More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0895 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_0895  SMF family protein  100 
 
 		 277 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0725141  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2199  SMF protein  68.48 
 
 		 295 aa  395  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000000109566  n/a   
 
 
 
NC_011138  MADE_00299  SMF protein  56.36 
 
 		 295 aa  333  2e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0738024  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0829  SMF protein  57.51 
 
 		 302 aa  310  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000000494778  unclonable  0.00000053087 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0181  hypothetical protein  51.69 
 
 		 294 aa  275  5e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4391  SMF family protein  44.44 
 
 		 226 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.000255579  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5585  SMF family protein  38.89 
 
 		 314 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  38.32 
 
 		 336 aa  136  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  35.06 
 
 		 364 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  38.79 
 
 		 352 aa  132  6e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  36.24 
 
 		 371 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0922  DNA processing protein, Smf family  38.89 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0031  DNA protecting protein DprA  36.24 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  35.96 
 
 		 394 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  35.06 
 
 		 362 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 366 aa  126  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  38.6 
 
 		 409 aa  126  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  37.04 
 
 		 368 aa  126  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  38.26 
 
 		 399 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  37.26 
 
 		 362 aa  125  6e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  38.14 
 
 		 359 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  36.07 
 
 		 359 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  36.99 
 
 		 360 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  37.63 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  38.6 
 
 		 402 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  35.05 
 
 		 369 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  37.5 
 
 		 399 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  39.13 
 
 		 360 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  37.04 
 
 		 375 aa  123  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  34.47 
 
 		 365 aa  123  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2080  DNA protecting protein DprA  38.71 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  30.77 
 
 		 337 aa  122  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  38.14 
 
 		 401 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  30.77 
 
 		 337 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1508  DNA protecting protein DprA  37.61 
 
 		 366 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.300262 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  33.22 
 
 		 370 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  37.21 
 
 		 401 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  37.1 
 
 		 375 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  36.96 
 
 		 374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  37.1 
 
 		 375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  37.85 
 
 		 365 aa  120  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  33.64 
 
 		 369 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1006  DprA/SMF protein, putative DNA processing factor  34 
 
 		 280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048542  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  35.29 
 
 		 372 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  37.96 
 
 		 389 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  37.89 
 
 		 372 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  35.35 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  35.98 
 
 		 379 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1305  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  34.27 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.203251  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  33.21 
 
 		 385 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00230  putative Rossmann fold nucleotide-binding protein  34.42 
 
 		 362 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1020  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  33.49 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.274867  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  35.56 
 
 		 363 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  34.31 
 
 		 359 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1101  DNA protecting protein DprA  32.67 
 
 		 294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00287455  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  34.96 
 
 		 389 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  34.88 
 
 		 369 aa  116  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  35.59 
 
 		 377 aa  116  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  40.33 
 
 		 366 aa  115  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1159  DNA protecting protein DprA  35.05 
 
 		 668 aa  115  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  34.68 
 
 		 366 aa  115  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  39.66 
 
 		 360 aa  115  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  31.67 
 
 		 405 aa  115  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  34.42 
 
 		 394 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  36.53 
 
 		 381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  36.74 
 
 		 395 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  28.98 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  36.53 
 
 		 381 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  37.26 
 
 		 379 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  35.24 
 
 		 366 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  36.49 
 
 		 406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  33.64 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  37.37 
 
 		 370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  36.18 
 
 		 373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  38.58 
 
 		 368 aa  113  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  34.11 
 
 		 382 aa  113  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3602  DNA protecting protein DprA  33.47 
 
 		 374 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.62233 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  33.63 
 
 		 308 aa  113  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  36.7 
 
 		 338 aa  113  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  39.01 
 
 		 338 aa  113  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  32.64 
 
 		 371 aa  113  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  33.47 
 
 		 356 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  33.18 
 
 		 361 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  33.96 
 
 		 374 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  32.41 
 
 		 366 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0388  putative DNA processing protein DprA  37.61 
 
 		 378 aa  113  4.0000000000000004e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3862  DNA processing protein DprA, putative  32.03 
 
 		 409 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  36.49 
 
 		 373 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  35.35 
 
 		 379 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  39.01 
 
 		 338 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  39.01 
 
 		 338 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0022  DNA-processing protein smf chain A  33.49 
 
 		 362 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638184  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  32.67 
 
 		 365 aa  112  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  34.51 
 
 		 399 aa  112  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  34.94 
 
 		 375 aa  112  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  32.35 
 
 		 362 aa  112  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3967  DNA protecting protein DprA  36.74 
 
 		 373 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  31.25 
 
 		 337 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  34.39 
 
 		 367 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  32.34 
 
 		 386 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>