145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5152 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5152  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 482 aa  980    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  50.12 
 
 		 457 aa  414  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  46.61 
 
 		 451 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3182  extracellular solute-binding protein family 1  49.07 
 
 		 464 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.145583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  44.78 
 
 		 448 aa  402  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3587  extracellular solute-binding protein  43.19 
 
 		 447 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.69287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  46.57 
 
 		 462 aa  388  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2337  ABC-type glucosylglycerol transport system substrate-binding protein  46.97 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176838  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5758  extracellular solute-binding protein family 1  45.97 
 
 		 498 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  0.192043 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01750  carbohydrate-binding protein  46.03 
 
 		 457 aa  367  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110954  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3237  extracellular solute-binding protein family 1  41.29 
 
 		 464 aa  353  4e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4648  extracellular solute-binding protein family 1  41.28 
 
 		 448 aa  348  1e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260895 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1180  extracellular solute-binding protein  38.33 
 
 		 485 aa  279  7e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0387  extracellular solute-binding protein family 1  36.21 
 
 		 453 aa  259  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0355  extracellular solute-binding protein family 1  35.25 
 
 		 453 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1946  extracellular solute-binding protein  35.7 
 
 		 449 aa  250  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3307  extracellular solute-binding protein  36.1 
 
 		 449 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4345  extracellular solute-binding protein  36.62 
 
 		 450 aa  246  6.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1652  putative solute-binding protein 1 family  35.37 
 
 		 452 aa  245  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182094  hitchhiker  0.00000465499 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2910  ABC alpha-glucoside transporter extracellular solute-binding protein, family 1  36.92 
 
 		 452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.320115 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0292  extracellular solute-binding protein  36.14 
 
 		 452 aa  243  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1147  extracellular solute-binding protein  36.03 
 
 		 544 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  35.25 
 
 		 432 aa  239  9e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2873  ABC alpha-glucoside transporter, perplasmic substrate-binding protein  35.04 
 
 		 450 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182804  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2855  extracellular solute-binding protein  35.61 
 
 		 451 aa  238  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1519  extracellular solute-binding protein  35.04 
 
 		 450 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  0.200847 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0785  ABC transporter substrate binding protein (alpha-glucoside)  35.1 
 
 		 452 aa  238  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  33.47 
 
 		 440 aa  216  5e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  35.2 
 
 		 424 aa  215  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26130  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.85 
 
 		 448 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0719829  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 455 aa  184  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  32.16 
 
 		 444 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  30.2 
 
 		 436 aa  154  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  29.38 
 
 		 466 aa  146  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  29.06 
 
 		 442 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  29.97 
 
 		 447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0402  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 447 aa  108  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2534  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 		 404 aa  92.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.478006  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.21 
 
 		 435 aa  73.9  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  30.41 
 
 		 442 aa  72  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2914  extracellular solute-binding protein family 1  27.12 
 
 		 440 aa  63.2  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5673  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0285739  normal  0.0925972 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  31.31 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 435 aa  60.1  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  23.44 
 
 		 495 aa  59.7  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  27.56 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  26.44 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.71 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  24.9 
 
 		 441 aa  57  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  32.98 
 
 		 422 aa  56.2  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  24.13 
 
 		 435 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3815  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 440 aa  55.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.725217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  27.04 
 
 		 424 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 		 493 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  21.69 
 
 		 451 aa  55.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 452 aa  54.3  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  24.04 
 
 		 434 aa  52.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 415 aa  53.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  21.83 
 
 		 417 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  22.6 
 
 		 433 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 427 aa  52.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  24.48 
 
 		 428 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  21.88 
 
 		 408 aa  50.8  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2265  extracellular solute-binding protein family 1  27.06 
 
 		 418 aa  50.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  27.18 
 
 		 423 aa  50.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2999  extracellular solute-binding protein  21.84 
 
 		 419 aa  50.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662901  hitchhiker  0.0000395876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1941  extracellular solute-binding protein family 1  21.66 
 
 		 487 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.948884  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1515  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0791  extracellular solute-binding protein family 1  28.91 
 
 		 399 aa  49.7  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6314  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.619662 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  24.47 
 
 		 442 aa  49.3  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6972  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.780279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  28.42 
 
 		 410 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 445 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  21.01 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  30.53 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  30.53 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1956  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  29.24 
 
 		 417 aa  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318288  normal  0.222736 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  26.85 
 
 		 441 aa  48.5  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  21.57 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2102  periplasmic protein  30.25 
 
 		 447 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.502645  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 		 448 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3469  extracellular solute-binding protein family 1  28.92 
 
 		 446 aa  48.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0184  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 		 450 aa  47.8  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 		 434 aa  47.4  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1792  extracellular solute-binding protein  63.64 
 
 		 462 aa  47.4  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  27.7 
 
 		 461 aa  47  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2342  extracellular solute-binding protein  30.09 
 
 		 477 aa  47  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.936887  normal  0.0125511 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  27.7 
 
 		 461 aa  46.6  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5528  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.83 
 
 		 485 aa  46.6  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1001  extracellular solute-binding protein family 1  22.61 
 
 		 427 aa  46.6  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.628257  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  24.47 
 
 		 427 aa  46.6  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  21.21 
 
 		 452 aa  46.2  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4547  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.909678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0573  extracellular solute-binding protein  60.61 
 
 		 460 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4209  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 419 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>