More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3838 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0446  alanyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 871 aa  653    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1560  alanyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 953 aa  687    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80417  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2535  alanyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 900 aa  639    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3838  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 937 aa  1930    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894742 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1383  alanyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 		 942 aa  759    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0477098  hitchhiker  0.00263773 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2668  alanyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 888 aa  661    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1952  alanyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 887 aa  653    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.491503  normal  0.143708 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0369  alanyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 886 aa  655    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.134799  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 876 aa  642    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5667  alanyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 		 886 aa  644    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 864 aa  646    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0578  alanyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 879 aa  636    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0330  alanyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 886 aa  695    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.43097  normal  0.0181617 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0206  alanyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 888 aa  654    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1446  alanyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 877 aa  670    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.714674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0302  alanyl-tRNA synthetase  42.84 
 
 		 885 aa  686    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.125416 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 		 885 aa  649    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0243  alanyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 888 aa  684    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1246  alanyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 		 876 aa  634  1e-180  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 874 aa  633  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0127  alanyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 877 aa  632  1e-180  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0445567  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 878 aa  633  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2378  alanyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 890 aa  632  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1894  alanyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 879 aa  631  1e-179  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1289  alanyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 865 aa  630  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 		 874 aa  629  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3035  alanyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 		 948 aa  628  1e-178  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12081  normal  0.0855444 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  39.87 
 
 		 869 aa  628  1e-178  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 874 aa  625  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 		 876 aa  623  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 874 aa  625  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 		 875 aa  620  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 876 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00147  alanyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 		 882 aa  621  1e-176  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328967  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  39.28 
 
 		 876 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1670  alanyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 872 aa  621  1e-176  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0590  alanyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 876 aa  620  1e-176  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 		 876 aa  622  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  39.28 
 
 		 876 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2903  alanyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 892 aa  621  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0357783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 		 876 aa  622  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 876 aa  620  1e-176  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 		 876 aa  617  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 		 876 aa  617  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 		 876 aa  617  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 		 876 aa  617  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 		 876 aa  616  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  38.96 
 
 		 876 aa  617  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 876 aa  619  1e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 		 876 aa  617  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 		 865 aa  617  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 		 876 aa  616  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 874 aa  616  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04755  alanyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 870 aa  616  1e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.604916  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 874 aa  615  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3904  alanyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 904 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.639044  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 874 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1979  alanyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 		 874 aa  615  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002521  alanyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 860 aa  615  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3925  alanyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 905 aa  614  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.013428  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 		 876 aa  615  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 892 aa  613  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 877 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 874 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1779  alanyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 		 874 aa  615  9.999999999999999e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 877 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 		 867 aa  611  1e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 863 aa  611  1e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3556  alanyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 899 aa  612  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 		 874 aa  612  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4275  alanyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 874 aa  609  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0551773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 		 860 aa  611  1e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 		 875 aa  612  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 		 884 aa  611  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  38.29 
 
 		 876 aa  611  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 897 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3839  alanyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 905 aa  612  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.538554  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 897 aa  611  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3339  alanyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 874 aa  610  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0101035  hitchhiker  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 874 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 874 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 897 aa  609  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 881 aa  606  9.999999999999999e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02846  alanyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 865 aa  607  9.999999999999999e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.12148  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 874 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 874 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3979  alanyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 		 897 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.567891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1478  alanyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 882 aa  608  9.999999999999999e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.734898  normal  0.362746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4474  alanyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 		 874 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41358  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1441  alanyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 		 897 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34460  alanyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 874 aa  603  1.0000000000000001e-171  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440747  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3635  alanyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 889 aa  603  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.988674  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 874 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 		 905 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 875 aa  602  1.0000000000000001e-171  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0635  alanyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 860 aa  602  1e-170  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.427199  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 865 aa  600  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 874 aa  602  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2910  alanyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 878 aa  599  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.70978 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 874 aa  601  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>