133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0491 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  100 
 
 		 440 aa  887    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  61.11 
 
 		 425 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  62.32 
 
 		 425 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  46.71 
 
 		 508 aa  366  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  53.87 
 
 		 504 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  54.22 
 
 		 423 aa  346  6e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  46.36 
 
 		 468 aa  315  9.999999999999999e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  51.8 
 
 		 375 aa  300  4e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  49.65 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  50.37 
 
 		 442 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  35.93 
 
 		 388 aa  219  6e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08971  putative beta-lactamase  36.04 
 
 		 386 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.712716 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1950  beta-lactamase family protein  37.91 
 
 		 381 aa  206  5e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0697  putative beta-lactamase  36.01 
 
 		 357 aa  203  4e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15311  putative beta-lactamase  34.93 
 
 		 357 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.709796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  36.66 
 
 		 356 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  27.08 
 
 		 576 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  29.1 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  27.24 
 
 		 803 aa  99.8  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  26.19 
 
 		 274 aa  96.3  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  26.36 
 
 		 323 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.14 
 
 		 422 aa  93.2  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  25.37 
 
 		 286 aa  90.9  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  25.91 
 
 		 349 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  28.97 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  30.74 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  27.68 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  26.39 
 
 		 292 aa  79.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3212  beta-lactamase  25.26 
 
 		 304 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184009 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  25.4 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  29.27 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  29.27 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  27.73 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  28.16 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0182  beta-lactamase  36.28 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689531 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0725  Beta-lactamase class A-like protein  28.64 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.725916  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  25.76 
 
 		 315 aa  67  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0228  twin-arginine translocation pathway signal  29.24 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2728  Beta-lactamase  31.46 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0079236  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  27.41 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4021  Beta-lactamase  28 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0183  Beta-lactamase  26.09 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2352  Beta-lactamase  27.38 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445844 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2552  Beta-lactamase  27.23 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802917  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  29.18 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  34.34 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0195  Beta-lactamase  26.76 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.210334  normal  0.167544 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1931  Beta-lactamase  27.55 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0174  Beta-lactamase  24.61 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0788  beta-lactamase  23.95 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0130  beta-lactamase TEM  27.23 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1580  beta-lactamase TEM  27.23 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.262835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0046  beta-lactamase TEM  27.23 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00171312  normal  0.356541 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  28.78 
 
 		 293 aa  57  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0003  beta-lactamase  27.52 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000347481  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1390  Beta-lactamase  27.69 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585114  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0978  Beta-lactamase  25.23 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2328  Beta-lactamase  24.3 
 
 		 296 aa  55.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03960  hypothetical protein  35.65 
 
 		 453 aa  56.2  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1476  hypothetical protein  21.29 
 
 		 496 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1446  beta-lactamase related protein  21.89 
 
 		 320 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1529  Beta-lactamase  24.3 
 
 		 296 aa  55.1  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1011  beta-lactamase  27.51 
 
 		 290 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0351  beta-lactamase  28.8 
 
 		 296 aa  53.9  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.154712 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1080  Beta-lactamase  25.33 
 
 		 301 aa  54.3  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0392714  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0594  Beta-lactamase  27.33 
 
 		 296 aa  53.9  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.272363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1381  class A beta-lactamase  27.35 
 
 		 314 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0489957  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1460  Beta-lactamase  25.2 
 
 		 334 aa  53.5  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829053 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2749  Beta-lactamase  27.06 
 
 		 281 aa  53.5  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2827  Beta-lactamase  27.06 
 
 		 281 aa  53.5  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.940774  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33460  hypothetical protein  29.2 
 
 		 424 aa  53.5  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2020  beta-lactamase  28.75 
 
 		 319 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1435  Beta-lactamase  28.69 
 
 		 288 aa  53.1  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0855  Beta-lactamase  25.3 
 
 		 296 aa  53.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689397  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3523  Beta-lactamase  24.58 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1301  class A beta-lactamase  27.35 
 
 		 314 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2421  Beta-lactamase  26.85 
 
 		 310 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000915272  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2580  Beta-lactamase  28.42 
 
 		 300 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000559373  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2102  twin-arginine translocation pathway signal  26.42 
 
 		 296 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0733882  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4752  putative lipoprotein LpqF  39.47 
 
 		 443 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2148  Beta-lactamase  26.42 
 
 		 296 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748404  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4838  putative lipoprotein LpqF  39.47 
 
 		 443 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5138  putative lipoprotein LpqF  39.47 
 
 		 443 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001392  beta-lactamase  25.98 
 
 		 283 aa  51.2  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000730239  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4439  putative Beta-lactamase  27.27 
 
 		 288 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0997  Beta-lactamase  26.5 
 
 		 304 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2553  beta-lactamase  26.92 
 
 		 309 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0257  class A beta-lactamase  26.92 
 
 		 314 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0527  class A beta-lactamase  26.92 
 
 		 314 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.29059  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1040  class A beta-lactamase  26.92 
 
 		 314 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.257126  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3317  beta-lactamase class A-like protein  37.37 
 
 		 429 aa  50.4  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.313271  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5163  Beta-lactamase  28.2 
 
 		 322 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0157119 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1041  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.31 
 
 		 258 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2085  Beta-lactamase  26.12 
 
 		 296 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11921 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0446  Beta-lactamase  28.08 
 
 		 297 aa  50.1  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1855  Peptidoglycan-binding LysM  32 
 
 		 414 aa  50.1  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1283  class A beta-lactamase  26.92 
 
 		 295 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.162345  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2215  beta-lactamase  25.5 
 
 		 290 aa  49.3  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296886  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1979  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.45 
 
 		 291 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.492177  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5706  Beta-lactamase  27.65 
 
 		 327 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338924  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>