More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2089 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  100 
 
 		 336 aa  669    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  87.8 
 
 		 336 aa  590  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  86.01 
 
 		 336 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  76.36 
 
 		 330 aa  512  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  73.65 
 
 		 336 aa  512  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  53.09 
 
 		 328 aa  329  5.0000000000000004e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  50.77 
 
 		 322 aa  322  8e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  51.7 
 
 		 328 aa  316  3e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  47.08 
 
 		 328 aa  310  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  49.84 
 
 		 328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  50.31 
 
 		 326 aa  298  6e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  48.05 
 
 		 328 aa  299  6e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  46.42 
 
 		 336 aa  290  2e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  45.62 
 
 		 329 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  47.58 
 
 		 328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  45.32 
 
 		 329 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  45.82 
 
 		 327 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  45.34 
 
 		 332 aa  278  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  41.57 
 
 		 327 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  41.57 
 
 		 327 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  41.41 
 
 		 327 aa  272  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  45 
 
 		 335 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  44.06 
 
 		 335 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  42.55 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  40.06 
 
 		 321 aa  240  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0010  AAA ATPase central domain protein  38.11 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283039 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  38.26 
 
 		 326 aa  160  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  30.7 
 
 		 391 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  32.53 
 
 		 332 aa  149  8e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  30.5 
 
 		 348 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  37.73 
 
 		 322 aa  143  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  30.79 
 
 		 324 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  40.85 
 
 		 366 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  32.31 
 
 		 335 aa  139  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  28.37 
 
 		 360 aa  135  7.000000000000001e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  31.66 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  38.46 
 
 		 322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  34.4 
 
 		 369 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  30.25 
 
 		 338 aa  129  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  37.3 
 
 		 387 aa  129  9.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  36.76 
 
 		 390 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  30.41 
 
 		 367 aa  125  8.000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  37.13 
 
 		 388 aa  125  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  26.56 
 
 		 370 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  36.22 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  35.53 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  33.62 
 
 		 369 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  34.98 
 
 		 352 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  29.45 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  30.54 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  34.34 
 
 		 239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  34.55 
 
 		 332 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  34.55 
 
 		 332 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  38.54 
 
 		 405 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  30.45 
 
 		 388 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  32.03 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  32.03 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  34.02 
 
 		 425 aa  114  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  26.8 
 
 		 363 aa  113  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  37.57 
 
 		 355 aa  113  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  31.92 
 
 		 459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  39.88 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  34.93 
 
 		 401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  32.39 
 
 		 451 aa  110  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  30.55 
 
 		 419 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  32.17 
 
 		 427 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  31.69 
 
 		 493 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  30.04 
 
 		 430 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  30.4 
 
 		 477 aa  106  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1253  cell division protein FtsH  31.45 
 
 		 613 aa  105  1e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4255  AAA ATPase, central region  36.32 
 
 		 688 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  32.08 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  34.93 
 
 		 393 aa  104  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2457  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.71 
 
 		 615 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  33.86 
 
 		 468 aa  103  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3258  AAA ATPase central domain protein  36.1 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69388  normal  0.0190721 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19161  cell division protein FtsH3  36.55 
 
 		 625 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4998  AAA ATPase central domain protein  36.54 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.2 
 
 		 673 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  34.95 
 
 		 499 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.2 
 
 		 673 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.95 
 
 		 608 aa  100  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0830  cell division protein FtsH3  36.18 
 
 		 624 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  37.84 
 
 		 703 aa  100  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  29.95 
 
 		 424 aa  100  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.95 
 
 		 604 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  32.13 
 
 		 650 aa  100  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0559  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.11 
 
 		 801 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.57 
 
 		 607 aa  100  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  31.71 
 
 		 638 aa  100  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0353  peptidase M41, FtsH  36.41 
 
 		 575 aa  99.8  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.209104  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1152  peptidase M41, FtsH  32.61 
 
 		 599 aa  99.8  6e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10341  cell division protein FtsH4  36.41 
 
 		 575 aa  99.8  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194795  hitchhiker  0.000108584 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05588  intermembrane space AAA protease IAP-1 (AFU_orthologue; AFUA_4G11530)  38.82 
 
 		 784 aa  99.4  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  32.13 
 
 		 659 aa  99.4  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.51 
 
 		 636 aa  99.8  7e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  32.68 
 
 		 658 aa  99.4  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.77 
 
 		 685 aa  99.4  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  32.68 
 
 		 660 aa  99.4  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>