More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4610 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4154  hypothetical protein  44.17 
 
 
910 aa  733    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1713  hypothetical protein  45.61 
 
 
976 aa  785    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3725  hypothetical protein  44.85 
 
 
976 aa  785    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5395  aminotransferase, class III  46.83 
 
 
970 aa  830    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6010  hypothetical protein  47.42 
 
 
974 aa  786    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4934  hypothetical protein  46.27 
 
 
970 aa  811    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  45.82 
 
 
970 aa  795    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  47.3 
 
 
975 aa  803    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  47.42 
 
 
973 aa  822    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  71.59 
 
 
981 aa  1348    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4943  hypothetical protein  45.56 
 
 
966 aa  788    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.870078  hitchhiker  0.0000072077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  71.69 
 
 
981 aa  1350    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2095  hypothetical protein  77.72 
 
 
967 aa  1492    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.174405 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4205  hypothetical protein  48.02 
 
 
973 aa  825    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  71.69 
 
 
981 aa  1350    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4610  hypothetical protein  100 
 
 
977 aa  1961    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.102283  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  34.94 
 
 
978 aa  464  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  34.1 
 
 
994 aa  436  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  31.51 
 
 
1003 aa  418  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  29.84 
 
 
1018 aa  346  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  39.6 
 
 
1023 aa  325  2e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  40.38 
 
 
1016 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  39.02 
 
 
1049 aa  322  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  37 
 
 
1015 aa  300  6e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  37.69 
 
 
1015 aa  299  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5225  aminotransferase class-III  39.3 
 
 
427 aa  299  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2224  aminotransferase class-III  37.77 
 
 
434 aa  298  3e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  37.22 
 
 
1015 aa  296  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0414  aminotransferase  38.72 
 
 
416 aa  293  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_52110  hypothetical protein  40.34 
 
 
427 aa  292  3e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4438  aminotransferase class-III  37.88 
 
 
427 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0985724  normal  0.717239 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2538  aminotransferase class-III  37.14 
 
 
434 aa  288  4e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043195  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1165  aminotransferase, class III  38.37 
 
 
427 aa  286  1.0000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5426  aminotransferase class-III  38.06 
 
 
442 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341099  normal  0.107268 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3009  aminotransferase  39.44 
 
 
443 aa  282  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1796  aminotransferase class-III  36.45 
 
 
436 aa  280  9e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.904494  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1546  aminotransferase class-III  36.58 
 
 
448 aa  279  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.634671  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2916  aminotransferase class-III  36.1 
 
 
448 aa  275  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1377  aminotransferase  36.58 
 
 
429 aa  272  2.9999999999999997e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427783  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  37.19 
 
 
448 aa  271  5e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4354  aminotransferase  35.46 
 
 
427 aa  270  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1272  aminotransferase class-III  35.31 
 
 
424 aa  269  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0048  aminotransferase class-III  34.2 
 
 
458 aa  268  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3343  aminotransferase class-III  38.85 
 
 
413 aa  266  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.65062 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0067  aminotransferase class-III  35 
 
 
447 aa  266  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2403  aminotransferase class-III  34.68 
 
 
447 aa  265  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.634591  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2498  aminotransferase class-III  34.76 
 
 
446 aa  265  4e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3214  aminotransferase class-III  36.28 
 
 
433 aa  263  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1957  aminotransferase class-III  39.19 
 
 
436 aa  262  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.796788  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0312  aminotransferase  39.24 
 
 
436 aa  260  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5905  aminotransferase class-III  36.82 
 
 
465 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0982  aminotransferase class-III  36.19 
 
 
436 aa  241  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  33.49 
 
 
437 aa  234  4.0000000000000004e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  33.73 
 
 
428 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  31.62 
 
 
436 aa  214  7.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  33.33 
 
 
436 aa  206  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5089  aminotransferase class-III  34.78 
 
 
451 aa  205  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.447769  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0941  aminotransferase class-III  32.55 
 
 
431 aa  198  5.000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.224071  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4970  aminotransferase class-III  35.2 
 
 
431 aa  197  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.260445  normal  0.117498 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.67 
 
 
391 aa  195  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1030  aminotransferase class-III  31.49 
 
 
431 aa  194  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1896  aminotransferase class-III  32.27 
 
 
432 aa  194  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0311328 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  31.02 
 
 
445 aa  194  9e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  32.45 
 
 
427 aa  192  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1947  aminotransferase  31.16 
 
 
433 aa  190  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3669  aminotransferase class-III  31.88 
 
 
443 aa  189  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.445293  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5339  aminotransferase class-III  34.11 
 
 
437 aa  189  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0686  aminotransferase  31.71 
 
 
429 aa  188  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  32.75 
 
 
418 aa  188  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5803  aminotransferase class-III  32.26 
 
 
433 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.413013  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2993  aminotransferase class-III  33.01 
 
 
436 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4825  aminotransferase class-III  32.61 
 
 
446 aa  185  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00475157  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5409  aminotransferase class-III  31.88 
 
 
452 aa  184  7e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2104  aminotransferase class-III  31.65 
 
 
430 aa  184  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939975  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1757  aminotransferase  32.24 
 
 
425 aa  183  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.744583  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  29.51 
 
 
425 aa  183  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  30.52 
 
 
446 aa  183  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3362  aminotransferase class-III  31.65 
 
 
433 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5005  aminotransferase class-III  31.65 
 
 
433 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3380  aminotransferase class-III  31.11 
 
 
431 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.130996  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5282  aminotransferase class-III  31.67 
 
 
433 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4418  aminotransferase class-III  31.31 
 
 
433 aa  181  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0107565 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  29.47 
 
 
461 aa  181  9e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5114  aminotransferase class-III  31.91 
 
 
436 aa  180  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4936  aminotransferase class-III  31.31 
 
 
433 aa  180  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0665  aminotransferase  31.07 
 
 
433 aa  180  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.459907 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2675  aminotransferase  31.7 
 
 
433 aa  180  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  30.73 
 
 
419 aa  180  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0188  4-aminobutyrate aminotransferase  29.56 
 
 
425 aa  179  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0827  aminotransferase class-III  32.1 
 
 
422 aa  180  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  30.05 
 
 
440 aa  179  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.28 
 
 
398 aa  178  5e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  30.99 
 
 
426 aa  178  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  29.49 
 
 
425 aa  177  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07656  conserved hypothetical protein  29.83 
 
 
452 aa  177  8e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.346872  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3751  aminotransferase class-III  30.7 
 
 
448 aa  177  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3215  aminotransferase class-III  31.67 
 
 
436 aa  177  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26914  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  30.77 
 
 
393 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  30.75 
 
 
426 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0387  4-aminobutyrate aminotransferase  29.75 
 
 
450 aa  177  9.999999999999999e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0105989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>