170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0073 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0073  DNA uptake lipoprotein-like  100 
 
 		 497 aa  1014    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2951  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.18 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01439  Competence lipoprotein ComL  25.58 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2851  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.35 
 
 		 243 aa  67  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3266  putative lipoprotein  26.91 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3162  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.02 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.47 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  26.41 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2055  DNA uptake lipoprotein-like protein  26.07 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000188643  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  25.32 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  25.33 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1334  putative lipoprotein  25.56 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000708503  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2643  TPR repeat-containing protein  24.57 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1573  DNA uptake lipoprotein-like protein  24.37 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000680472  hitchhiker  0.00723568 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0941  competence lipoprotein ComL, putative  23.56 
 
 		 292 aa  62.8  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00347404  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0923  putative competence protein ComL  28.65 
 
 		 219 aa  63.2  0.00000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3352  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.69 
 
 		 243 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.527935  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3478  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.69 
 
 		 243 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.377875 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3215  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.69 
 
 		 243 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00228309  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1999  putative lipoprotein  23.67 
 
 		 288 aa  62.4  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  26.99 
 
 		 261 aa  62.4  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2072  hypothetical protein  26.42 
 
 		 288 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986938 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3612  competence lipoprotein ComL, putative  26.51 
 
 		 280 aa  62.4  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.622629  hitchhiker  0.00362624 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  24.8 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  26.32 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1919  putative lipoprotein  24.57 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.527039  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6164  hypothetical protein  29.36 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0345463 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1857  competence lipoprotein  24.14 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2414  hypothetical protein  25.93 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00110974  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0812  hypothetical protein  24.08 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.391537  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1060  putative lipoprotein  30.08 
 
 		 298 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.648337 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.47 
 
 		 273 aa  59.7  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.349753  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1001  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26 
 
 		 243 aa  59.7  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.742484  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3430  tetratricopeptide domain-containing protein  24.21 
 
 		 258 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3500  putative lipoprotein  25.22 
 
 		 282 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.538329  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2383  TPR domain-containing protein  28.04 
 
 		 245 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.28487e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3128  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  24.06 
 
 		 269 aa  58.9  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2551  putative lipoprotein  26.67 
 
 		 254 aa  58.9  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00873964  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2236  putative lipoprotein  25.23 
 
 		 253 aa  59.3  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3160  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  21.03 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2748  competence lipoprotein ComL, putative  27.03 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  25.2 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4038  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.83 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.890375  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04874  competence lipoprotein  21.7 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0699  DNA uptake lipoprotein-like protein  24.47 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1829  putative transmembrane protein  32.97 
 
 		 300 aa  57  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0739498  normal  0.248165 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0755  DNA uptake lipoprotein-like protein  26.17 
 
 		 315 aa  57  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0883  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.07 
 
 		 243 aa  57  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.192303  normal  0.0728426 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3100  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.08 
 
 		 306 aa  57  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.425844  normal  0.735542 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1899  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  32.97 
 
 		 265 aa  56.2  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2864  putative lipoprotein  22.57 
 
 		 253 aa  56.6  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000160081  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1126  putative lipoprotein (DUF0169)  23.74 
 
 		 359 aa  56.2  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.926748 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  31.53 
 
 		 287 aa  56.2  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  31.53 
 
 		 287 aa  55.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1135  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.47 
 
 		 244 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3144  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.47 
 
 		 244 aa  55.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3723  putative lipoprotein  24.89 
 
 		 268 aa  55.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.196692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3167  putative lipoprotein  22.67 
 
 		 268 aa  54.7  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0598273  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0725  competence lipoprotein ComL, putative  25.81 
 
 		 340 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  25.81 
 
 		 264 aa  53.5  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1188  hypothetical protein  24.24 
 
 		 257 aa  53.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1194  hypothetical protein  24.24 
 
 		 257 aa  53.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2992  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.83 
 
 		 245 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3135  putative lipoprotein  24.88 
 
 		 291 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2880  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.83 
 
 		 245 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3496  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.29 
 
 		 288 aa  53.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.24524 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2775  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.83 
 
 		 245 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000251049  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2878  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.83 
 
 		 245 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.732021 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0430  competence lipoprotein ComL, putative  25.58 
 
 		 251 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.761714  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2004  putative transmembrane protein  33.72 
 
 		 274 aa  53.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.519821  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11930  competence protein ComL  25 
 
 		 337 aa  52.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4007  DNA uptake lipoprotein-like protein  30.51 
 
 		 249 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2430  DNA uptake lipoprotein  25.57 
 
 		 291 aa  52.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.233746  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3916  putative lipoprotein  24.15 
 
 		 252 aa  52.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0826  competence lipoprotein ComL, putative  25.35 
 
 		 338 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1258  lipoprotein  23.29 
 
 		 359 aa  52.4  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1975  TPR repeat-containing protein  23.3 
 
 		 266 aa  52.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2315  putative transmembrane protein  29.67 
 
 		 268 aa  52.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2552  Acyl-(acyl-carrier-protein)--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  26.04 
 
 		 301 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0201598  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0496  competence lipoprotein ComL, putative  22.05 
 
 		 268 aa  52.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.4475  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1352  hypothetical protein  25.19 
 
 		 278 aa  52.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2859  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.83 
 
 		 245 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  25.23 
 
 		 302 aa  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1864  putative transmembrane protein  30.77 
 
 		 274 aa  52.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0702  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 278 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.58 
 
 		 261 aa  52  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.155827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  25.11 
 
 		 271 aa  51.6  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2880  hypothetical protein  27.03 
 
 		 289 aa  51.6  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2616  putative transmembrane protein  31.87 
 
 		 274 aa  51.6  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1752  competence protein ComL  27.93 
 
 		 287 aa  52  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0330  putative lipoprotein  23 
 
 		 284 aa  51.6  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654849  normal  0.880482 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1077  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  22.44 
 
 		 245 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1086  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.44 
 
 		 245 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.403898  decreased coverage  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3178  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  24.61 
 
 		 291 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.121746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2976  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.44 
 
 		 245 aa  51.2  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0410955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02449  hypothetical protein  22.44 
 
 		 245 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.235598  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3836  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.44 
 
 		 245 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000106829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2749  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.44 
 
 		 245 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000166686  normal  0.272944 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2753  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.44 
 
 		 245 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000042018  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2881  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  22.44 
 
 		 245 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0417969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>