More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0850 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0850  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 268 aa  543  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0841  GntR family transcriptional regulator  64.88 
 
 		 246 aa  310  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0553  GntR domain protein  28.89 
 
 		 253 aa  93.6  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  28.95 
 
 		 240 aa  89.4  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  31.19 
 
 		 223 aa  88.6  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  31.72 
 
 		 229 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 233 aa  86.7  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  30.8 
 
 		 238 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  32.11 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  27.4 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  25.89 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  29.57 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  31.5 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  26.43 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0356  GntR domain-containing protein  31.33 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.15 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5854  GntR domain protein  30.29 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.712492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  27.78 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.36 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  28.02 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2418  GntR domain-containing protein  29.71 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.211481 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  29.6 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  29.71 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  32.93 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  28.02 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  29.39 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  28.38 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  29.27 
 
 		 254 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  28.5 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  25.44 
 
 		 239 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  33.14 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  29.07 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  29.01 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  30.73 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  28.4 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0410  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  30.95 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  28.97 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  28.17 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  30.18 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  29.02 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  30.2 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0353  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6391  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.61 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5347  transcriptional regulator GntR family  28.66 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  29.55 
 
 		 226 aa  75.1  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1972  putative pyruvate dehydrogenase complex repressor  33.64 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0510687  normal  0.668194 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  26.99 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0272  GntR domain protein  29.91 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.554263 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  26.72 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0036  GntR domain-containing protein  27.4 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2592  GntR domain protein  34.32 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13093  normal  0.0457135 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1666  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  29.11 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  26.01 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  23.85 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03462  DNA-binding transcriptional repressor  26.44 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0101  GntR domain protein  26.44 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3816  DNA-binding transcriptional repressor LldR  26.44 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4977  DNA-binding transcriptional repressor LldR  26.44 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2218  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.52 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0409255  hitchhiker  0.007316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03413  hypothetical protein  26.44 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0104  DNA-binding transcriptional repressor LldR  26.44 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3941  DNA-binding transcriptional repressor LldR  26.44 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0375  GntR domain protein  31.53 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.400874  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4030  DNA-binding transcriptional repressor LldR  27.2 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  27.43 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0739  GntR domain protein  29.5 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0933877  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3829  GntR domain-containing protein  26.13 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.710957  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1537  putative GntR domain protein  24.62 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  33.97 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4108  DNA-binding transcriptional repressor LldR  27.66 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 226 aa  72  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  28.74 
 
 		 253 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2365  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0740393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3731  GntR domain protein  27.73 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  28.09 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 215 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3408  GntR domain protein  27.73 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  34.43 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  29.09 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  26.48 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4017  DNA-binding transcriptional repressor LldR  26.27 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  29.36 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4079  DNA-binding transcriptional repressor LldR  26.27 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  26.99 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4384  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3689  GntR domain-containing protein  35.77 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  26.76 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  25.58 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4471  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.788198 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3972  DNA-binding transcriptional repressor LldR  26.27 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.773658 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>