149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3555 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3555  Surfeit locus 1 family protein  100 
 
 
252 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0528  SurF1 family protein  79.12 
 
 
253 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0458  SurF1 family protein  78.71 
 
 
253 aa  397  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1735  Surfeit locus 1 family protein  61.19 
 
 
261 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7139  Surfeit locus 1 family protein  57.94 
 
 
263 aa  261  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6212  SurF1 family protein  57.55 
 
 
250 aa  253  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4368  Surfeit locus 1 family protein  56.34 
 
 
251 aa  251  6e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1504  Surfeit locus 1  56.81 
 
 
233 aa  247  1e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.323689  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4850  Surfeit locus 1 family protein  53.51 
 
 
233 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104247  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5989  Surfeit locus 1 family protein  56.19 
 
 
250 aa  231  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4702  Surfeit locus 1 family protein  52.7 
 
 
229 aa  226  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.134361  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0076  SurF1 family protein  47.97 
 
 
268 aa  226  3e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219165  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4333  Surfeit locus 1 family protein  52.25 
 
 
244 aa  226  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.994849  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2034  putative SURF1 family protein  54.95 
 
 
281 aa  225  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  49.78 
 
 
278 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4774  Surfeit locus 1 family protein  55.29 
 
 
287 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5104  Surfeit locus 1 family protein  54.3 
 
 
230 aa  215  5.9999999999999996e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.009439  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0238  Surfeit protein  53.66 
 
 
278 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4050  Surfeit locus 1 family protein  53.74 
 
 
285 aa  209  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5731  Surfeit locus 1 family protein  55.1 
 
 
231 aa  198  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.440846  normal  0.0198979 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4061  Surfeit locus 1 family protein  49.79 
 
 
237 aa  198  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.293936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4641  Surfeit locus 1 family protein  43.14 
 
 
260 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136929  normal  0.114046 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2219  Surfeit locus 1 family protein  43.66 
 
 
282 aa  191  8e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127472  normal  0.185361 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2779  Surfeit locus 1 family protein  44.57 
 
 
269 aa  185  6e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.764047 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2269  Surfeit locus 1 family protein  43.8 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  43.78 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0026  Surfeit locus 1 family protein  44.86 
 
 
254 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13352  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  41.6 
 
 
264 aa  176  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  42.08 
 
 
256 aa  171  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1250  Surfeit locus 1 family protein  46.15 
 
 
247 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  41.63 
 
 
256 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0267  Surfeit locus 1 family protein  38.66 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  39.15 
 
 
249 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0747  Surfeit locus 1  38.22 
 
 
250 aa  162  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00346081  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  39.48 
 
 
249 aa  162  6e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2342  Surfeit locus 1 family protein  40.09 
 
 
253 aa  158  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  40.09 
 
 
250 aa  151  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2288  Surfeit locus 1  39.73 
 
 
243 aa  150  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1048  cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  40.19 
 
 
241 aa  149  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.520132  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0610  Surfeit locus 1 family protein  40.09 
 
 
244 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0723  Surfeit locus 1 family protein  36.48 
 
 
247 aa  143  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  34.51 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0526  Surfeit locus 1 family protein  39.07 
 
 
247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0259384  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3456  Surfeit locus 1  33.2 
 
 
249 aa  133  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0906  Surfeit locus 1 family protein  33.9 
 
 
267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0768  surfeit locus 1  31.71 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211943  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4794  Surfeit locus 1  32.37 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4581  surfeit protein  33.06 
 
 
259 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0821  putative surfeit 1  31.93 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0835  putative surfeit 1 protein  33.48 
 
 
251 aa  115  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  34.7 
 
 
224 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  34.76 
 
 
223 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  34.03 
 
 
223 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  34.03 
 
 
223 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04753  COX1 assembly protein Shy1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06340)  31.56 
 
 
324 aa  97.8  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2331  SURF1 family protein  30.77 
 
 
220 aa  96.3  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.486362  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4316  SURF1 protein  31.76 
 
 
223 aa  90.5  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113316  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  31.43 
 
 
245 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1145  hypothetical protein  31.34 
 
 
233 aa  90.5  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00150  mitochondrial protein required for respiration, putative  28.68 
 
 
335 aa  82  0.000000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303199  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55665  mitochondrial protein involved in respiration  27.18 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.585569  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  30.4 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1413  hypothetical protein  28.96 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517061  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  29.13 
 
 
245 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0828  hypothetical protein  29.2 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1081  SURF1 family protein  28.45 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.5204  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  29.22 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0869  hypothetical protein  30.18 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2163  hypothetical protein  26.58 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  22.83 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0873  putative SURF1 family protein  29.8 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  23.18 
 
 
242 aa  65.5  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  32.88 
 
 
303 aa  65.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  32.62 
 
 
264 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  26.87 
 
 
290 aa  62.4  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  26.36 
 
 
238 aa  61.2  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  28.69 
 
 
314 aa  61.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0164  hypothetical protein  29.88 
 
 
276 aa  60.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.309928  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11550  hypothetical protein  28.44 
 
 
305 aa  60.5  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.773988  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  28.57 
 
 
228 aa  59.7  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  26.67 
 
 
238 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0067  hypothetical protein  29.15 
 
 
249 aa  58.9  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2714  putative transmembrane protein  26.83 
 
 
294 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  26.2 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  26.2 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  26.2 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  26.2 
 
 
237 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  26.2 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1248  hypothetical protein  25.56 
 
 
205 aa  57  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  26.2 
 
 
342 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  26.74 
 
 
237 aa  57  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  29.03 
 
 
272 aa  56.2  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4439  hypothetical protein  23.47 
 
 
302 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2566  membrane spanning protein  33.88 
 
 
304 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0665826  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  26.69 
 
 
283 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06910  hypothetical protein  28.32 
 
 
301 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0836319 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  26.43 
 
 
288 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  25.24 
 
 
213 aa  52.8  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  24.45 
 
 
237 aa  52.4  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  25.54 
 
 
347 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>