More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2625 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2625  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
393 aa  775    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0620146  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1292  FAD dependent oxidoreductase  76.03 
 
 
395 aa  485  1e-136  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3020  FAD dependent oxidoreductase  47.83 
 
 
367 aa  301  9e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.393882  normal  0.050284 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0636  FAD dependent oxidoreductase  46.45 
 
 
433 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.188486  normal  0.91294 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  32.16 
 
 
387 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  31.56 
 
 
392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 
382 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 
381 aa  127  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  23.7 
 
 
390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
385 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 
382 aa  120  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  29.76 
 
 
388 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 
385 aa  116  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  28.18 
 
 
386 aa  114  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 
398 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 
398 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 
378 aa  113  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 
398 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3929  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 
386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371488  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 
399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 
385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  24.73 
 
 
383 aa  110  5e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 
388 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3849  FAD dependent oxidoreductase  30.41 
 
 
404 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.121432  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 
496 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 
401 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 
385 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  24.66 
 
 
373 aa  103  5e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 
500 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 
500 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  24.18 
 
 
385 aa  101  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 
387 aa  99.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  24.01 
 
 
395 aa  98.6  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3845  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 
381 aa  98.6  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  26.97 
 
 
385 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1168  FAD dependent oxidoreductase  24.13 
 
 
372 aa  97.1  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0222  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
365 aa  97.1  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000376254  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5513  FAD dependent oxidoreductase  30.4 
 
 
398 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.225549 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 
394 aa  93.6  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 
376 aa  93.2  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 
392 aa  92.8  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 
395 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 
492 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 
394 aa  90.9  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 
378 aa  89  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 
387 aa  88.2  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 
394 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 
394 aa  87.8  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 
401 aa  87  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  28.3 
 
 
394 aa  87  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  26.13 
 
 
424 aa  85.9  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 
400 aa  85.5  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 
376 aa  85.5  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  29.28 
 
 
392 aa  85.5  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 
394 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  25.62 
 
 
391 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2797  d-amino-acid dehydrogenase  28.37 
 
 
419 aa  83.2  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337327  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 
375 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  28.61 
 
 
378 aa  82.8  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  23.56 
 
 
378 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4757  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 
390 aa  82  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 
375 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  24.22 
 
 
372 aa  80.9  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 
375 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2070  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 
392 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5615  D-amino-acid dehydrogenase  26.81 
 
 
417 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133637  normal  0.925695 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 
806 aa  80.1  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  27.78 
 
 
430 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 
378 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  27.59 
 
 
430 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0919  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 
837 aa  79  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5323  D-amino-acid dehydrogenase  26.81 
 
 
417 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.161486 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 
375 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 
444 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5235  D-amino-acid dehydrogenase  26.81 
 
 
417 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288943  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 
424 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2597  FAD dependent oxidoreductase  26.16 
 
 
415 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 
375 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 
433 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  27.44 
 
 
375 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 
433 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 
444 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  26.92 
 
 
424 aa  77.8  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  27.59 
 
 
430 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5016  FAD dependent oxidoreductase  26.08 
 
 
424 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.208645  normal  0.555113 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 
442 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  25.77 
 
 
381 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  23.99 
 
 
369 aa  77  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 
425 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 
424 aa  77.4  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2994  FAD dependent oxidoreductase  28.18 
 
 
390 aa  76.6  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 
433 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 
397 aa  76.6  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 
425 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 
375 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 
439 aa  76.3  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 
433 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  25.4 
 
 
819 aa  75.9  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 
425 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.476626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>