More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4663 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0710  Radical SAM domain protein  83.42 
 
 		 388 aa  676    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4663  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 381 aa  798    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0193587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0683  Radical SAM domain protein  83.68 
 
 		 388 aa  679    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4990  radical SAM family protein  76.9 
 
 		 386 aa  590  1e-167  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.396764  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2695  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 423 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0390  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.46 
 
 		 380 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.52753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.22 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  24.21 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  25.94 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  23.51 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  27.12 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  29.07 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  30.17 
 
 		 359 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  32.14 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  25.34 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  26.63 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4391  Radical SAM domain protein  32.17 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  27.06 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  29.73 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  27.81 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0790  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.46 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2446  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.46 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.121554  normal  0.0228236 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  22.62 
 
 		 418 aa  67.4  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  24.86 
 
 		 422 aa  67  0.0000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  27.5 
 
 		 496 aa  66.6  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.04 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  25.55 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  21.4 
 
 		 491 aa  64.3  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  25.55 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  26.99 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  29.19 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1814  radical SAM domain-containing protein  23.69 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  26.29 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  24.79 
 
 		 476 aa  63.2  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  25.44 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2921  radical SAM domain-containing protein  23.26 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.925202  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  27.46 
 
 		 491 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  27.22 
 
 		 394 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.04 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601943  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  26.7 
 
 		 333 aa  62.8  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  24.85 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  26.16 
 
 		 347 aa  62.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  29.31 
 
 		 389 aa  62.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  26.35 
 
 		 479 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0919  radical SAM domain-containing protein  24.05 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  27.4 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  21.61 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  27.37 
 
 		 501 aa  61.6  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  24.08 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0429  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 		 324 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2352  radical SAM family protein  28.65 
 
 		 487 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  24.77 
 
 		 476 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  24.26 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  28 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  30.19 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1392  Radical SAM domain protein  26.47 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.358724 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17970  predicted Fe-S oxidoreductase  28.05 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  27.67 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2033  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.18 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  31.76 
 
 		 543 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  24.77 
 
 		 476 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  22.89 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  24.77 
 
 		 476 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1486  radical SAM family protein  31.85 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  23.64 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  28.49 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1978  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.633092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  25.71 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 491 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  25.29 
 
 		 491 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 491 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 491 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 491 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 491 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2456  coenzyme PQQ biosynthesis protein E  25.98 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  28.38 
 
 		 394 aa  59.3  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 491 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  23.87 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 491 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3419  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  33.91 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058581  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0260  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.69 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.916365 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  21.26 
 
 		 346 aa  59.3  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  28.17 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  25.5 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24 
 
 		 373 aa  59.3  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  29.69 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  27.65 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  21.92 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  23.31 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  26.04 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5552  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  26.92 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6304  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.74 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  19.84 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  21.79 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  26.75 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.77 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>