246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2447 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2447  LemA family protein  100 
 
 		 437 aa  885    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0106  hypothetical protein  47.97 
 
 		 433 aa  392  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00869017  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0261  LemA family protein  46.14 
 
 		 434 aa  375  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313528  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_117  LemA domain protein  46.99 
 
 		 434 aa  371  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  37.72 
 
 		 181 aa  125  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  38.65 
 
 		 183 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  36.81 
 
 		 182 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  36.81 
 
 		 186 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35290  hypothetical protein  44.3 
 
 		 195 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.448083 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  34.73 
 
 		 184 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  36.67 
 
 		 183 aa  109  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  38.41 
 
 		 188 aa  108  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  39.07 
 
 		 188 aa  108  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  38.51 
 
 		 201 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  41.84 
 
 		 182 aa  107  6e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  36.26 
 
 		 188 aa  106  8e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  37.36 
 
 		 249 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  34.57 
 
 		 183 aa  105  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  38.41 
 
 		 185 aa  105  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  40.54 
 
 		 183 aa  104  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  37.43 
 
 		 201 aa  103  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  38.51 
 
 		 184 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  33.73 
 
 		 180 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  39.86 
 
 		 183 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  33.54 
 
 		 180 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  33.54 
 
 		 180 aa  101  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  33.54 
 
 		 180 aa  101  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  36.31 
 
 		 182 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  36.2 
 
 		 195 aa  100  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  31.74 
 
 		 189 aa  100  7e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  37.42 
 
 		 196 aa  99.8  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  33.72 
 
 		 192 aa  99.8  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  37.21 
 
 		 196 aa  99.4  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  37.5 
 
 		 184 aa  99.4  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  33.13 
 
 		 180 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  41.38 
 
 		 188 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3325  LemA family protein  36.97 
 
 		 190 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0420769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  38.41 
 
 		 186 aa  98.2  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  37.96 
 
 		 183 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  34.27 
 
 		 184 aa  97.8  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  37.96 
 
 		 183 aa  97.8  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  34.55 
 
 		 185 aa  97.4  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  38.73 
 
 		 183 aa  97.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  37.27 
 
 		 195 aa  97.1  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  32.93 
 
 		 187 aa  95.9  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  96.3  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  33.71 
 
 		 199 aa  95.9  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  34.29 
 
 		 194 aa  96.3  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  32.72 
 
 		 180 aa  94.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  33.73 
 
 		 190 aa  94.4  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  37.84 
 
 		 195 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  33.53 
 
 		 190 aa  94  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  35.62 
 
 		 184 aa  93.2  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  33.13 
 
 		 196 aa  93.2  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  36.65 
 
 		 184 aa  93.2  9e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1608  LemA family protein  33.73 
 
 		 191 aa  92.8  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0508234  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  32.79 
 
 		 188 aa  92.8  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  35.06 
 
 		 196 aa  92.4  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  30.36 
 
 		 189 aa  92  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  32.77 
 
 		 191 aa  91.3  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  32.68 
 
 		 186 aa  91.3  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  34.51 
 
 		 185 aa  91.3  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  35.77 
 
 		 186 aa  90.5  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  32.04 
 
 		 189 aa  90.1  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  33.1 
 
 		 181 aa  89  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  89.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  31.65 
 
 		 188 aa  89.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  35.37 
 
 		 189 aa  88.6  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  34.57 
 
 		 186 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1707  LemA family protein  40.82 
 
 		 192 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  36.65 
 
 		 185 aa  87.4  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  31.9 
 
 		 185 aa  87  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  30.11 
 
 		 192 aa  86.7  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  33.33 
 
 		 208 aa  86.7  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  32.92 
 
 		 198 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25170  hypothetical protein  38.92 
 
 		 197 aa  86.3  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  32.12 
 
 		 197 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  35.25 
 
 		 187 aa  85.1  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0999  LemA family protein  30.92 
 
 		 194 aa  84.7  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  37.5 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3560  hypothetical protein  31.61 
 
 		 189 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  37.5 
 
 		 193 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3652  LemA family protein  30.18 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3447  LemA family protein  37.5 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3965  LemA family protein  35.56 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0157  LemA family protein  29.65 
 
 		 189 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  35.21 
 
 		 187 aa  82.4  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  34.81 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  32.39 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2286  LemA family protein  28.83 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  32.19 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1371  hypothetical protein  31.61 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117075  hitchhiker  0.000133503 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0598  LemA family protein  30.46 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  30.25 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  31.33 
 
 		 196 aa  79.3  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  31.68 
 
 		 185 aa  79.7  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1289  hypothetical protein  29.63 
 
 		 208 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0311306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  30.05 
 
 		 196 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3226  hypothetical protein  32.48 
 
 		 208 aa  79  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.969393  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1229  LemA family protein  27.63 
 
 		 187 aa  79  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0569306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>