More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1322 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  100 
 
 		 531 aa  1053    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  66.6 
 
 		 506 aa  656    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  66.14 
 
 		 517 aa  665    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  99.25 
 
 		 531 aa  1047    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  75.25 
 
 		 529 aa  754    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  60.45 
 
 		 545 aa  603  1.0000000000000001e-171  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  60.87 
 
 		 520 aa  595  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  62.35 
 
 		 513 aa  587  1e-166  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  43.98 
 
 		 532 aa  435  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  48.3 
 
 		 529 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  48.16 
 
 		 516 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  47.46 
 
 		 529 aa  404  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0145  small GTP-binding protein domain-containing protein  47.21 
 
 		 517 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07771  GTPase SAR1 and related small G proteins  46.98 
 
 		 517 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0362439 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  35.16 
 
 		 499 aa  288  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  36.86 
 
 		 499 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.51 
 
 		 499 aa  276  5e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  34.43 
 
 		 496 aa  275  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  29.65 
 
 		 471 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  29.3 
 
 		 472 aa  177  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0732  hypothetical protein  27.68 
 
 		 481 aa  171  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00108673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  28.08 
 
 		 492 aa  164  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.13 
 
 		 472 aa  156  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2529  hypothetical protein  30.67 
 
 		 475 aa  155  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  28.97 
 
 		 453 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  32.13 
 
 		 475 aa  150  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  26.64 
 
 		 463 aa  150  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  29.83 
 
 		 566 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3579  hypothetical protein  26.41 
 
 		 463 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  28.15 
 
 		 489 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  28.47 
 
 		 448 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  28.23 
 
 		 448 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0764  GTP-binding protein HSR1-related  28.29 
 
 		 469 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  30.59 
 
 		 462 aa  135  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  29.95 
 
 		 479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  29.95 
 
 		 479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.39 
 
 		 492 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  28.35 
 
 		 484 aa  122  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.65 
 
 		 457 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  29.33 
 
 		 481 aa  118  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0993  hypothetical protein  26.26 
 
 		 459 aa  106  9e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.455493 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  24.29 
 
 		 440 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  27.72 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  23.93 
 
 		 440 aa  104  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  25.07 
 
 		 420 aa  103  6e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.03 
 
 		 431 aa  100  8e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0942  hypothetical protein  34.43 
 
 		 409 aa  86.3  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16461  GTPase SAR1  20.92 
 
 		 413 aa  80.1  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04921  GTPase SAR1  28.03 
 
 		 441 aa  80.1  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1041  hypothetical protein  33.04 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16341  GTPase SAR1 and related small G protein  22.12 
 
 		 413 aa  76.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10501  hypothetical protein  28.99 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.546761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18671  hypothetical protein  33.33 
 
 		 454 aa  74.3  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0036  hypothetical protein  28.24 
 
 		 451 aa  72.8  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06561  hypothetical protein  28.24 
 
 		 451 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0586116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16231  GTPase SAR1 and related small G proteins  23.94 
 
 		 413 aa  66.6  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.283634  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06561  hypothetical protein  26.57 
 
 		 444 aa  65.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06261  hypothetical protein  26.42 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.307417  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0600  hypothetical protein  29.7 
 
 		 444 aa  63.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1806  GTP-binding protein Era  32.87 
 
 		 297 aa  62.8  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0584484  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1260  tRNA modification GTPase TrmE  27.23 
 
 		 449 aa  62  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06651  hypothetical protein  27.48 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.19344  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1537  small GTP-binding protein domain-containing protein  20.7 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  34.04 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  29.73 
 
 		 468 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0042  small GTP-binding protein  30.95 
 
 		 400 aa  59.7  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0208  GTP-binding protein Era  31.29 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1570  GTP-binding protein Era  31.82 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  27.67 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2875  GTP-binding protein Era  29.45 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158281 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  34.46 
 
 		 548 aa  58.2  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4891  putative GTPase  31.5 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3346  putative GTPase  31.5 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1393  putative GTPase  31.5 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2138  putative GTPase  31.5 
 
 		 290 aa  57  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2251  putative GTPase  31.5 
 
 		 290 aa  57  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1071  putative GTPase  32.28 
 
 		 290 aa  57  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0467468 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  28.98 
 
 		 461 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3856  GTP-binding protein Era  27.95 
 
 		 308 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00601446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3777  GTP-binding protein Era  30.23 
 
 		 295 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  29.17 
 
 		 589 aa  55.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6543  GTP-binding protein Era  27.68 
 
 		 289 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  36.77 
 
 		 460 aa  56.2  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  33.86 
 
 		 447 aa  55.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  36.64 
 
 		 427 aa  55.5  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1683  labile enterotoxin output A  26.15 
 
 		 568 aa  55.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4310  tRNA modification GTPase TrmE  30.99 
 
 		 460 aa  54.7  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671502  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  29.41 
 
 		 546 aa  54.3  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2472  tRNA modification GTPase TrmE  34.83 
 
 		 487 aa  54.3  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000689916 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  34.81 
 
 		 461 aa  54.7  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  32.58 
 
 		 425 aa  54.3  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  30.17 
 
 		 398 aa  53.9  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3074  GTP-binding protein Era  29.34 
 
 		 298 aa  54.3  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  32.95 
 
 		 460 aa  53.9  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3433  GTP-binding protein HSR1-related  32.69 
 
 		 291 aa  53.5  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1141  GTP-binding protein Era  31.9 
 
 		 296 aa  53.5  0.000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1851  GTP-binding protein Era  31.78 
 
 		 309 aa  53.5  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  31.67 
 
 		 404 aa  53.5  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  35 
 
 		 416 aa  53.5  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  31.67 
 
 		 404 aa  53.5  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>