More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2844 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  62.64 
 
 		 731 aa  806    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  100 
 
 		 738 aa  1426    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  45.27 
 
 		 740 aa  561  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  44.96 
 
 		 733 aa  546  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  45.66 
 
 		 717 aa  523  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  46.85 
 
 		 762 aa  503  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  40.39 
 
 		 805 aa  472  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  42.51 
 
 		 1308 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  39.45 
 
 		 766 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  37.93 
 
 		 710 aa  449  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  36.99 
 
 		 758 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  37.48 
 
 		 741 aa  406  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  37.08 
 
 		 796 aa  390  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  36.34 
 
 		 770 aa  388  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  38.2 
 
 		 724 aa  388  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.21 
 
 		 1095 aa  379  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  37.3 
 
 		 740 aa  375  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  36.4 
 
 		 1155 aa  365  1e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  37.57 
 
 		 839 aa  363  6e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  33.99 
 
 		 1013 aa  363  9e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  34.89 
 
 		 736 aa  361  2e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  39.39 
 
 		 743 aa  360  6e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  37.52 
 
 		 727 aa  357  5.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  34.12 
 
 		 751 aa  355  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  36.35 
 
 		 738 aa  353  7e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  33.33 
 
 		 769 aa  347  7e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  33.33 
 
 		 769 aa  347  7e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.11 
 
 		 738 aa  341  2.9999999999999998e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  39.09 
 
 		 783 aa  340  4e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  33.87 
 
 		 767 aa  340  7e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  33.87 
 
 		 767 aa  340  7e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  33.6 
 
 		 767 aa  339  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  36.57 
 
 		 761 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4195  MMPL domain-containing protein  35.59 
 
 		 953 aa  337  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  35.84 
 
 		 743 aa  335  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  30.12 
 
 		 997 aa  335  2e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  32.94 
 
 		 944 aa  333  6e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  34.96 
 
 		 738 aa  327  6e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  35.1 
 
 		 748 aa  326  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  35.1 
 
 		 754 aa  325  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  31.65 
 
 		 741 aa  318  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  29.65 
 
 		 730 aa  316  8e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  29.78 
 
 		 730 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  29.78 
 
 		 730 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  29.78 
 
 		 730 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  29.65 
 
 		 730 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  30.14 
 
 		 730 aa  315  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  36.72 
 
 		 757 aa  311  2.9999999999999997e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  29.78 
 
 		 730 aa  310  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  34.92 
 
 		 731 aa  306  7e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  28.88 
 
 		 730 aa  306  9.000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  29.42 
 
 		 730 aa  302  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  29.42 
 
 		 730 aa  301  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  33.59 
 
 		 778 aa  296  8e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  30.01 
 
 		 729 aa  291  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  34.18 
 
 		 737 aa  291  4e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  33.83 
 
 		 758 aa  282  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  36.81 
 
 		 709 aa  281  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  30.66 
 
 		 979 aa  273  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  32.28 
 
 		 749 aa  271  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  30.6 
 
 		 743 aa  272  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  30.52 
 
 		 983 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  30.52 
 
 		 983 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  30.08 
 
 		 978 aa  267  5e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  31.04 
 
 		 743 aa  259  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  31.35 
 
 		 968 aa  258  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  35.83 
 
 		 740 aa  258  4e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  30.25 
 
 		 966 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  30.84 
 
 		 735 aa  254  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  32.87 
 
 		 726 aa  254  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.67 
 
 		 740 aa  254  5.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  31.06 
 
 		 781 aa  253  9.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  34.7 
 
 		 750 aa  253  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  33.33 
 
 		 717 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  32.59 
 
 		 846 aa  248  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  36.72 
 
 		 842 aa  243  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  35.99 
 
 		 743 aa  241  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  35.34 
 
 		 732 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1311  MMPL domain protein  42.05 
 
 		 773 aa  235  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  32.89 
 
 		 734 aa  235  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  31.59 
 
 		 711 aa  236  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  25.41 
 
 		 829 aa  235  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  25.41 
 
 		 829 aa  235  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0208  MMPL domain-containing protein  33.29 
 
 		 734 aa  232  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46376 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  32.78 
 
 		 751 aa  231  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  34.25 
 
 		 724 aa  229  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  30.68 
 
 		 743 aa  229  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  32.54 
 
 		 731 aa  229  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  32.56 
 
 		 741 aa  228  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5544  MmpL family membrane protein  32.32 
 
 		 632 aa  228  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0167345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  30.98 
 
 		 752 aa  227  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  31.53 
 
 		 723 aa  225  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  28.8 
 
 		 760 aa  226  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11170  transmembrane transport protein mmpL13b  36.14 
 
 		 500 aa  225  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.356849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  32.52 
 
 		 729 aa  224  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  29.65 
 
 		 736 aa  222  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  34.1 
 
 		 761 aa  221  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  27.51 
 
 		 704 aa  220  7.999999999999999e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.41 
 
 		 1382 aa  220  8.999999999999998e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  32.1 
 
 		 718 aa  219  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>