More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2695 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2695  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 342 aa  696    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0214736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  46.88 
 
 		 364 aa  301  1e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0728  uroporphyrinogen decarboxylase  47.38 
 
 		 354 aa  300  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0876  uroporphyrinogen decarboxylase  47.38 
 
 		 354 aa  300  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  47.06 
 
 		 352 aa  298  1e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  47.62 
 
 		 353 aa  296  4e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  47.06 
 
 		 351 aa  292  5e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  44.57 
 
 		 354 aa  292  6e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0552  uroporphyrinogen decarboxylase  46.06 
 
 		 355 aa  290  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147846 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  45.32 
 
 		 354 aa  290  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  44.28 
 
 		 354 aa  289  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1934  uroporphyrinogen decarboxylase  45.16 
 
 		 365 aa  289  4e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  46.92 
 
 		 357 aa  289  6e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  44.44 
 
 		 354 aa  288  7e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  45.03 
 
 		 354 aa  288  7e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  46.24 
 
 		 352 aa  288  8e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  44.15 
 
 		 354 aa  288  8e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  44.15 
 
 		 354 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  46.95 
 
 		 355 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  46.65 
 
 		 355 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  44.15 
 
 		 354 aa  285  7e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  47.11 
 
 		 355 aa  285  9e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  44.02 
 
 		 354 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  43.57 
 
 		 354 aa  283  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0351  uroporphyrinogen decarboxylase  44.48 
 
 		 355 aa  283  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.777116  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0459  uroporphyrinogen decarboxylase  44.48 
 
 		 355 aa  283  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000960348 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  45.57 
 
 		 354 aa  282  6.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  45.57 
 
 		 354 aa  282  6.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0415  uroporphyrinogen decarboxylase  44.02 
 
 		 355 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2765  uroporphyrinogen decarboxylase  47.06 
 
 		 365 aa  281  8.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3713  uroporphyrinogen decarboxylase  44.9 
 
 		 360 aa  280  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3849  uroporphyrinogen decarboxylase  44.17 
 
 		 355 aa  280  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0210  uroporphyrinogen decarboxylase  43.57 
 
 		 354 aa  280  3e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0124917 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0025  uroporphyrinogen decarboxylase  43.35 
 
 		 356 aa  280  4e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4378  uroporphyrinogen decarboxylase  43.86 
 
 		 354 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.91714 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1540  uroporphyrinogen decarboxylase  44.17 
 
 		 354 aa  278  7e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0588582  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  43.48 
 
 		 354 aa  278  7e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.104978 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03874  uroporphyrinogen decarboxylase  44.48 
 
 		 354 aa  278  8e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3997  uroporphyrinogen decarboxylase  44.48 
 
 		 354 aa  278  8e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03827  hypothetical protein  44.48 
 
 		 354 aa  278  8e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4445  uroporphyrinogen decarboxylase  44.48 
 
 		 354 aa  278  8e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531857 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4028  uroporphyrinogen decarboxylase  44.48 
 
 		 354 aa  278  8e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901601 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4231  uroporphyrinogen decarboxylase  44.48 
 
 		 354 aa  278  8e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1118  uroporphyrinogen decarboxylase  44.17 
 
 		 366 aa  278  8e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4488  uroporphyrinogen decarboxylase  44.48 
 
 		 354 aa  278  8e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4540  uroporphyrinogen decarboxylase  44.48 
 
 		 354 aa  278  8e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5466  uroporphyrinogen decarboxylase  44.48 
 
 		 354 aa  278  9e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  44.15 
 
 		 340 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  44.44 
 
 		 350 aa  277  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4411  uroporphyrinogen decarboxylase  43.57 
 
 		 354 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.356712  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0468  uroporphyrinogen decarboxylase  42.4 
 
 		 354 aa  277  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.551624  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4500  uroporphyrinogen decarboxylase  43.27 
 
 		 354 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407137 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  45.4 
 
 		 343 aa  276  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  43.07 
 
 		 340 aa  276  5e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4498  uroporphyrinogen decarboxylase  43.27 
 
 		 354 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0575835 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4574  uroporphyrinogen decarboxylase  44.02 
 
 		 354 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.300698 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  45.06 
 
 		 353 aa  275  6e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0440  uroporphyrinogen decarboxylase  42.11 
 
 		 354 aa  275  9e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0482  uroporphyrinogen decarboxylase  42.9 
 
 		 354 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  42.4 
 
 		 354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0387  uroporphyrinogen decarboxylase  42.98 
 
 		 354 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  43.12 
 
 		 380 aa  273  3e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  42.69 
 
 		 354 aa  273  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5896  uroporphyrinogen decarboxylase  46.78 
 
 		 354 aa  271  9e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  43.6 
 
 		 359 aa  271  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3444  uroporphyrinogen decarboxylase  42.14 
 
 		 340 aa  271  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0609  uroporphyrinogen decarboxylase  45.56 
 
 		 354 aa  271  1e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884937  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2666  uroporphyrinogen decarboxylase  44.08 
 
 		 354 aa  271  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000212078  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  41.26 
 
 		 355 aa  271  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3867  uroporphyrinogen decarboxylase  44.65 
 
 		 357 aa  271  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  42.81 
 
 		 354 aa  271  1e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  43.66 
 
 		 340 aa  270  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  42.99 
 
 		 355 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4080  uroporphyrinogen decarboxylase  42.65 
 
 		 356 aa  268  8e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  42.99 
 
 		 355 aa  268  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  40.52 
 
 		 355 aa  267  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0689  uroporphyrinogen decarboxylase  44.99 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0439  uroporphyrinogen decarboxylase  42.9 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3590  uroporphyrinogen decarboxylase  42.9 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  42.9 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  40.99 
 
 		 351 aa  267  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3406  uroporphyrinogen decarboxylase  42.32 
 
 		 354 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  41.52 
 
 		 339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02179  uroporphyrinogen decarboxylase  44.7 
 
 		 354 aa  266  4e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  42.15 
 
 		 351 aa  266  4e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  42.38 
 
 		 355 aa  265  7e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  42.03 
 
 		 354 aa  264  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  44 
 
 		 339 aa  263  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3498  uroporphyrinogen decarboxylase  43.1 
 
 		 367 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3920  uroporphyrinogen decarboxylase  41.74 
 
 		 354 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  40.41 
 
 		 351 aa  263  3e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0413  uroporphyrinogen decarboxylase  41.74 
 
 		 354 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  41.74 
 
 		 354 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000118509 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4042  uroporphyrinogen decarboxylase  41.74 
 
 		 354 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.984022 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3174  uroporphyrinogen decarboxylase  42.82 
 
 		 367 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  41.28 
 
 		 351 aa  262  6e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  43.69 
 
 		 339 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  40.41 
 
 		 351 aa  262  6.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0126  uroporphyrinogen decarboxylase  42.36 
 
 		 375 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2779  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  42.98 
 
 		 356 aa  260  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.313146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>