More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4853 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 621 aa  1232    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  54.02 
 
 		 568 aa  520  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  47.59 
 
 		 627 aa  500  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  45.37 
 
 		 534 aa  395  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  44.59 
 
 		 532 aa  378  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  42.72 
 
 		 526 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  45.62 
 
 		 559 aa  356  6.999999999999999e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  37.44 
 
 		 918 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  41.5 
 
 		 657 aa  335  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  42.63 
 
 		 674 aa  312  9e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9038  integral membrane protein MviN  38.79 
 
 		 899 aa  307  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  37.64 
 
 		 533 aa  301  2e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  37.2 
 
 		 1217 aa  300  4e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  38.66 
 
 		 535 aa  284  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5093  integral membrane protein MviN  38.12 
 
 		 580 aa  277  4e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000635167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4575  integral membrane protein MviN  37.22 
 
 		 592 aa  272  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0630035 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  34.07 
 
 		 610 aa  266  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4797  integral membrane protein MviN  36.72 
 
 		 665 aa  252  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6435  integral membrane protein MviN  35.42 
 
 		 546 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  39.22 
 
 		 570 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  33.64 
 
 		 552 aa  239  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  35.36 
 
 		 521 aa  239  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  32.42 
 
 		 1219 aa  223  9e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  34.57 
 
 		 580 aa  219  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37920  integral membrane protein MviN  31.46 
 
 		 565 aa  203  6e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  31.09 
 
 		 552 aa  201  3.9999999999999996e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  29.29 
 
 		 1219 aa  200  5e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6064  integral membrane protein MviN  33.85 
 
 		 1224 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342364 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4159  integral membrane protein MviN  33.27 
 
 		 708 aa  195  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3926  integral membrane protein MviN  32.6 
 
 		 715 aa  193  7e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0842  integral membrane protein MviN  32.83 
 
 		 1209 aa  192  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  34.2 
 
 		 560 aa  191  4e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  31.85 
 
 		 1184 aa  188  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5489  integral membrane protein MviN  32.75 
 
 		 1184 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.250379 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  34.01 
 
 		 1652 aa  184  5.0000000000000004e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5776  integral membrane protein MviN  32.75 
 
 		 1168 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24398  normal  0.429874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5400  integral membrane protein MviN  32.75 
 
 		 1263 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23360  integral membrane protein MviN  31.53 
 
 		 614 aa  180  7e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0056  putative integral membrane protein MviN  29.21 
 
 		 598 aa  175  1.9999999999999998e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1446  hypothetical protein  30.45 
 
 		 575 aa  167  8e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3365  virulence factor MVIN family protein  30.33 
 
 		 569 aa  163  7e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09620  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  29.02 
 
 		 535 aa  162  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  0.0121961 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2117  virulence factor MVIN family protein  28.68 
 
 		 700 aa  158  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0993652  normal  0.569404 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  26.33 
 
 		 521 aa  152  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  30 
 
 		 563 aa  151  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  29.31 
 
 		 517 aa  150  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31860  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  29.64 
 
 		 579 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.683518  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  26.99 
 
 		 521 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  31.2 
 
 		 535 aa  141  3.9999999999999997e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1051  integral membrane protein MviN  25.5 
 
 		 525 aa  136  9e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000233092  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  27.91 
 
 		 511 aa  136  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  25.64 
 
 		 521 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  26.13 
 
 		 529 aa  135  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0675  integral membrane protein MviN  25.52 
 
 		 549 aa  134  6.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136729  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  29.73 
 
 		 512 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  26.58 
 
 		 511 aa  133  9e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  30 
 
 		 543 aa  133  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  27.03 
 
 		 511 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2834  putative virulence factor  31.34 
 
 		 534 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00622591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  29.11 
 
 		 513 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  29.11 
 
 		 513 aa  132  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  27.8 
 
 		 511 aa  130  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  27.05 
 
 		 511 aa  130  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  26.05 
 
 		 526 aa  130  8.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  29.24 
 
 		 512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  29.24 
 
 		 512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  26.3 
 
 		 524 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  26.3 
 
 		 524 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  26.3 
 
 		 524 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  26.3 
 
 		 524 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  26.3 
 
 		 524 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  28.1 
 
 		 513 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  29.21 
 
 		 512 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  28.08 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  26.25 
 
 		 542 aa  127  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  28.94 
 
 		 513 aa  127  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0216  integral membrane protein MviN  27.18 
 
 		 533 aa  127  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  29.37 
 
 		 512 aa  127  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  27.85 
 
 		 512 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  26.59 
 
 		 511 aa  127  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  28.08 
 
 		 521 aa  127  8.000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  26.15 
 
 		 511 aa  127  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  27.86 
 
 		 545 aa  126  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  26.8 
 
 		 534 aa  126  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  29.4 
 
 		 512 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3955  integral membrane protein MviN  28.3 
 
 		 514 aa  125  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0939  virulence factor MVIN family protein  27.91 
 
 		 544 aa  125  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  25.93 
 
 		 511 aa  125  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  25.93 
 
 		 511 aa  125  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  25.93 
 
 		 511 aa  125  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  25.93 
 
 		 511 aa  125  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  28.97 
 
 		 526 aa  125  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  25.49 
 
 		 511 aa  124  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  25.49 
 
 		 511 aa  124  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  25.49 
 
 		 511 aa  124  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  25.49 
 
 		 511 aa  124  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  25.49 
 
 		 511 aa  124  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0132  integral membrane protein MviN  26.97 
 
 		 528 aa  124  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  28.57 
 
 		 521 aa  124  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  26.42 
 
 		 511 aa  124  6e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>