More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_07661 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_07661  permease  100 
 
 		 358 aa  689    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0134  hypothetical protein  92.74 
 
 		 358 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07191  permease  58.24 
 
 		 359 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16391  permease  57.26 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1196  hypothetical protein  52.27 
 
 		 359 aa  311  2e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09331  permease  44.61 
 
 		 347 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09321  permease  45.19 
 
 		 347 aa  275  7e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1274  hypothetical protein  50.43 
 
 		 359 aa  267  2e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.094175  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10101  permease  43.02 
 
 		 347 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0873  hypothetical protein  44.57 
 
 		 347 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.475897  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  38.18 
 
 		 340 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0518  hypothetical protein  37.22 
 
 		 387 aa  230  3e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  37.46 
 
 		 344 aa  221  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  37.73 
 
 		 382 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  36.13 
 
 		 347 aa  205  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1078  protein of unknown function UPF0118  35.61 
 
 		 336 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  33.33 
 
 		 372 aa  195  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2670  protein of unknown function UPF0118  35.88 
 
 		 345 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3434  protein of unknown function UPF0118  35.88 
 
 		 345 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  32.68 
 
 		 379 aa  190  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  34.09 
 
 		 349 aa  176  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3369  protein of unknown function UPF0118  33.88 
 
 		 344 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2742  protein of unknown function UPF0118  33.88 
 
 		 344 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  unclonable  0.00000000268058 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0581  protein of unknown function UPF0118  47.4 
 
 		 357 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.96457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5210  protein of unknown function UPF0118  29.97 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  29.17 
 
 		 372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  27.41 
 
 		 364 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1195  hypothetical protein  29.82 
 
 		 329 aa  119  6e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1450  hypothetical protein  28.45 
 
 		 350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.996482  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  29.97 
 
 		 356 aa  117  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0956  hypothetical protein  29.18 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0392869 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  26.79 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0340  hypothetical protein  27.63 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1275  hypothetical protein  31.25 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1984  hypothetical protein  27.63 
 
 		 340 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372704  normal  0.185401 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16401  permease  28.31 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.199558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2262  hypothetical protein  24.31 
 
 		 381 aa  103  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141033  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3439  hypothetical protein  33.33 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.242294 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  27.79 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0915  hypothetical protein  30.51 
 
 		 346 aa  99.8  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  25.76 
 
 		 349 aa  98.6  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1508  protein of unknown function UPF0118  29.96 
 
 		 395 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  25.23 
 
 		 361 aa  94.4  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1787  protein of unknown function UPF0118  29.96 
 
 		 392 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190485  normal  0.0890558 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  27.74 
 
 		 349 aa  93.2  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1508  hypothetical protein  29.96 
 
 		 401 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0662165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4216  hypothetical protein  30.9 
 
 		 346 aa  92  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  27.22 
 
 		 388 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  28.7 
 
 		 341 aa  90.5  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  26.18 
 
 		 381 aa  89.4  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  24.61 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  24.92 
 
 		 373 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  24.61 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  24.61 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  24.92 
 
 		 348 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  24.61 
 
 		 348 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  24.92 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  26.67 
 
 		 368 aa  87.8  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  27.63 
 
 		 351 aa  87  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  24.3 
 
 		 361 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  24.3 
 
 		 361 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  22.56 
 
 		 402 aa  86.3  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  22.56 
 
 		 402 aa  86.3  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4585  putative transport protein/permease  28.16 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  35.8 
 
 		 357 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  24.93 
 
 		 529 aa  83.2  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  25.52 
 
 		 389 aa  82.8  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  23.36 
 
 		 361 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  26.56 
 
 		 351 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1905  hypothetical protein  22.52 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.358826 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  26.21 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  26.17 
 
 		 652 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  24.59 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  25.84 
 
 		 652 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  22.42 
 
 		 405 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  28.09 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  26.42 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1113  hypothetical protein  25.88 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0939063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2700  hypothetical protein  26.67 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0306531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  24.58 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  26.36 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2800  hypothetical protein  27.94 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0330256  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3110  protein of unknown function UPF0118  27.4 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2235  hypothetical protein  24.04 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.55122  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  24.64 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2675  hypothetical protein  28.5 
 
 		 391 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173775  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  24.22 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2711  hypothetical protein  28.5 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  24.21 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  25.86 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2556  protein of unknown function UPF0118  27.58 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  26.3 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  29.22 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  23.73 
 
 		 649 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  22.15 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  26.74 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1411  hypothetical protein  25.6 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  26.45 
 
 		 373 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  25.82 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  26.37 
 
 		 373 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>