164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_15481 on replicon NC_011687
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_15481  predicted protein  100 
 
 
482 aa  1009    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70134  predicted protein  39.79 
 
 
526 aa  363  4e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.927836  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06265  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12890)  44.03 
 
 
535 aa  355  6.999999999999999e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0715428  normal  0.295547 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40396  predicted protein  39.63 
 
 
543 aa  352  7e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00540  conserved hypothetical protein  35.01 
 
 
624 aa  272  9e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03926  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08380)  26.52 
 
 
522 aa  64.7  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413219  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.8 
 
 
1163 aa  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  27.69 
 
 
1217 aa  63.9  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  26.98 
 
 
1901 aa  63.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  27.81 
 
 
954 aa  61.6  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  24.7 
 
 
1304 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  31.74 
 
 
1807 aa  61.6  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  26.04 
 
 
1363 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.87 
 
 
1760 aa  60.1  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.28 
 
 
642 aa  59.7  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2599  WD-40 repeat protein  23.48 
 
 
511 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.01 
 
 
664 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  30 
 
 
1474 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.57 
 
 
792 aa  57.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  22.76 
 
 
443 aa  57.4  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  22.43 
 
 
947 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02965  cell cycle regulatory protein (Srw1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08280)  26.71 
 
 
592 aa  57.4  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.76845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.51 
 
 
1039 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.51 
 
 
608 aa  57  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.67 
 
 
733 aa  56.6  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  24.19 
 
 
696 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  23.12 
 
 
1262 aa  56.2  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.95 
 
 
596 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  28.37 
 
 
1364 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.54 
 
 
677 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  30.95 
 
 
1188 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  26.63 
 
 
1399 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  22.09 
 
 
1242 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  35.35 
 
 
774 aa  55.1  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23 
 
 
1481 aa  54.3  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  24.82 
 
 
1190 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  31.76 
 
 
943 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  29.67 
 
 
1188 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  24.57 
 
 
578 aa  53.9  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  27.27 
 
 
782 aa  53.5  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  26.86 
 
 
1041 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  29.41 
 
 
1652 aa  53.5  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81799  substrate-specific activator of APC-dependent proteolysis  26.03 
 
 
592 aa  53.5  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0740559  normal  0.327492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.73 
 
 
692 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  23.15 
 
 
1348 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  25.37 
 
 
1523 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  31.25 
 
 
790 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  30.28 
 
 
1831 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.83 
 
 
576 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63551  predicted protein  29.25 
 
 
522 aa  52  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  27.61 
 
 
1208 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  26.13 
 
 
577 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  27.15 
 
 
1714 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0322  WD-40 repeat-containing protein  24.77 
 
 
872 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.73 
 
 
636 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  24.65 
 
 
1236 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.33 
 
 
682 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.86 
 
 
1557 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  21.23 
 
 
1868 aa  51.2  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_2326  predicted protein  30.86 
 
 
363 aa  51.2  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  29.67 
 
 
342 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  26.85 
 
 
1221 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  26.37 
 
 
687 aa  50.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  30.16 
 
 
464 aa  50.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2346  WD40 repeat, subgroup  27.83 
 
 
512 aa  50.8  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.881407  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  32.47 
 
 
564 aa  50.4  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  28.3 
 
 
742 aa  50.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  23.85 
 
 
1477 aa  50.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0693  WD-40 repeat protein  29.51 
 
 
363 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00188435  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  35.62 
 
 
565 aa  50.1  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  30.63 
 
 
1196 aa  50.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  28.83 
 
 
316 aa  50.1  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  28.83 
 
 
316 aa  50.1  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0674  WD-40 repeat protein  29.51 
 
 
363 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00940  transcription initiation factor tfiid 90 kda subunit (tafii-90), putative  22.71 
 
 
813 aa  49.7  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.152566  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  28.57 
 
 
778 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.15 
 
 
1711 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  21.83 
 
 
1510 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  31.73 
 
 
1427 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.29 
 
 
919 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  27.63 
 
 
344 aa  50.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  28.26 
 
 
434 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  25.29 
 
 
574 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  25.65 
 
 
1211 aa  48.9  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  28.33 
 
 
608 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  27.27 
 
 
589 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.36 
 
 
1823 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.72 
 
 
676 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  28.42 
 
 
1190 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  32.19 
 
 
1858 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  30 
 
 
1484 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  26.32 
 
 
1454 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  25.16 
 
 
1357 aa  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.1 
 
 
924 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  27.97 
 
 
728 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  21.15 
 
 
1330 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  22.17 
 
 
1213 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  29.49 
 
 
335 aa  47.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31385  predicted protein  28.47 
 
 
462 aa  47.8  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000357166  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03780  conserved hypothetical protein  26.85 
 
 
695 aa  47.8  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>