More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_01860 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  100 
 
 		 331 aa  635    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  93.35 
 
 		 331 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  59.28 
 
 		 328 aa  315  6e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  49.23 
 
 		 329 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  47.87 
 
 		 326 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  46.67 
 
 		 328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  47.53 
 
 		 326 aa  245  8e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  47.53 
 
 		 326 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  40.43 
 
 		 324 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  40.43 
 
 		 324 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  40.88 
 
 		 350 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  39.25 
 
 		 327 aa  160  3e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  38.36 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2623  anti-FecI sigma factor, FecR  38.17 
 
 		 329 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.539768  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  35.76 
 
 		 320 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  35.37 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  37.38 
 
 		 338 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  33.03 
 
 		 337 aa  137  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  36.73 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  35.93 
 
 		 301 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  37.85 
 
 		 317 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  36.25 
 
 		 317 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  33.95 
 
 		 319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  35.76 
 
 		 320 aa  132  6.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  35.99 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4378  putative FecR  33.55 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.620498  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  34.85 
 
 		 334 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  36.22 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  33.12 
 
 		 327 aa  129  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  37.46 
 
 		 328 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  37.05 
 
 		 335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2233  putative FecR  30.82 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.761744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  37.28 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  33.33 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  34.9 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  37.65 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  37.27 
 
 		 309 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  35.42 
 
 		 329 aa  123  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1718  putative transmembrane sensor  38.54 
 
 		 329 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  32.8 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1007  anti-FecI sigma factor, FecR  34.8 
 
 		 351 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.737355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40930  Anti-sigma factor protein, FecR family  35.16 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868078  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  33.23 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  32.27 
 
 		 342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  36.18 
 
 		 307 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  33.01 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1006  anti-FecI sigma factor, FecR  34.46 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64690  putative transmembrane sensor  36.73 
 
 		 340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0240897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  34.16 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  35.14 
 
 		 316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  35.13 
 
 		 313 aa  116  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  27.96 
 
 		 350 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  32.8 
 
 		 320 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  31.71 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  34.38 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  34.29 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  31.19 
 
 		 317 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2103  anti-FecI sigma factor, FecR  32.55 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.678011 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0481  putative FecR  34.11 
 
 		 327 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.133336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  35.71 
 
 		 320 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  37.58 
 
 		 327 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  29.63 
 
 		 336 aa  112  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  38.31 
 
 		 316 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3127  putative FecR  30.48 
 
 		 326 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.892412  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4217  anti-FecI sigma factor, FecR  32.91 
 
 		 320 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  37.04 
 
 		 327 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0878  putative FecR  35.62 
 
 		 330 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1360  putative FecR  35.62 
 
 		 330 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690627  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2206  putative FecR  31.35 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.964925  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  33.23 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  35.17 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  31.41 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1630  putative FecR  32.7 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1044  anti-FecI sigma factor, FecR  34.1 
 
 		 320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2218  Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  32.74 
 
 		 326 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108208  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  33.11 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  32.99 
 
 		 323 aa  109  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  38.58 
 
 		 320 aa  109  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  32.48 
 
 		 314 aa  109  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  34.18 
 
 		 318 aa  109  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  42.49 
 
 		 268 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  33.12 
 
 		 321 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2780  anti-FecI sigma factor, FecR  34.71 
 
 		 320 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  32.16 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0996  anti-FecI sigma factor, FecR  28.92 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0734  anti-FecI sigma factor, FecR  29.54 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721156 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  30.34 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  31.13 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4834  transmembrane sensor  33.02 
 
 		 322 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895358  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4484  anti-FecI sigma factor, FecR  28.93 
 
 		 310 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.656085 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2904  putative FecR  30.06 
 
 		 327 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0184634  normal  0.161194 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  30.79 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4503  putative FecR  35.1 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0323465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21540  Anti-sigma factor, FecR family  40.69 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  29.72 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  34.08 
 
 		 320 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  32.59 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0733  anti-FecI sigma factor, FecR  29.57 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  36.32 
 
 		 344 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  33.81 
 
 		 327 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>