More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3363 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3363  WD-40 repeat protein  100 
 
 
826 aa  1684    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  42.24 
 
 
778 aa  569  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  38.51 
 
 
774 aa  504  1e-141  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2183  WD-40 repeat protein  39.6 
 
 
772 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2135  WD-40 repeat protein  39.6 
 
 
772 aa  469  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  33.68 
 
 
929 aa  254  4.0000000000000004e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  33.48 
 
 
802 aa  249  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  37.54 
 
 
1523 aa  235  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  41.58 
 
 
1364 aa  219  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  38.14 
 
 
1363 aa  214  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.84 
 
 
677 aa  212  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  36.52 
 
 
1454 aa  211  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  34.34 
 
 
1652 aa  207  9e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  36.77 
 
 
1163 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.15 
 
 
676 aa  204  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  35.03 
 
 
1868 aa  203  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.18 
 
 
1240 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.09 
 
 
576 aa  196  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  36.71 
 
 
696 aa  196  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  36.95 
 
 
1221 aa  194  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.31 
 
 
792 aa  194  8e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.46 
 
 
1686 aa  193  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  35.15 
 
 
1789 aa  191  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  36.33 
 
 
1416 aa  191  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  38.95 
 
 
1443 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  37.93 
 
 
1236 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  35.76 
 
 
947 aa  188  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.39 
 
 
682 aa  189  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.39 
 
 
1760 aa  187  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  35.4 
 
 
657 aa  186  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.8 
 
 
1557 aa  185  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  33.56 
 
 
1188 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  31.5 
 
 
1190 aa  184  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  35.53 
 
 
589 aa  183  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  32.57 
 
 
1474 aa  182  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  34.83 
 
 
434 aa  181  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  34.72 
 
 
1196 aa  181  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  34.81 
 
 
1193 aa  181  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  34.98 
 
 
505 aa  179  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.63 
 
 
692 aa  178  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  34.81 
 
 
1599 aa  175  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  33.6 
 
 
1214 aa  175  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.47 
 
 
698 aa  173  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  32.69 
 
 
687 aa  173  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  33.56 
 
 
919 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  34.1 
 
 
346 aa  172  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  33.81 
 
 
728 aa  171  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  31.55 
 
 
1213 aa  171  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  35.02 
 
 
1280 aa  170  9e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  29.21 
 
 
1188 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  32.88 
 
 
1211 aa  170  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  31.12 
 
 
1247 aa  168  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  32.65 
 
 
1831 aa  167  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.1 
 
 
1481 aa  167  9e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  32.78 
 
 
1357 aa  167  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  32.77 
 
 
1510 aa  166  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  40.1 
 
 
740 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.1 
 
 
1711 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.89 
 
 
630 aa  165  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  39.68 
 
 
443 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  33.45 
 
 
1553 aa  163  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.4 
 
 
596 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  34.24 
 
 
344 aa  163  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2147  WD-40 repeat-containing protein  38.71 
 
 
589 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.631992 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.76 
 
 
608 aa  162  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  36.82 
 
 
1661 aa  162  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.85 
 
 
664 aa  160  8e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  33.22 
 
 
344 aa  160  9e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.58 
 
 
1598 aa  160  9e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  33.21 
 
 
742 aa  160  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.77 
 
 
930 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  36.33 
 
 
540 aa  160  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  39.6 
 
 
790 aa  159  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  30.91 
 
 
578 aa  159  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.74 
 
 
1609 aa  159  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.6 
 
 
1267 aa  159  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  32.3 
 
 
1242 aa  158  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  34.22 
 
 
464 aa  157  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  34.26 
 
 
577 aa  157  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.84 
 
 
716 aa  156  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2798  WD40 domain-containing protein  37.1 
 
 
597 aa  156  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.99 
 
 
1583 aa  156  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.31 
 
 
1262 aa  155  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  29.08 
 
 
1878 aa  153  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.21 
 
 
1599 aa  153  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  31.49 
 
 
1176 aa  152  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  30.22 
 
 
1714 aa  152  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  31.74 
 
 
675 aa  150  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  35.41 
 
 
1858 aa  150  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  32.87 
 
 
1217 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  28 
 
 
1552 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.91 
 
 
1607 aa  149  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  29.08 
 
 
1484 aa  148  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  31.96 
 
 
924 aa  149  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.04 
 
 
1623 aa  148  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  30.42 
 
 
1229 aa  147  8.000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.6 
 
 
636 aa  147  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3581  WD40 domain-containing protein  36.33 
 
 
334 aa  146  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  31.1 
 
 
1161 aa  147  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  31.19 
 
 
335 aa  147  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>