104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_30204 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009356  OSTLU_30204  predicted protein  100 
 
 
498 aa  1036    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.381291  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35815  predicted protein  33.33 
 
 
764 aa  241  2e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.756935 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_8086  predicted protein  100 
 
 
114 aa  238  2e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01320  purine nucleotide binding protein, putative  30.37 
 
 
1001 aa  224  2e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06303  Replication factor C like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78622]  29.28 
 
 
1092 aa  201  3.9999999999999996e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43994  predicted protein  30.96 
 
 
942 aa  197  4.0000000000000005e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  27.36 
 
 
642 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0498  replication factor C large subunit  25.53 
 
 
476 aa  125  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0270  ATPase central domain-containing protein  24.78 
 
 
385 aa  124  4e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022175 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0507  AAA ATPase central domain protein  25.25 
 
 
437 aa  124  4e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00420  sister chromatid cohesion-related protein, putative  26.36 
 
 
892 aa  124  5e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0657  replication factor C large subunit  25.73 
 
 
423 aa  123  6e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  hitchhiker  0.00784495 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  30.63 
 
 
481 aa  124  6e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0003  replication factor C large subunit  24.57 
 
 
422 aa  122  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  26.51 
 
 
467 aa  121  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2009  replication factor C large subunit  24.57 
 
 
422 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3011  replication factor C large subunit  27.38 
 
 
507 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.379588  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1757  replication factor C large subunit  27.97 
 
 
497 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0412755  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1361  replication factor C large subunit  24.67 
 
 
474 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  24.88 
 
 
514 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1352  replication factor C large subunit  24.69 
 
 
484 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  28.99 
 
 
497 aa  118  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0629  replication factor C large subunit  24.44 
 
 
484 aa  117  6e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1324  replication factor C large subunit  28.79 
 
 
482 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.414275  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  25.6 
 
 
418 aa  115  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  27.24 
 
 
497 aa  115  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1333  replication factor C large subunit  29.46 
 
 
492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.513611  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  26.44 
 
 
483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0004  replication factor C large subunit  23.96 
 
 
421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1810  replication factor C large subunit  25.45 
 
 
500 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0266  replication factor C large subunit  30.43 
 
 
413 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  26.93 
 
 
451 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2049  replication factor C large subunit  29.67 
 
 
443 aa  109  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  28.63 
 
 
454 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1828  AAA ATPase central domain protein  29.39 
 
 
405 aa  102  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0627242  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45690  predicted protein  25.78 
 
 
1015 aa  92.4  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136558  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  25.82 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  25.94 
 
 
326 aa  77  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  25.48 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  26.16 
 
 
322 aa  77  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  25.18 
 
 
323 aa  75.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  25.73 
 
 
329 aa  75.9  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  25.81 
 
 
324 aa  75.9  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  28.57 
 
 
398 aa  73.9  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  26.61 
 
 
325 aa  72.4  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48947  predicted protein  22.84 
 
 
725 aa  72.4  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00599657 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  21.85 
 
 
338 aa  72  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  23.13 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  25.08 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  26.64 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  24.03 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  25.88 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  22.47 
 
 
315 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  25.53 
 
 
322 aa  69.3  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  25.4 
 
 
322 aa  69.3  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  25 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  23.28 
 
 
349 aa  69.3  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  22.47 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  23.93 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  24.24 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  24.71 
 
 
320 aa  67  0.0000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33013  predicted protein  22.73 
 
 
571 aa  66.6  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0011992  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  23.75 
 
 
321 aa  66.2  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  24.78 
 
 
334 aa  66.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  22.47 
 
 
315 aa  66.6  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  23.93 
 
 
322 aa  66.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  24.6 
 
 
319 aa  65.5  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  24.42 
 
 
348 aa  64.3  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  21.93 
 
 
363 aa  64.3  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  24.39 
 
 
387 aa  63.9  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  24.78 
 
 
350 aa  63.5  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  24.78 
 
 
341 aa  62.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  24.35 
 
 
326 aa  62.4  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41967  predicted protein  23.14 
 
 
235 aa  61.6  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.296814  normal  0.0690197 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  20.7 
 
 
373 aa  61.2  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  23.35 
 
 
322 aa  60.8  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  23.91 
 
 
330 aa  60.1  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  23.85 
 
 
326 aa  59.7  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06694  Chromosome transmission fidelity protein 18 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C1D3]  28.83 
 
 
993 aa  58.5  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0563098 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  25 
 
 
327 aa  57.8  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15652  predicted protein  21.21 
 
 
894 aa  57.4  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.37378  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  24.65 
 
 
318 aa  57  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  24.37 
 
 
330 aa  57  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0076  ATPase  22.57 
 
 
429 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.872704 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  22.94 
 
 
316 aa  56.6  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  23.71 
 
 
342 aa  55.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10917  conserved hypothetical protein  24.55 
 
 
1127 aa  54.3  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  25.65 
 
 
305 aa  54.3  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1334  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  20.15 
 
 
421 aa  52.8  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  21.85 
 
 
369 aa  51.6  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1233  replication factor C small subunit 2  21.72 
 
 
336 aa  52  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  22.45 
 
 
940 aa  48.1  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1988  replication factor C small subunit 2  22.66 
 
 
341 aa  47  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135207  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0435  DNA polymerase III subunits gamma and tau  21.98 
 
 
606 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.853663  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1572  AAA ATPase central domain protein  24.2 
 
 
396 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43936  predicted protein  25 
 
 
1223 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  20.35 
 
 
567 aa  45.4  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0857  DNA polymerase III subunits gamma and tau  21.65 
 
 
681 aa  45.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0934  ATPase  21.9 
 
 
396 aa  43.9  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.894546  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1879  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  20.37 
 
 
569 aa  43.9  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>