More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1113 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 473 aa  946    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  66.45 
 
 		 474 aa  608  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  63.34 
 
 		 465 aa  571  1e-161  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  61.9 
 
 		 466 aa  551  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  60.9 
 
 		 480 aa  549  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  58.51 
 
 		 482 aa  527  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  58.02 
 
 		 462 aa  513  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  60.31 
 
 		 456 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  60.31 
 
 		 456 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  60.09 
 
 		 456 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  58.11 
 
 		 457 aa  497  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5703  FAD dependent oxidoreductase  56.01 
 
 		 472 aa  472  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  57.71 
 
 		 460 aa  457  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  53.95 
 
 		 460 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  53.29 
 
 		 460 aa  448  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  53.29 
 
 		 460 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  50.23 
 
 		 463 aa  385  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  50.44 
 
 		 466 aa  381  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  48.3 
 
 		 472 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  48.71 
 
 		 466 aa  357  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  46.02 
 
 		 462 aa  355  6.999999999999999e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  44.03 
 
 		 460 aa  340  4e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  45 
 
 		 460 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  47.8 
 
 		 462 aa  327  3e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  41.99 
 
 		 475 aa  298  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1702  hypothetical protein  43.28 
 
 		 468 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19770  hypothetical protein  42.82 
 
 		 468 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  44.14 
 
 		 464 aa  293  6e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  42.14 
 
 		 454 aa  286  5e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2675  FAD dependent oxidoreductase  40.77 
 
 		 468 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  40.64 
 
 		 475 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0875  FAD dependent oxidoreductase  39.74 
 
 		 476 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.120395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0905  FAD dependent oxidoreductase  39.52 
 
 		 468 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4303  FAD dependent oxidoreductase  39.95 
 
 		 468 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  37.33 
 
 		 469 aa  263  4e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3244  FAD dependent oxidoreductase  35.25 
 
 		 491 aa  237  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3143  FAD dependent oxidoreductase  36.06 
 
 		 491 aa  236  6e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0879  FAD dependent oxidoreductase  35.16 
 
 		 491 aa  225  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3678  hypothetical protein  35.04 
 
 		 489 aa  223  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2910  hypothetical protein  34.45 
 
 		 493 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0699  FAD dependent oxidoreductase  35.41 
 
 		 456 aa  204  4e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  34.83 
 
 		 464 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  34.97 
 
 		 443 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  32.8 
 
 		 473 aa  189  7e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  34.5 
 
 		 468 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  34.5 
 
 		 468 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  31.44 
 
 		 464 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  35.09 
 
 		 463 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  33.92 
 
 		 463 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  33.7 
 
 		 463 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 471 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  29.8 
 
 		 453 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 		 477 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  33.7 
 
 		 463 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  34.42 
 
 		 521 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  34.23 
 
 		 462 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  33.48 
 
 		 463 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  33.56 
 
 		 491 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  28.7 
 
 		 470 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  35.68 
 
 		 470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  33.78 
 
 		 462 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  32.89 
 
 		 465 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  32.88 
 
 		 462 aa  172  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  33.12 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  32 
 
 		 463 aa  171  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  32.23 
 
 		 465 aa  170  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39720  putative amino acid oxidase  34.15 
 
 		 466 aa  170  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 496 aa  170  7e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  35.98 
 
 		 473 aa  168  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  33.04 
 
 		 462 aa  167  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  33.48 
 
 		 462 aa  166  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  31.86 
 
 		 466 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  30.5 
 
 		 482 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2743  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  31.46 
 
 		 455 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0233618  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  30.27 
 
 		 465 aa  159  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  32.89 
 
 		 480 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04889  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 		 466 aa  157  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2277  FAD dependent oxidoreductase  32.86 
 
 		 486 aa  157  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  30.11 
 
 		 472 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2808  oxidoreductase, putative  32.11 
 
 		 455 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 		 483 aa  156  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  30.64 
 
 		 464 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 463 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4628  FAD dependent oxidoreductase  30.61 
 
 		 477 aa  154  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  30.84 
 
 		 482 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 		 486 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  34.08 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0889  FAD dependent oxidoreductase  30.82 
 
 		 487 aa  150  3e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  30.07 
 
 		 465 aa  150  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 443 aa  149  8e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  30.82 
 
 		 494 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2235  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 		 447 aa  143  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.622258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  29.11 
 
 		 470 aa  143  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 		 428 aa  142  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5828  FAD dependent oxidoreductase  30.82 
 
 		 494 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5032  FAD dependent oxidoreductase  30.82 
 
 		 494 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3646  hypothetical protein  33.72 
 
 		 469 aa  140  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0271589 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06960  hypothetical protein  33.16 
 
 		 429 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>