More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3505 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3505  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 830 aa  1681    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3722  TonB-dependent receptor plug  30.58 
 
 		 896 aa  290  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.275954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3723  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 767 aa  195  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  25.75 
 
 		 837 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  25.48 
 
 		 792 aa  181  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 817 aa  180  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  24.17 
 
 		 828 aa  173  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  26.33 
 
 		 708 aa  171  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  26.54 
 
 		 825 aa  171  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  26.81 
 
 		 825 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  25.29 
 
 		 850 aa  168  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  26.04 
 
 		 703 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  23.82 
 
 		 828 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2131  TonB-dependent receptor plug  25.26 
 
 		 757 aa  164  9e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0772564  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  25.74 
 
 		 799 aa  163  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  23.59 
 
 		 806 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  23.47 
 
 		 828 aa  162  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  23.67 
 
 		 797 aa  162  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  27.49 
 
 		 864 aa  159  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1352  TonB-dependent receptor plug  22.74 
 
 		 832 aa  159  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  27.14 
 
 		 721 aa  157  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  25.5 
 
 		 860 aa  156  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  23.47 
 
 		 815 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 794 aa  154  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  26.29 
 
 		 706 aa  153  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  26.29 
 
 		 706 aa  153  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  25.43 
 
 		 708 aa  153  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  25.28 
 
 		 757 aa  152  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  25.14 
 
 		 709 aa  151  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  25.34 
 
 		 829 aa  150  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  25.42 
 
 		 709 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  25.45 
 
 		 708 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  24.7 
 
 		 701 aa  149  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  25.36 
 
 		 701 aa  148  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 820 aa  147  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  27.71 
 
 		 741 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.56 
 
 		 711 aa  147  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  25.73 
 
 		 711 aa  147  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  25.51 
 
 		 695 aa  145  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  24.65 
 
 		 757 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  23.74 
 
 		 797 aa  146  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3412  ferrichrome iron receptor  24.78 
 
 		 691 aa  145  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000883951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  25.88 
 
 		 769 aa  144  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  26.08 
 
 		 821 aa  144  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  25.22 
 
 		 822 aa  144  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  26.26 
 
 		 712 aa  144  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  25.65 
 
 		 859 aa  142  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2064  TonB-dependent siderophore receptor  25.83 
 
 		 723 aa  141  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228617  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  24.61 
 
 		 778 aa  141  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  25.94 
 
 		 733 aa  141  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  26.57 
 
 		 710 aa  140  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  25.69 
 
 		 689 aa  140  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.49 
 
 		 833 aa  140  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  24.97 
 
 		 815 aa  140  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  25.22 
 
 		 843 aa  140  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  23.4 
 
 		 806 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  24.07 
 
 		 703 aa  138  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  26.41 
 
 		 738 aa  138  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  24.67 
 
 		 696 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  24.96 
 
 		 696 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  26.97 
 
 		 689 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  23.51 
 
 		 738 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  26.4 
 
 		 793 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  25.32 
 
 		 709 aa  135  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1049  TonB-dependent siderophore receptor  24.13 
 
 		 788 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  23.97 
 
 		 829 aa  134  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  24.92 
 
 		 689 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  21.49 
 
 		 787 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  26.33 
 
 		 734 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  25.18 
 
 		 862 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  23.65 
 
 		 817 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  26.05 
 
 		 730 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4602  TonB-dependent siderophore receptor  25.89 
 
 		 784 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 717 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  23.4 
 
 		 814 aa  132  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.07 
 
 		 703 aa  132  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  24.56 
 
 		 750 aa  132  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  22.74 
 
 		 824 aa  132  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2327  TonB-dependent siderophore receptor  23.61 
 
 		 790 aa  132  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.929044  normal  0.271692 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 717 aa  131  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  23.37 
 
 		 723 aa  131  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6108  TonB-dependent siderophore receptor  23.69 
 
 		 796 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  23.98 
 
 		 828 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  25.85 
 
 		 719 aa  130  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  23.25 
 
 		 729 aa  130  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0688  TonB-dependent receptor protein  25.39 
 
 		 716 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4489  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 785 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4121  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 785 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.922703 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  24.47 
 
 		 745 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  26.91 
 
 		 722 aa  129  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  23.98 
 
 		 789 aa  129  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  23.82 
 
 		 793 aa  128  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  23.67 
 
 		 753 aa  129  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  23.67 
 
 		 753 aa  129  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  22.64 
 
 		 753 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  22.32 
 
 		 805 aa  128  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  24.15 
 
 		 745 aa  127  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  26.55 
 
 		 715 aa  127  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  23.67 
 
 		 752 aa  127  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  24.6 
 
 		 810 aa  127  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>