More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4088 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4088  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 275 aa  546  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.855439  hitchhiker  0.000570848 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2388  transcriptional regulator, IclR family  67.77 
 
 		 267 aa  340  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000136805  decreased coverage  0.000110172 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  36.61 
 
 		 270 aa  136  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  37.97 
 
 		 254 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  37.1 
 
 		 266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 264 aa  108  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  34.4 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1725  IclR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 279 aa  105  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200124  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0559  regulatory proteins, IclR  32.41 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  32.02 
 
 		 248 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2824  transcriptional regulator, IclR family  34.39 
 
 		 260 aa  99  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00611258  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  33.07 
 
 		 253 aa  97.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  33.07 
 
 		 259 aa  98.2  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4896  transcriptional regulator, IclR family  31.75 
 
 		 256 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  34.26 
 
 		 264 aa  95.1  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 267 aa  93.6  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  32.59 
 
 		 259 aa  93.6  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 260 aa  89.7  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2285  transcriptional regulator  29.08 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15210  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 257 aa  87  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  31.48 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4083  transcriptional regulator, IclR family  30.95 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1675  regulatory proteins, IclR  30.67 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1725  regulatory proteins, IclR  30.67 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1741  regulatory proteins, IclR  30.67 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  31.37 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  32 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  31.36 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  28.26 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  28.99 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0434  transcriptional regulator, IclR family  32.02 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 258 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  30.35 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0531  regulatory protein, IclR  30.59 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3485  IclR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 276 aa  75.5  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 238 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  28.69 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  30.84 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  30.84 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  29.29 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  26.67 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  30.09 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  26.05 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  25.58 
 
 		 250 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  30.09 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 269 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 269 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 269 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3424  transcriptional regulator, IclR family  29.67 
 
 		 272 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  26.73 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1491  IclR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1811  IclR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  30.04 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0797  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  30.69 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  29.81 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4100  IclR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2063  transcriptional regulator IclR  29.41 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0428372  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2114  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  30.69 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.247685  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0480  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  30.2 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0382  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  30.2 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  25.12 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  30.32 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  28.96 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3524  transcriptional regulator, IclR family  31.97 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  25.59 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3106  IclR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184655 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  27.19 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1955  IclR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  26.01 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  26.77 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  29.85 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3913  transcriptional regulator, IclR family  25.47 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 286 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>