More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1799 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1799  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 		 202 aa  392  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446245  normal  0.0519326 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  56.72 
 
 		 141 aa  127  9.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  39.5 
 
 		 201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  41.41 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  38.66 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  30.88 
 
 		 230 aa  91.3  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  32.88 
 
 		 226 aa  86.3  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  35.38 
 
 		 189 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5097  signal-transduction protein  35.38 
 
 		 189 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5185  signal-transduction protein  35.38 
 
 		 189 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254661  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  36.64 
 
 		 219 aa  84.7  7e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.63 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  28.28 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  31.16 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  34.2 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  35.53 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  34.63 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  35.26 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  30.94 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  34.4 
 
 		 880 aa  78.6  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  34.19 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  36.67 
 
 		 348 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  31.98 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  37.21 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  31.31 
 
 		 232 aa  77.8  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  33.56 
 
 		 155 aa  77.4  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  31.9 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  34.12 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  35.06 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  32.73 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  30.4 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  32.26 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  37.98 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  32.57 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  37.98 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  35.77 
 
 		 769 aa  75.1  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  36.43 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  32 
 
 		 845 aa  75.1  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  40.16 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  32.6 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  32.79 
 
 		 226 aa  74.7  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  33.55 
 
 		 147 aa  74.3  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  33.04 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  35.77 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  41.54 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  33.55 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  34.35 
 
 		 138 aa  73.9  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  38.24 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  31.8 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  34.11 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  34.5 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  32.65 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  30.91 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  32.65 
 
 		 149 aa  72  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  34.88 
 
 		 863 aa  72  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  32.46 
 
 		 242 aa  72  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  34.88 
 
 		 863 aa  71.6  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  35.82 
 
 		 386 aa  71.6  0.000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  32.19 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  34.09 
 
 		 226 aa  71.2  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  31.01 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  38.28 
 
 		 903 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  31.11 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  31.5 
 
 		 873 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  29.65 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  32.69 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  32.88 
 
 		 154 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  34.54 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  33.83 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  31.25 
 
 		 907 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  28.25 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  30.53 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  34.81 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  38.28 
 
 		 903 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  32.58 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  35.77 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  33.04 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  29.73 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  30.53 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  32.61 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  33.59 
 
 		 688 aa  69.3  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  32.75 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  34.44 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  35.03 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  31.5 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  35.21 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.8 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  32.04 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  34.76 
 
 		 333 aa  68.9  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  31.29 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  31.95 
 
 		 904 aa  68.6  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  29.01 
 
 		 279 aa  68.6  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  32.45 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  35.21 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  34.59 
 
 		 277 aa  68.6  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  29.74 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  31.06 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  31.06 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>