098  heat shock protein Hsp20  35.8 
 
 
143 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.358342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6221  heat shock protein Hsp20  25.77 
 
 
151 aa  51.2  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1109  heat shock protein Hsp20  35.8 
 
 
143 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223131  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  24.53 
 
 
189 aa  50.8  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>