82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3602 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3602  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 345 aa  710    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.310162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0610  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.34 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.313511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  28.66 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6164  hypothetical protein  28.66 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0345463 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  28.03 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  28.03 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4485  putative ComL lipoprotein  32.59 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0330  putative lipoprotein  29.01 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654849  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2552  Acyl-(acyl-carrier-protein)--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  27.78 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0201598  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4038  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.39 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.890375  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3100  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.34 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.425844  normal  0.735542 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2327  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 		 1023 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.930727  normal  0.708749 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0792  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.559205 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2117  putative ComL lipoprotein  27.71 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.329697  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0679  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.21 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.755098  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.78 
 
 		 301 aa  53.9  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.896668  normal  0.816885 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3162  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.22 
 
 		 319 aa  53.9  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0702  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 		 278 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0835  hypothetical protein  22.97 
 
 		 318 aa  53.5  0.000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.903395  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3430  tetratricopeptide domain-containing protein  26.74 
 
 		 258 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1371  competence lipoprotein ComL  29.89 
 
 		 256 aa  53.1  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2430  DNA uptake lipoprotein  25.45 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.233746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  27.52 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2951  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.17 
 
 		 248 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1052  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 		 1019 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273667 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0501  putative lipoprotein  28.83 
 
 		 254 aa  50.1  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  24.84 
 
 		 299 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  26.11 
 
 		 264 aa  48.1  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1975  TPR repeat-containing protein  24.28 
 
 		 266 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  24.22 
 
 		 298 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2072  hypothetical protein  27.67 
 
 		 288 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986938 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0073  DNA uptake lipoprotein-like  31.87 
 
 		 497 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1999  putative lipoprotein  24.84 
 
 		 288 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2068  DNA uptake lipoprotein-like protein  24.42 
 
 		 276 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.484771 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  24.22 
 
 		 325 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  25.48 
 
 		 287 aa  47.8  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  27.27 
 
 		 289 aa  47.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  25.48 
 
 		 287 aa  47.8  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1906  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  21.47 
 
 		 244 aa  46.6  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000817715  normal  0.423153 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0716  transmembrane protein  26.74 
 
 		 261 aa  46.6  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000618184  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0551  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.22 
 
 		 1001 aa  46.6  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.874554  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2414  hypothetical protein  28.06 
 
 		 279 aa  46.2  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00110974  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0755  DNA uptake lipoprotein-like protein  28.74 
 
 		 315 aa  46.2  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0691  competence lipoprotein ComL, putative  28.37 
 
 		 283 aa  46.2  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0174924  decreased coverage  0.000229911 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1920  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.35 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177047  normal  0.0296003 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3014  putative lipoprotein  28.07 
 
 		 249 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.6887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2843  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.64 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0736024  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0812  hypothetical protein  26.89 
 
 		 254 aa  45.8  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.391537  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2584  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.64 
 
 		 281 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2055  DNA uptake lipoprotein-like protein  22.86 
 
 		 255 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000188643  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2347  putative competence lipoprotein, ComL  25.75 
 
 		 286 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0433334 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.35 
 
 		 285 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525454  decreased coverage  0.00850682 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2348  putative lipoprotein  22.98 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1603  putative competence lipoprotein precursor  24.85 
 
 		 257 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  25.15 
 
 		 261 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1840  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.15 
 
 		 286 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0444128  normal  0.143398 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2489  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.14 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.318868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0941  competence lipoprotein ComL, putative  22.81 
 
 		 292 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00347404  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1732  DNA uptake lipoprotein  22.93 
 
 		 268 aa  44.3  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0966  putative competence lipoprotein, ComL  25.3 
 
 		 285 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1139  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.35 
 
 		 237 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.992241  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2236  putative lipoprotein  22.99 
 
 		 253 aa  44.3  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0070  hypothetical protein  26.67 
 
 		 272 aa  43.9  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3496  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  24.2 
 
 		 288 aa  43.9  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.24524 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1857  competence lipoprotein  20.96 
 
 		 293 aa  43.9  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0071  tol-pal system protein YbgF  26.67 
 
 		 272 aa  43.9  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.840894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1613  putative competence lipoprotein precursor  25.58 
 
 		 267 aa  43.9  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  24.43 
 
 		 777 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0809  putative competence lipoprotein precursor  25.42 
 
 		 281 aa  43.5  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0753158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  26.05 
 
 		 250 aa  43.9  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1919  putative lipoprotein  20.96 
 
 		 293 aa  43.5  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.527039  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 264 aa  43.5  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2383  TPR domain-containing protein  22.4 
 
 		 245 aa  43.5  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.28487e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3512  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.84 
 
 		 262 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256611  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0772  lipoprotein, ComL family  24.55 
 
 		 272 aa  43.1  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  26.35 
 
 		 271 aa  43.1  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0400  putative lipoprotein  22.97 
 
 		 246 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3448  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.84 
 
 		 262 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1193  competence lipoprotein ComL  24.55 
 
 		 255 aa  42.7  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2315  putative transmembrane protein  26.04 
 
 		 268 aa  42.7  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04874  competence lipoprotein  23.95 
 
 		 277 aa  42.7  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25 
 
 		 1000 aa  42.7  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>