103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1258 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1258  beta strand repeat-containing protein  100 
 
 		 550 aa  1055    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.305666  normal  0.49742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0264  beta strand repeat-containing protein  45.42 
 
 		 860 aa  166  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1117  beta strand repeat-containing protein  39.52 
 
 		 422 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  36.08 
 
 		 1530 aa  83.6  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  35.6 
 
 		 1028 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1718  hypothetical protein  30.75 
 
 		 582 aa  79  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.053608  normal  0.169106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  34.72 
 
 		 995 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  33.8 
 
 		 986 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  37.16 
 
 		 1180 aa  76.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  43.48 
 
 		 1055 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  38.99 
 
 		 983 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  40.65 
 
 		 3391 aa  73.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  32.6 
 
 		 1004 aa  73.2  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  43.59 
 
 		 1081 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.2 
 
 		 1029 aa  72  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  46.09 
 
 		 1038 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  35.89 
 
 		 991 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  47.66 
 
 		 1285 aa  68.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  38.26 
 
 		 1033 aa  68.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.27 
 
 		 1055 aa  68.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  41.61 
 
 		 1177 aa  68.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  35.1 
 
 		 995 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  36.23 
 
 		 1593 aa  67  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  37.23 
 
 		 816 aa  67  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  48.11 
 
 		 1532 aa  63.9  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  39.49 
 
 		 2371 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  40.6 
 
 		 3506 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  36.65 
 
 		 2363 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  39.52 
 
 		 1508 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  41.75 
 
 		 1001 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  40.94 
 
 		 1971 aa  60.5  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  38.46 
 
 		 2396 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  34.62 
 
 		 2906 aa  60.1  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  39.79 
 
 		 2366 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  36.61 
 
 		 1459 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  42.2 
 
 		 1011 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  46.28 
 
 		 2346 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  46.28 
 
 		 2365 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  40 
 
 		 1001 aa  57  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  40.68 
 
 		 2926 aa  56.2  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  38.76 
 
 		 1006 aa  57  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  36.72 
 
 		 1053 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  40.46 
 
 		 950 aa  56.2  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  45.45 
 
 		 1099 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2201  serine protease  36 
 
 		 641 aa  55.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  33.62 
 
 		 1119 aa  55.1  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  36.27 
 
 		 987 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  37.9 
 
 		 942 aa  55.5  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  36.36 
 
 		 965 aa  54.7  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0082  beta strand repeat-containing protein  27.33 
 
 		 1300 aa  53.9  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420525 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  51.16 
 
 		 3629 aa  53.9  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  35.71 
 
 		 1881 aa  53.5  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  30.96 
 
 		 3089 aa  53.5  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  39.26 
 
 		 3322 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  46.88 
 
 		 1741 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  34.13 
 
 		 1446 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.36 
 
 		 1848 aa  52.8  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0131  lipoprotein  34.03 
 
 		 657 aa  51.6  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0585  beta strand repeat-containing protein  34.62 
 
 		 852 aa  51.6  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184792  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  36.42 
 
 		 1882 aa  51.6  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  56.14 
 
 		 3822 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  56.14 
 
 		 4238 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  56.14 
 
 		 4238 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  41.46 
 
 		 2711 aa  50.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  38.26 
 
 		 1113 aa  49.7  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0234  serine protease  34.76 
 
 		 998 aa  49.3  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249897  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0340  serine protease  32.45 
 
 		 949 aa  49.3  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000000485293  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0206  beta strand repeat-containing protein  34.76 
 
 		 970 aa  49.3  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0308  beta strand repeat-containing protein  32.45 
 
 		 970 aa  49.7  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000319801  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  31.37 
 
 		 1156 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  39.61 
 
 		 1869 aa  48.5  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.57 
 
 		 1322 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.52 
 
 		 1227 aa  48.5  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  35.29 
 
 		 909 aa  48.1  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  43.75 
 
 		 1068 aa  47.8  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  37.84 
 
 		 2578 aa  47.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.57 
 
 		 910 aa  47.4  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  33.11 
 
 		 1325 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.07 
 
 		 3015 aa  47.4  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  46.84 
 
 		 2057 aa  47.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  30.46 
 
 		 3420 aa  46.2  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  46.34 
 
 		 1130 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  29.88 
 
 		 1571 aa  46.2  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2957  beta strand repeat-containing protein  44.64 
 
 		 683 aa  46.6  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  40.44 
 
 		 1108 aa  46.2  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  47.27 
 
 		 1458 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  47.22 
 
 		 2642 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.02 
 
 		 919 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2954  autotransporter-associated beta strand repeat protein  31.64 
 
 		 947 aa  45.8  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0154236  hitchhiker  0.00450699 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  43.75 
 
 		 861 aa  45.4  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  32.16 
 
 		 2003 aa  45.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  45.98 
 
 		 3954 aa  45.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  48.39 
 
 		 1357 aa  45.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  40.54 
 
 		 1093 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  40.54 
 
 		 1093 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  28.07 
 
 		 994 aa  45.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  27.8 
 
 		 1154 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  45.68 
 
 		 814 aa  44.3  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  34.01 
 
 		 1369 aa  44.3  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.03 
 
 		 1134 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>