240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1484 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1484  auxin efflux carrier  100 
 
 		 309 aa  592  1e-168  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  29.35 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  32.34 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  27.92 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  31.72 
 
 		 316 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  28.75 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  30.13 
 
 		 313 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  30.94 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  27.91 
 
 		 318 aa  99.8  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  30.27 
 
 		 313 aa  99  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  31.27 
 
 		 313 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  31.85 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  30.07 
 
 		 313 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  26.25 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  26.97 
 
 		 318 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  25.93 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  29.74 
 
 		 315 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  27.24 
 
 		 318 aa  96.3  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  26.32 
 
 		 318 aa  95.9  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  27.24 
 
 		 318 aa  95.9  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  27.57 
 
 		 318 aa  95.9  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  30 
 
 		 310 aa  95.5  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  26 
 
 		 330 aa  95.1  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  27.85 
 
 		 315 aa  93.6  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  28.38 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  30.77 
 
 		 313 aa  93.6  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  33.67 
 
 		 317 aa  92.4  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  26.71 
 
 		 316 aa  92.4  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  29.62 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  25.93 
 
 		 318 aa  89.7  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  25.25 
 
 		 318 aa  89.4  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  27.57 
 
 		 318 aa  87.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  26.33 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  32.08 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  29.79 
 
 		 339 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  26.26 
 
 		 318 aa  86.7  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  29.94 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  29.45 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  29.71 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  29.45 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  29.04 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  27.78 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  30.17 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  28.9 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  28.25 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  28.48 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  29.9 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  28.66 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  29.45 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  26.77 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  29.11 
 
 		 336 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  32.37 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  29.8 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  32.07 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  29.29 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  28.66 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  24.35 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  28.83 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  31.29 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  30.56 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  26.32 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  26.32 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  28.98 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  28.25 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  30.74 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.54 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2151  Auxin Efflux Carrier  30.14 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  30.74 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1780  auxin efflux carrier  26.4 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0290107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  30.84 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  28.01 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  31.08 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0732  permease  25.52 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  28.39 
 
 		 306 aa  72.4  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  29.53 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  29.53 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  30.84 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  26.71 
 
 		 362 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  29.19 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  29.65 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  27.74 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  29.55 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  27.18 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  32.27 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  27.39 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  30.1 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  28.77 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3917  auxin efflux carrier  27.56 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  24.09 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  26.4 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  27.36 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  28.44 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  28.98 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0404  Auxin Efflux Carrier  31.22 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.989352  normal  0.549528 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  26.38 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  27.16 
 
 		 330 aa  65.9  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  27.7 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  26.9 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  29.47 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  28.3 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>