More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5464 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1529  peptide chain release factor 3  66.67 
 
 		 540 aa  724    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.816656  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5464  peptide chain release factor 3  100 
 
 		 540 aa  1103    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.934757  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1338  peptide chain release factor 3  62.48 
 
 		 528 aa  663    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.476931 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4411  peptide chain release factor 3  59.15 
 
 		 541 aa  640    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0359  peptide chain release factor 3  62.34 
 
 		 542 aa  668    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1516  peptide chain release factor 3  86.92 
 
 		 545 aa  957    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1592  peptide chain release factor 3  63.79 
 
 		 527 aa  672    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1494  peptide chain release factor 3  86.92 
 
 		 545 aa  957    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1492  peptide chain release factor 3  86.92 
 
 		 569 aa  956    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.473522  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3212  peptide chain release factor 3  64.1 
 
 		 538 aa  703    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714231  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0346  peptide chain release factor 3  60.15 
 
 		 537 aa  647    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0191  peptide chain release factor 3  59.59 
 
 		 535 aa  634    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06080  peptide chain release factor 3  65.84 
 
 		 544 aa  696    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38845  normal  0.36917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1328  peptide chain release factor 3  92.55 
 
 		 556 aa  1016    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.693943  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2802  peptide chain release factor 3  64.89 
 
 		 521 aa  672    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4207  peptide chain release factor 3  55.15 
 
 		 544 aa  587  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0348722 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0079  small GTP-binding protein  54.72 
 
 		 523 aa  570  1e-161  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.125969  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5645  peptide chain release factor 3  51.2 
 
 		 538 aa  536  1e-151  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1279  peptide chain release factor 3  45.23 
 
 		 548 aa  462  1e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07361  peptide chain release factor 3  44.26 
 
 		 545 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.301095  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0780  peptide chain release factor 3  46.05 
 
 		 543 aa  461  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.474397  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07161  peptide chain release factor 3  44.18 
 
 		 545 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.651427  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2365  peptide chain release factor 3  45.32 
 
 		 556 aa  455  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.100255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2904  peptide chain release factor 3  44.32 
 
 		 542 aa  456  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.835611  normal  0.0349958 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3298  peptide chain release factor 3  45.56 
 
 		 540 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07181  peptide chain release factor 3  43.99 
 
 		 545 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.55147  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1843  peptide chain release factor 3  46.02 
 
 		 540 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0095  peptide chain release factor 3  45.61 
 
 		 555 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0663  peptide chain release factor 3  44.55 
 
 		 545 aa  452  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.635496  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07201  peptide chain release factor 3  45.61 
 
 		 555 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.577625  normal  0.0107792 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4549  peptide chain release factor 3  45.17 
 
 		 563 aa  449  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1056  peptide chain release factor 3  44.49 
 
 		 542 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448459 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1999  peptide chain release factor 3  45.22 
 
 		 539 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2024  peptide chain release factor 3  45.11 
 
 		 539 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2700  peptide chain release factor 3  43.35 
 
 		 583 aa  439  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1198  peptide chain release factor 3  46.14 
 
 		 548 aa  437  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07731  peptide chain release factor 3  44.19 
 
 		 555 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107568 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14191  peptide chain release factor 3  47.21 
 
 		 571 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0398  peptide chain release factor 3  43.33 
 
 		 532 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1704  peptide chain release factor 3  44.38 
 
 		 542 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3254  peptide chain release factor 3  45.04 
 
 		 529 aa  419  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000111312  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3596  peptide chain release factor 3  42.13 
 
 		 529 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.750333  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0328  peptide chain release factor 3  40.91 
 
 		 533 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1844  peptide chain release factor 3  44.07 
 
 		 541 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2968  peptide chain release factor 3  45.4 
 
 		 533 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.720802 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1764  peptide chain release factor 3  43.82 
 
 		 541 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2112  peptide chain release factor 3  43.89 
 
 		 541 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6925  peptide chain release factor 3  45.4 
 
 		 533 aa  415  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.209121  normal  0.303865 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1434  peptide chain release factor 3  41.01 
 
 		 539 aa  414  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157478  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1492  peptide chain release factor 3  44 
 
 		 567 aa  414  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4287  peptide chain release factor 3  45.62 
 
 		 533 aa  412  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3649  peptide chain release factor 3  42.72 
 
 		 528 aa  411  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2019  peptide chain release factor 3  43.69 
 
 		 542 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1737  peptide chain release factor 3  42.1 
 
 		 524 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804887 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13410  peptide chain release factor 3  41.98 
 
 		 527 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.898041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0882  peptide chain release factor 3  42.11 
 
 		 527 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1662  peptide chain release factor 3  42.88 
 
 		 533 aa  403  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.828617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1490  peptide chain release factor 3  41.98 
 
 		 535 aa  404  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000251643  hitchhiker  0.00000000120572 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2730  peptide chain release factor 3  44.44 
 
 		 524 aa  405  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.426753  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1202  peptide chain release factor 3  43.51 
 
 		 527 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3808  peptide chain release factor 3  44.47 
 
 		 538 aa  403  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4579  peptide chain release factor 3  41.89 
 
 		 527 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4253  peptide chain release factor 3  41.6 
 
 		 527 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.995333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0807  peptide chain release factor 3  41.03 
 
 		 527 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.986611  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3762  peptide chain release factor 3  45.4 
 
 		 539 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0113142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4306  peptide chain release factor 3  41.41 
 
 		 527 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.546945  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0872  peptide chain release factor 3  42.8 
 
 		 527 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1011  peptide chain release factor 3  42.39 
 
 		 528 aa  396  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5334  peptide chain release factor 3  42.8 
 
 		 533 aa  398  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490929  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27956  predicted protein  41.53 
 
 		 634 aa  397  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2819  peptide chain release factor 3  41.37 
 
 		 528 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3761  peptide chain release factor 3  42.18 
 
 		 531 aa  398  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.106529 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3219  peptide chain release factor 3  44.26 
 
 		 538 aa  395  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.76683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1680  peptide chain release factor 3  46.47 
 
 		 539 aa  396  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0890826  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3872  peptide chain release factor 3  42.18 
 
 		 531 aa  398  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0916  peptide chain release factor 3  43.12 
 
 		 527 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0920838  normal  0.271742 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1774  peptide chain release factor 3  40.34 
 
 		 530 aa  398  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119545  normal  0.691586 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0792  peptide chain release factor 3  41.56 
 
 		 527 aa  398  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735214  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1990  peptide chain release factor 3  41.15 
 
 		 526 aa  392  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.919735  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0380  peptide chain release factor 3  44.08 
 
 		 531 aa  395  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.864644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2027  peptide chain release factor 3  45.95 
 
 		 539 aa  394  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0583  peptide chain release factor 3  41.8 
 
 		 528 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.704110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2046  peptide chain release factor 3  43.88 
 
 		 531 aa  393  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.840556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0192  peptide chain release factor 3  41.37 
 
 		 527 aa  393  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2330  peptide chain release factor 3  43.94 
 
 		 535 aa  392  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3858  peptide chain release factor 3  43.71 
 
 		 547 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0422  peptide chain release factor 3  44.29 
 
 		 531 aa  395  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5808  peptide chain release factor 3  42.67 
 
 		 530 aa  395  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0592  peptide chain release factor 3  41.02 
 
 		 531 aa  395  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0581  peptide chain release factor 3  41.02 
 
 		 531 aa  395  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0116263  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1393  peptide chain release factor 3  41.75 
 
 		 524 aa  392  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263078  normal  0.346403 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0902  peptide chain release factor 3  42.8 
 
 		 541 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.779467  normal  0.296207 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0138  peptide chain release factor 3  40.62 
 
 		 526 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0935  peptide chain release factor 3  41.31 
 
 		 526 aa  392  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0968  peptide chain release factor 3  41.39 
 
 		 543 aa  389  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.977047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0970  peptide chain release factor 3  39.47 
 
 		 524 aa  389  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00550606  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3159  peptide chain release factor 3  45.64 
 
 		 541 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2337  peptide chain release factor 3  45.44 
 
 		 541 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.707548  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12250  peptide chain release factor 3  40.87 
 
 		 527 aa  392  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.882878  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1267  peptide chain release factor 3  43.04 
 
 		 504 aa  389  1e-107  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.551841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>